More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1864 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  100 
 
 		 277 aa  558  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  79.42 
 
 		 277 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  63.67 
 
 		 278 aa  362  3e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  64.39 
 
 		 278 aa  354  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  61.37 
 
 		 276 aa  342  5e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  57.61 
 
 		 276 aa  318  5e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  55.76 
 
 		 278 aa  318  7.999999999999999e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  52.73 
 
 		 275 aa  286  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1323  elongation factor Ts  55.87 
 
 		 275 aa  285  5.999999999999999e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5910  translation elongation factor Ts  53.07 
 
 		 271 aa  283  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0273949  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1231  elongation factor Ts  54.8 
 
 		 275 aa  282  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442239  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2199  translation elongation factor Ts  55.07 
 
 		 270 aa  281  8.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11200  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  52.52 
 
 		 282 aa  277  1e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  49.82 
 
 		 271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  52.52 
 
 		 272 aa  271  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1368  elongation factor Ts  50.18 
 
 		 278 aa  262  6e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0623033  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1485  translation elongation factor Ts  53.21 
 
 		 281 aa  257  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.485707  normal  0.476754 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1385  elongation factor Ts  48.03 
 
 		 278 aa  255  5e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000279942 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1669  translation elongation factor Ts  51.43 
 
 		 274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2210  elongation factor Ts  51.99 
 
 		 271 aa  249  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126056  normal  0.227569 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3112  translation elongation factor Ts  48.93 
 
 		 274 aa  249  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000959082  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06750  elongation factor Ts  45.88 
 
 		 278 aa  248  1e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00748724  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1005  translation elongation factor Ts  47.48 
 
 		 279 aa  247  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23600  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  47.31 
 
 		 279 aa  247  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.13025 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2105  translation elongation factor Ts  49.29 
 
 		 274 aa  247  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12903  elongation factor Ts  52.71 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.172192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4132  elongation factor Ts  50.9 
 
 		 271 aa  240  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.367953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3242  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  50.72 
 
 		 270 aa  239  5e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.388242  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10130  elongation factor Ts  45.88 
 
 		 274 aa  238  9e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2040  elongation factor Ts  50.36 
 
 		 274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1994  elongation factor Ts  50.36 
 
 		 274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1975  elongation factor Ts  50.36 
 
 		 274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1181  translation elongation factor Ts  47.84 
 
 		 279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.875084  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2506  elongation factor Ts  47.5 
 
 		 281 aa  228  8e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.346339 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  42.09 
 
 		 273 aa  222  4e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  45.49 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  43.43 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  42.45 
 
 		 293 aa  209  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0808  translation elongation factor Ts  40.86 
 
 		 283 aa  206  2e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  43.22 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  38.64 
 
 		 311 aa  202  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  43.07 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  40.29 
 
 		 292 aa  202  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  43.17 
 
 		 279 aa  199  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  41.61 
 
 		 295 aa  199  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  41.61 
 
 		 295 aa  198  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  39.04 
 
 		 288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  41.24 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  41.24 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  42.24 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  39.06 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  38.18 
 
 		 289 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  41.24 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  41.24 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  41.24 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  41.24 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  42.45 
 
 		 291 aa  196  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  41.24 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  42.24 
 
 		 294 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  40.88 
 
 		 295 aa  195  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  42.24 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  42.24 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  42.24 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  42.24 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  42.24 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  42.24 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  41.24 
 
 		 292 aa  195  9e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0404  elongation factor Ts  40.86 
 
 		 283 aa  192  4e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000167696  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  39.22 
 
 		 299 aa  192  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  41.52 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  40.79 
 
 		 293 aa  192  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  40.5 
 
 		 291 aa  191  9e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  39.35 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  37.63 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  39.01 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  40.88 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  41.49 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  39.01 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  40.43 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 291 aa  188  8e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  39.71 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  39.8 
 
 		 288 aa  186  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  38.46 
 
 		 294 aa  186  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1647  elongation factor Ts  38.44 
 
 		 288 aa  186  4e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0976  elongation factor Ts  37.28 
 
 		 292 aa  185  6e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120791  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  38.79 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  40.86 
 
 		 293 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  41.01 
 
 		 296 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3036  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  38.3 
 
 		 278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00138132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  37.07 
 
 		 288 aa  182  7e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  39.05 
 
 		 290 aa  182  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  38.41 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  39.71 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0049  translation elongation factor Ts  38.43 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2009  elongation factor Ts  39.46 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  38.63 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  39.35 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  39.35 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  39.35 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>