More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3990 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 271 aa  539  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5910  translation elongation factor Ts  64.21 
 
 		 271 aa  353  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0273949  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  61.4 
 
 		 272 aa  347  9e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1323  elongation factor Ts  63.27 
 
 		 275 aa  347  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1231  elongation factor Ts  62.18 
 
 		 275 aa  345  4e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442239  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2199  translation elongation factor Ts  58.89 
 
 		 270 aa  325  6e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2105  translation elongation factor Ts  61.68 
 
 		 274 aa  322  4e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1669  translation elongation factor Ts  59.34 
 
 		 274 aa  321  6e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2210  elongation factor Ts  60.52 
 
 		 271 aa  322  6e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126056  normal  0.227569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  58.99 
 
 		 278 aa  320  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  58.63 
 
 		 278 aa  318  7e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4132  elongation factor Ts  61.25 
 
 		 271 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.367953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1975  elongation factor Ts  60.58 
 
 		 274 aa  315  5e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2040  elongation factor Ts  60.58 
 
 		 274 aa  315  5e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1994  elongation factor Ts  60.58 
 
 		 274 aa  315  5e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12903  elongation factor Ts  60.52 
 
 		 271 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.172192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  57.45 
 
 		 276 aa  303  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  56.12 
 
 		 278 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3242  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  57.78 
 
 		 270 aa  293  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.388242  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3112  translation elongation factor Ts  56.99 
 
 		 274 aa  292  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000959082  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  55.64 
 
 		 276 aa  291  7e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  52.71 
 
 		 277 aa  285  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  51.46 
 
 		 275 aa  280  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  49.82 
 
 		 277 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11200  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  52.71 
 
 		 282 aa  269  2.9999999999999997e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1005  translation elongation factor Ts  51.08 
 
 		 279 aa  263  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23600  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  49.46 
 
 		 279 aa  261  6.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.13025 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1385  elongation factor Ts  50 
 
 		 278 aa  256  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000279942 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2506  elongation factor Ts  52.5 
 
 		 281 aa  257  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.346339 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1368  elongation factor Ts  50 
 
 		 278 aa  257  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0623033  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06750  elongation factor Ts  48.2 
 
 		 278 aa  249  2e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00748724  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1485  translation elongation factor Ts  50 
 
 		 281 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.485707  normal  0.476754 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10130  elongation factor Ts  45.04 
 
 		 274 aa  224  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  46.38 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  46.38 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  46.38 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  46.38 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  46.38 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  46.01 
 
 		 293 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  46.01 
 
 		 293 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  46.01 
 
 		 293 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  46.01 
 
 		 293 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  46.01 
 
 		 294 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  46.01 
 
 		 293 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  46.01 
 
 		 293 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  45.65 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  45.65 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  44.2 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  45.29 
 
 		 293 aa  219  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  44.57 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  43.68 
 
 		 276 aa  217  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  43.84 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  41.67 
 
 		 279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1181  translation elongation factor Ts  46.95 
 
 		 279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.875084  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  44.2 
 
 		 292 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  45.32 
 
 		 294 aa  209  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  44.2 
 
 		 292 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  44.73 
 
 		 292 aa  208  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  40.07 
 
 		 292 aa  207  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  39.05 
 
 		 273 aa  206  3e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0508  elongation factor Ts  44.2 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0459419  normal  0.717587 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  43.48 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  43.88 
 
 		 290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  42.21 
 
 		 303 aa  199  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0808  translation elongation factor Ts  40.5 
 
 		 283 aa  198  6e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  43.17 
 
 		 294 aa  198  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  40.93 
 
 		 293 aa  199  6e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  40.96 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  40.65 
 
 		 291 aa  196  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0404  elongation factor Ts  40.5 
 
 		 283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000167696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 295 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 295 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  42.45 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  42.09 
 
 		 295 aa  192  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  37.85 
 
 		 288 aa  191  9e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  42.09 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  42.45 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  41.54 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  40.44 
 
 		 291 aa  188  8e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  41.18 
 
 		 291 aa  188  9e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  39.64 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0627  translation elongation factor Ts  43.01 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.897775  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  40 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  39.36 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3036  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  38.21 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00138132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  37.41 
 
 		 311 aa  186  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>