More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2012 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  100 
 
 		 288 aa  579  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  69.1 
 
 		 288 aa  416  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  66.55 
 
 		 288 aa  393  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2009  elongation factor Ts  65.85 
 
 		 288 aa  385  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2352  elongation factor Ts  64.11 
 
 		 288 aa  367  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000872397  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1647  elongation factor Ts  63.41 
 
 		 288 aa  365  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0404  elongation factor Ts  61.67 
 
 		 288 aa  358  5e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  46.13 
 
 		 276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  45.8 
 
 		 303 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  45.45 
 
 		 303 aa  242  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  44.44 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  42.81 
 
 		 303 aa  229  5e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  43.55 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  43.55 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  42.61 
 
 		 292 aa  223  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  39.79 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  43.36 
 
 		 267 aa  219  6e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  44.07 
 
 		 286 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  42.61 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  41.3 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  36.27 
 
 		 294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  42.12 
 
 		 286 aa  216  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  39.93 
 
 		 292 aa  215  5.9999999999999996e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  40.35 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0673  translation elongation factor Ts  41.08 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  41.89 
 
 		 312 aa  213  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  42.25 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0883  translation elongation factor Ts  41.26 
 
 		 275 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  39.86 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  42.55 
 
 		 294 aa  211  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  40.7 
 
 		 291 aa  209  6e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  40.61 
 
 		 307 aa  208  7e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  45.26 
 
 		 292 aa  208  9e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  40.77 
 
 		 292 aa  208  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  40.83 
 
 		 302 aa  206  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1048  elongation factor Ts  42.11 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0760308  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0049  translation elongation factor Ts  40.7 
 
 		 277 aa  206  3e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  40.34 
 
 		 310 aa  206  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  42.16 
 
 		 294 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  38.98 
 
 		 313 aa  203  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  38.03 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  38.95 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  43.21 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  39.32 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  40.55 
 
 		 287 aa  203  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  41.51 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3494  translation elongation factor Ts  38.38 
 
 		 278 aa  202  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000803049  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  43.2 
 
 		 309 aa  202  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  42.11 
 
 		 300 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  40.7 
 
 		 299 aa  199  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  41.16 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3036  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  38.11 
 
 		 278 aa  200  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00138132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  39.08 
 
 		 292 aa  199  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  39.08 
 
 		 292 aa  199  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  41.75 
 
 		 295 aa  198  7e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  41.75 
 
 		 295 aa  198  7e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  41.46 
 
 		 303 aa  198  7e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  39.04 
 
 		 307 aa  198  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  41.75 
 
 		 295 aa  198  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  41.75 
 
 		 295 aa  198  9e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  41.75 
 
 		 295 aa  198  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  41.75 
 
 		 295 aa  198  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  40.48 
 
 		 308 aa  198  9e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  41.75 
 
 		 295 aa  198  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  40.48 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_002950  PG0378  elongation factor Ts  38.95 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  39.12 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  38.57 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  37.29 
 
 		 312 aa  196  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  39.58 
 
 		 289 aa  196  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  41.4 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  38.64 
 
 		 307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1273  elongation factor Ts  39.37 
 
 		 286 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00309579  normal  0.676189 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  41.3 
 
 		 272 aa  195  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  39.38 
 
 		 278 aa  195  6e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  42.31 
 
 		 295 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  40.75 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4744  translation elongation factor Ts  37.32 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  41.55 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  39.79 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  41.05 
 
 		 295 aa  193  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  39.73 
 
 		 314 aa  193  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  38.91 
 
 		 310 aa  192  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  38.81 
 
 		 273 aa  192  7e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  41.05 
 
 		 295 aa  192  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0706  translation elongation factor Ts  40.75 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000134038  unclonable  0.0000000259641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  38.01 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1104  translation elongation factor Ts  42.27 
 
 		 286 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  37.63 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0351  elongation factor Ts  42.21 
 
 		 294 aa  189  4e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.556574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  37.2 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  40.82 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  40.83 
 
 		 291 aa  188  8e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  37.63 
 
 		 308 aa  188  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0390  elongation factor Ts  42.59 
 
 		 294 aa  188  9e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.432291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2547  elongation factor Ts  42.86 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  39.59 
 
 		 307 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11200  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  37.76 
 
 		 282 aa  188  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  41.1 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  37.28 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>