More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1541 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  100 
 
 		 276 aa  541  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  65.34 
 
 		 278 aa  356  1.9999999999999998e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  64.26 
 
 		 278 aa  347  1e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  62.32 
 
 		 276 aa  344  8.999999999999999e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  58.7 
 
 		 277 aa  331  8e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5910  translation elongation factor Ts  62.91 
 
 		 271 aa  326  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0273949  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  58.48 
 
 		 278 aa  322  6e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  57.61 
 
 		 277 aa  318  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  56.57 
 
 		 275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  60.51 
 
 		 272 aa  307  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06750  elongation factor Ts  57.55 
 
 		 278 aa  306  3e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00748724  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1385  elongation factor Ts  56.47 
 
 		 278 aa  298  9e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000279942 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11200  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  53.79 
 
 		 282 aa  296  2e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1368  elongation factor Ts  55.76 
 
 		 278 aa  292  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0623033  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3112  translation elongation factor Ts  59.35 
 
 		 274 aa  291  6e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000959082  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  55.64 
 
 		 271 aa  291  7e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1231  elongation factor Ts  55.56 
 
 		 275 aa  291  9e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442239  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1323  elongation factor Ts  55.91 
 
 		 275 aa  289  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12903  elongation factor Ts  60.73 
 
 		 271 aa  288  9e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.172192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1485  translation elongation factor Ts  58.57 
 
 		 281 aa  288  9e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.485707  normal  0.476754 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1669  translation elongation factor Ts  56.83 
 
 		 274 aa  286  4e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2040  elongation factor Ts  60.07 
 
 		 274 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1975  elongation factor Ts  60.07 
 
 		 274 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1994  elongation factor Ts  60.07 
 
 		 274 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23600  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  54.84 
 
 		 279 aa  285  7e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.13025 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4132  elongation factor Ts  58.91 
 
 		 271 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.367953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2210  elongation factor Ts  57.45 
 
 		 271 aa  279  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126056  normal  0.227569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2105  translation elongation factor Ts  56.83 
 
 		 274 aa  276  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1005  translation elongation factor Ts  52.88 
 
 		 279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10130  elongation factor Ts  51.61 
 
 		 274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2199  translation elongation factor Ts  52 
 
 		 270 aa  268  5.9999999999999995e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2506  elongation factor Ts  53.93 
 
 		 281 aa  268  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.346339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3242  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  55.27 
 
 		 270 aa  257  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.388242  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1181  translation elongation factor Ts  48.03 
 
 		 279 aa  231  7.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.875084  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  44.81 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0808  translation elongation factor Ts  40.86 
 
 		 283 aa  209  3e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  43.75 
 
 		 291 aa  206  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  41.3 
 
 		 273 aa  203  2e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  43.73 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  41.91 
 
 		 291 aa  198  7e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0404  elongation factor Ts  41.22 
 
 		 283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000167696  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  43.53 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  40.58 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  40.22 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  39.86 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  43.27 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0883  translation elongation factor Ts  43.88 
 
 		 275 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0627  translation elongation factor Ts  46.55 
 
 		 263 aa  194  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.897775  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  40.58 
 
 		 293 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  39.86 
 
 		 293 aa  192  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  40.22 
 
 		 293 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  40.22 
 
 		 293 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  40.22 
 
 		 293 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  40.22 
 
 		 293 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  40.22 
 
 		 293 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  40.22 
 
 		 293 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  40.22 
 
 		 294 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  40.22 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  40.22 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  40.89 
 
 		 288 aa  190  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  40.22 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  40.22 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  40.22 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  41.03 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  40.22 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  40.65 
 
 		 293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  40.22 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  42.03 
 
 		 292 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0508  elongation factor Ts  40.94 
 
 		 294 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0459419  normal  0.717587 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  41.1 
 
 		 288 aa  187  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  38.44 
 
 		 311 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  40.58 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  40.94 
 
 		 294 aa  186  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4744  translation elongation factor Ts  41.43 
 
 		 277 aa  186  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  41.11 
 
 		 307 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  42.65 
 
 		 291 aa  186  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  41.26 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  41.26 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  42.24 
 
 		 285 aa  185  5e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  40.22 
 
 		 292 aa  185  6e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  37.29 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  39.73 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  41.07 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1370  elongation factor Ts  43.36 
 
 		 308 aa  183  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  39.11 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  42.61 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3494  translation elongation factor Ts  40.36 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000803049  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  40.28 
 
 		 310 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  41.13 
 
 		 293 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  40.29 
 
 		 291 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0528  translation elongation factor Ts  34.86 
 
 		 280 aa  179  4.999999999999999e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.101205  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  38.08 
 
 		 292 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_002950  PG0378  elongation factor Ts  37.23 
 
 		 274 aa  179  5.999999999999999e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  41.16 
 
 		 285 aa  178  7e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  41.16 
 
 		 285 aa  178  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  41.3 
 
 		 288 aa  178  7e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  41.16 
 
 		 285 aa  178  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  38.91 
 
 		 292 aa  178  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  38.46 
 
 		 289 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  40.79 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>