More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0008 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 276 aa  543  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  49.65 
 
 		 288 aa  272  4.0000000000000004e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  49.64 
 
 		 279 aa  266  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2009  elongation factor Ts  48.77 
 
 		 288 aa  263  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3494  translation elongation factor Ts  46.95 
 
 		 278 aa  262  4.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000803049  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0404  elongation factor Ts  48.07 
 
 		 288 aa  260  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3036  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  46.38 
 
 		 278 aa  258  6e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00138132  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0378  elongation factor Ts  46.93 
 
 		 274 aa  256  2e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  48.25 
 
 		 288 aa  256  3e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  46.13 
 
 		 288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0049  translation elongation factor Ts  46.24 
 
 		 277 aa  251  1e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1647  elongation factor Ts  46.32 
 
 		 288 aa  250  2e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2352  elongation factor Ts  46.32 
 
 		 288 aa  247  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000872397  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4744  translation elongation factor Ts  44.09 
 
 		 277 aa  245  4.9999999999999997e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  47.83 
 
 		 292 aa  238  9e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  46.29 
 
 		 303 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  45.58 
 
 		 303 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  45.52 
 
 		 272 aa  233  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  47.29 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  44.44 
 
 		 278 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  46.4 
 
 		 277 aa  230  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  45.49 
 
 		 294 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  45.45 
 
 		 288 aa  228  6e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0883  translation elongation factor Ts  45.45 
 
 		 275 aa  228  7e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  44.93 
 
 		 293 aa  227  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  42.27 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  44.77 
 
 		 294 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  43.68 
 
 		 276 aa  225  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  46.57 
 
 		 293 aa  225  8e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  46.01 
 
 		 291 aa  224  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  43.93 
 
 		 278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  43.01 
 
 		 273 aa  218  7e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  42.96 
 
 		 310 aa  218  7.999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  43.8 
 
 		 290 aa  218  8.999999999999998e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  43.68 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  42.8 
 
 		 294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  44 
 
 		 293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  43.8 
 
 		 292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  44 
 
 		 293 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  42.86 
 
 		 278 aa  216  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  44.36 
 
 		 294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  44.36 
 
 		 293 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  44.36 
 
 		 293 aa  215  7e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  44.36 
 
 		 293 aa  215  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  44.36 
 
 		 293 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  44.36 
 
 		 293 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  44.36 
 
 		 293 aa  215  7e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  43.8 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  45.99 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  45.49 
 
 		 277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  42.55 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  43.8 
 
 		 291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5910  translation elongation factor Ts  43.88 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0273949  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  41.97 
 
 		 292 aa  212  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  43.27 
 
 		 292 aa  212  4.9999999999999996e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  44.86 
 
 		 312 aa  211  9e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  43.07 
 
 		 294 aa  209  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1048  elongation factor Ts  44.65 
 
 		 269 aa  209  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0760308  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  42.6 
 
 		 302 aa  209  5e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  41.97 
 
 		 293 aa  208  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  42.34 
 
 		 293 aa  208  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  42.96 
 
 		 291 aa  208  8e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  42.6 
 
 		 290 aa  208  9e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  41.61 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  44.04 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  38.13 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  45.13 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  42.6 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  42.6 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  44.09 
 
 		 275 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  42.6 
 
 		 295 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  42.6 
 
 		 295 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  42.6 
 
 		 295 aa  206  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  42.6 
 
 		 295 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  41.92 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  42.6 
 
 		 295 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  42.18 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  42.18 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  42.6 
 
 		 295 aa  206  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  42.18 
 
 		 293 aa  205  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  42.18 
 
 		 293 aa  205  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  42.18 
 
 		 293 aa  205  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  44 
 
 		 293 aa  205  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  44 
 
 		 293 aa  205  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  42.6 
 
 		 295 aa  204  9e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  40.21 
 
 		 303 aa  204  9e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  43.43 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  42.24 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  41.82 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  43.32 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  43.43 
 
 		 292 aa  203  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  43.43 
 
 		 292 aa  203  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0706  translation elongation factor Ts  43.9 
 
 		 290 aa  203  2e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000134038  unclonable  0.0000000259641 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  43.55 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  44.77 
 
 		 292 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  39.93 
 
 		 286 aa  203  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  44.77 
 
 		 292 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  43.79 
 
 		 310 aa  202  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  43.73 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0508  elongation factor Ts  41.67 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0459419  normal  0.717587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>