More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1416 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 275 aa  554  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06750  elongation factor Ts  60.65 
 
 		 278 aa  335  5.999999999999999e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00748724  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11200  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  60.79 
 
 		 282 aa  332  5e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  59.42 
 
 		 276 aa  330  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23600  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  58.42 
 
 		 279 aa  320  9.999999999999999e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.13025 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1385  elongation factor Ts  56.83 
 
 		 278 aa  317  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000279942 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1368  elongation factor Ts  57.19 
 
 		 278 aa  316  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0623033  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1005  translation elongation factor Ts  57.71 
 
 		 279 aa  309  4e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  56.52 
 
 		 278 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  56.57 
 
 		 276 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2506  elongation factor Ts  60.85 
 
 		 281 aa  305  8.000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.346339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1231  elongation factor Ts  56.83 
 
 		 275 aa  299  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442239  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1323  elongation factor Ts  56.47 
 
 		 275 aa  299  4e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  54.55 
 
 		 277 aa  297  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10130  elongation factor Ts  55.2 
 
 		 274 aa  295  5e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1485  translation elongation factor Ts  57.3 
 
 		 281 aa  295  6e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.485707  normal  0.476754 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  53.99 
 
 		 278 aa  294  9e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  52.17 
 
 		 278 aa  291  8e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  52.73 
 
 		 277 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  51.46 
 
 		 271 aa  280  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  53.45 
 
 		 272 aa  274  9e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5910  translation elongation factor Ts  54.38 
 
 		 271 aa  268  8e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0273949  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2199  translation elongation factor Ts  50.36 
 
 		 270 aa  262  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1181  translation elongation factor Ts  53.6 
 
 		 279 aa  262  4e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.875084  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2210  elongation factor Ts  52.92 
 
 		 271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126056  normal  0.227569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2105  translation elongation factor Ts  50.54 
 
 		 274 aa  251  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3242  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  53.99 
 
 		 270 aa  248  9e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.388242  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12903  elongation factor Ts  52.55 
 
 		 271 aa  247  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.172192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4132  elongation factor Ts  52.55 
 
 		 271 aa  245  6e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.367953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1975  elongation factor Ts  52.35 
 
 		 274 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2040  elongation factor Ts  52.35 
 
 		 274 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1994  elongation factor Ts  52.35 
 
 		 274 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1669  translation elongation factor Ts  47.65 
 
 		 274 aa  241  9e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3112  translation elongation factor Ts  48.19 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000959082  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0808  translation elongation factor Ts  45.32 
 
 		 283 aa  239  5e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0404  elongation factor Ts  46.76 
 
 		 283 aa  235  6e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000167696  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  45.22 
 
 		 291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  43.38 
 
 		 290 aa  211  7e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  43.17 
 
 		 279 aa  211  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  43.49 
 
 		 291 aa  208  8e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  41.67 
 
 		 292 aa  208  8e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  44.09 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  45.45 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  42.91 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0883  translation elongation factor Ts  42.09 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  42.18 
 
 		 293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  41.45 
 
 		 292 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  41.91 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  43.68 
 
 		 295 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  40.79 
 
 		 273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  41.82 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4744  translation elongation factor Ts  41.99 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3494  translation elongation factor Ts  41.64 
 
 		 278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000803049  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  40.81 
 
 		 291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  41.82 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  41.82 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  41.82 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  41.82 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  41.82 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  41.45 
 
 		 293 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  41.45 
 
 		 293 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  41.45 
 
 		 293 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  41.45 
 
 		 293 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  41.45 
 
 		 293 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  41.45 
 
 		 293 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  41.82 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  41.45 
 
 		 294 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  44.4 
 
 		 295 aa  194  9e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  43.12 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  41.82 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  42.6 
 
 		 295 aa  193  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  42.6 
 
 		 295 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  42.96 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  42.18 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  41.45 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  40.34 
 
 		 288 aa  192  4e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  42.6 
 
 		 295 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  42.6 
 
 		 295 aa  192  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  42.6 
 
 		 295 aa  192  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  42.6 
 
 		 295 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0049  translation elongation factor Ts  42.35 
 
 		 277 aa  192  5e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  42.6 
 
 		 295 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  41.52 
 
 		 294 aa  191  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  38.06 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  41.24 
 
 		 283 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  41.24 
 
 		 283 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  39.48 
 
 		 289 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  41.18 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  41.24 
 
 		 283 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  41.24 
 
 		 283 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  41.24 
 
 		 283 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  41.24 
 
 		 283 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  41.24 
 
 		 283 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  41.24 
 
 		 283 aa  190  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  41.24 
 
 		 283 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  42.6 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  41.24 
 
 		 283 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3036  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  42.14 
 
 		 278 aa  189  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00138132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0627  translation elongation factor Ts  43.43 
 
 		 263 aa  189  5e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.897775  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  40.88 
 
 		 283 aa  189  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>