More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1181 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1181  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 279 aa  544  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.875084  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23600  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  65.95 
 
 		 279 aa  358  7e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.13025 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1005  translation elongation factor Ts  65.23 
 
 		 279 aa  330  2e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10130  elongation factor Ts  56.27 
 
 		 274 aa  308  9e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2506  elongation factor Ts  62.5 
 
 		 281 aa  303  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.346339 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06750  elongation factor Ts  56.03 
 
 		 278 aa  293  3e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00748724  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1485  translation elongation factor Ts  59.64 
 
 		 281 aa  292  4e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.485707  normal  0.476754 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  53.6 
 
 		 275 aa  284  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1368  elongation factor Ts  54.96 
 
 		 278 aa  282  5.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0623033  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1385  elongation factor Ts  54.26 
 
 		 278 aa  280  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000279942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  54.64 
 
 		 276 aa  276  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11200  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  52.13 
 
 		 282 aa  269  4e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130552  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  51.07 
 
 		 278 aa  264  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  48.03 
 
 		 277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  49.29 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  48.57 
 
 		 278 aa  251  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  47.84 
 
 		 277 aa  247  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1323  elongation factor Ts  49.82 
 
 		 275 aa  244  8e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1231  elongation factor Ts  48.76 
 
 		 275 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442239  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  48.03 
 
 		 276 aa  242  6e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0808  translation elongation factor Ts  46.59 
 
 		 283 aa  238  5.999999999999999e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  48.39 
 
 		 272 aa  234  8e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  46.95 
 
 		 271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2105  translation elongation factor Ts  47.69 
 
 		 274 aa  232  6e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5910  translation elongation factor Ts  48.39 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0273949  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1669  translation elongation factor Ts  47.16 
 
 		 274 aa  227  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0404  elongation factor Ts  46.59 
 
 		 283 aa  223  4e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000167696  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2199  translation elongation factor Ts  46.76 
 
 		 270 aa  222  7e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2210  elongation factor Ts  50.54 
 
 		 271 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126056  normal  0.227569 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2040  elongation factor Ts  51.96 
 
 		 274 aa  214  8e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1975  elongation factor Ts  51.96 
 
 		 274 aa  214  8e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1994  elongation factor Ts  51.96 
 
 		 274 aa  214  8e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3242  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  48.23 
 
 		 270 aa  212  7e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.388242  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4132  elongation factor Ts  49.82 
 
 		 271 aa  208  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.367953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3112  translation elongation factor Ts  47.46 
 
 		 274 aa  209  6e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000959082  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12903  elongation factor Ts  51.25 
 
 		 271 aa  208  8e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.172192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1048  elongation factor Ts  44.04 
 
 		 269 aa  192  6e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0760308  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  40.73 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  41.94 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  40.34 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  41.98 
 
 		 288 aa  186  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  41.22 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  40.74 
 
 		 291 aa  186  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  38.27 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  40.37 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  39.31 
 
 		 288 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  40.29 
 
 		 292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  37.97 
 
 		 288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  38.08 
 
 		 291 aa  182  7e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  42.55 
 
 		 295 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  39.86 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  42.55 
 
 		 295 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0976  elongation factor Ts  38.43 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  42.91 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  41.22 
 
 		 293 aa  178  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  39.31 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  38.52 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  41.84 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  41.84 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  41.84 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  41.84 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  41.84 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  41.84 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  40.5 
 
 		 293 aa  176  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  40.86 
 
 		 294 aa  175  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  40.86 
 
 		 293 aa  175  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  40.86 
 
 		 293 aa  175  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  40.86 
 
 		 293 aa  175  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  40.86 
 
 		 293 aa  175  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  40.86 
 
 		 293 aa  175  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  40.86 
 
 		 293 aa  175  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  41.28 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3494  translation elongation factor Ts  40.21 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000803049  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  39.86 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  41.49 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  37.23 
 
 		 299 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  38.69 
 
 		 292 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  41.28 
 
 		 267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  41.49 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0378  elongation factor Ts  37.77 
 
 		 274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0049  translation elongation factor Ts  42.39 
 
 		 277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  39.21 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  39.21 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  39.21 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  38.85 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  39.21 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1647  elongation factor Ts  40.34 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  39.21 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  39.21 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  39.21 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  38.41 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  39.21 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  39.21 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  39.56 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2352  elongation factor Ts  38.7 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000872397  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  37.46 
 
 		 307 aa  170  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  41.46 
 
 		 303 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  38.23 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  40.48 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  38.89 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>