More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0404 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0404  elongation factor Ts  100 
 
 		 283 aa  553  1e-156  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000167696  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0808  translation elongation factor Ts  83.93 
 
 		 283 aa  465  9.999999999999999e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10130  elongation factor Ts  50.36 
 
 		 274 aa  262  4e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06750  elongation factor Ts  50 
 
 		 278 aa  250  2e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00748724  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1485  translation elongation factor Ts  53.57 
 
 		 281 aa  249  4e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.485707  normal  0.476754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23600  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  49.64 
 
 		 279 aa  248  9e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.13025 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1005  translation elongation factor Ts  48.56 
 
 		 279 aa  246  3e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  46.76 
 
 		 275 aa  240  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2506  elongation factor Ts  52.86 
 
 		 281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.346339 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1368  elongation factor Ts  47.69 
 
 		 278 aa  231  7.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0623033  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1385  elongation factor Ts  48.04 
 
 		 278 aa  231  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000279942 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  45.2 
 
 		 278 aa  227  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1231  elongation factor Ts  46.48 
 
 		 275 aa  226  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442239  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  44.13 
 
 		 278 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  45.71 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11200  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  44.48 
 
 		 282 aa  221  7e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1323  elongation factor Ts  45.07 
 
 		 275 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1181  translation elongation factor Ts  46.59 
 
 		 279 aa  219  6e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.875084  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2210  elongation factor Ts  45.88 
 
 		 271 aa  218  7e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126056  normal  0.227569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4132  elongation factor Ts  46.59 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.367953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  44.64 
 
 		 272 aa  215  5e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1975  elongation factor Ts  46.1 
 
 		 274 aa  214  9e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1994  elongation factor Ts  46.1 
 
 		 274 aa  214  9e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2040  elongation factor Ts  46.1 
 
 		 274 aa  214  9e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  42.05 
 
 		 278 aa  211  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2105  translation elongation factor Ts  44.68 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  40.5 
 
 		 277 aa  205  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  41.22 
 
 		 276 aa  203  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  40.86 
 
 		 277 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12903  elongation factor Ts  46.24 
 
 		 271 aa  201  9e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.172192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2199  translation elongation factor Ts  42.5 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  40.5 
 
 		 271 aa  200  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1669  translation elongation factor Ts  40.78 
 
 		 274 aa  196  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3112  translation elongation factor Ts  43.57 
 
 		 274 aa  195  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000959082  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  39.86 
 
 		 291 aa  195  7e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  39.36 
 
 		 292 aa  195  8.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3242  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  44.6 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.388242  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5910  translation elongation factor Ts  43.06 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0273949  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  39.86 
 
 		 291 aa  186  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  40.2 
 
 		 311 aa  185  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  41.28 
 
 		 291 aa  185  9e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  39.37 
 
 		 288 aa  179  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  40.28 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  38.93 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  40.64 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  40.64 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  40.64 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  39.22 
 
 		 285 aa  175  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  39.22 
 
 		 283 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  37.37 
 
 		 273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  38.87 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  38.87 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  38.87 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  38.87 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  38.52 
 
 		 293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  42.46 
 
 		 294 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  40 
 
 		 291 aa  171  9e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  39.36 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  39.36 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  39.36 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  39.36 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  39.36 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  37.89 
 
 		 291 aa  170  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  39.36 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  39.36 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  39.36 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  39.36 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  39.3 
 
 		 296 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  38.08 
 
 		 290 aa  169  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  37.32 
 
 		 294 aa  168  9e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  36.75 
 
 		 292 aa  168  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  36.4 
 
 		 292 aa  168  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  38.52 
 
 		 283 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  36.27 
 
 		 292 aa  165  9e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  38.57 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  41.05 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  34.95 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  38.95 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  36.33 
 
 		 292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  40.7 
 
 		 295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0976  elongation factor Ts  36.68 
 
 		 292 aa  162  6e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120791  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0627  translation elongation factor Ts  38.77 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.897775  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  37.59 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2547  elongation factor Ts  37.46 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  37.14 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  40.28 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  40.28 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  40.28 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  40.28 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  40.28 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0706  translation elongation factor Ts  36.3 
 
 		 290 aa  159  3e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000134038  unclonable  0.0000000259641 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  36.88 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  38.06 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3359  elongation factor Ts  37.59 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461306  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0883  translation elongation factor Ts  37.28 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  34.59 
 
 		 288 aa  159  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 295 aa  158  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  35.59 
 
 		 289 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  38.25 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>