More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1132 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  100 
 
 		 307 aa  605  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  82.62 
 
 		 308 aa  516  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  86.56 
 
 		 308 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  85.9 
 
 		 308 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  70.68 
 
 		 310 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  68.35 
 
 		 307 aa  430  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  69.71 
 
 		 305 aa  426  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  69.71 
 
 		 305 aa  426  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  67.75 
 
 		 307 aa  418  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3195  translation elongation factor Ts  63.28 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  57.98 
 
 		 312 aa  356  2.9999999999999997e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  60.93 
 
 		 296 aa  350  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  60 
 
 		 309 aa  348  7e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  57.38 
 
 		 308 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  57.05 
 
 		 308 aa  344  8e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  58.09 
 
 		 308 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  57.86 
 
 		 300 aa  342  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  57.09 
 
 		 307 aa  342  5e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  58.11 
 
 		 307 aa  340  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  57.52 
 
 		 312 aa  340  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1697  elongation factor Ts  59.15 
 
 		 307 aa  334  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  59.93 
 
 		 291 aa  334  1e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4828  elongation factor Ts  57.84 
 
 		 307 aa  328  6e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0383674  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2034  elongation factor Ts  56.07 
 
 		 306 aa  324  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0653103 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  55.41 
 
 		 307 aa  322  4e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  56.07 
 
 		 308 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2348  elongation factor Ts  56.54 
 
 		 306 aa  322  7e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.474929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2074  elongation factor Ts  56.54 
 
 		 306 aa  322  7e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0812187  normal  0.288352 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  53.25 
 
 		 303 aa  321  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3449  elongation factor Ts  56.25 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190771  normal  0.488523 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  56.77 
 
 		 301 aa  317  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  55.05 
 
 		 291 aa  317  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  55.93 
 
 		 301 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  57.98 
 
 		 291 aa  308  6.999999999999999e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4438  elongation factor Ts  56.27 
 
 		 307 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000816473 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  52.49 
 
 		 310 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1959  elongation factor Ts  55.7 
 
 		 308 aa  291  9e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2224  elongation factor Ts  52.16 
 
 		 310 aa  285  7e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2861  elongation factor Ts  54.78 
 
 		 298 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1511  elongation factor Ts  54.46 
 
 		 298 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501204  normal  0.0222785 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1432  elongation factor Ts  54.78 
 
 		 298 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  hitchhiker  0.00915816 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1370  elongation factor Ts  52.35 
 
 		 308 aa  275  9e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  46.43 
 
 		 303 aa  263  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  50.33 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  46.15 
 
 		 294 aa  249  3e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  48.86 
 
 		 293 aa  249  4e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  45.95 
 
 		 294 aa  249  4e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  48.86 
 
 		 293 aa  249  4e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  48.05 
 
 		 292 aa  249  5e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  44.16 
 
 		 311 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  46.43 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  44.98 
 
 		 292 aa  239  4e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  45.78 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  47.73 
 
 		 295 aa  236  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  47.73 
 
 		 295 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  47.73 
 
 		 295 aa  236  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  47.73 
 
 		 295 aa  236  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  47.4 
 
 		 295 aa  235  7e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  47.4 
 
 		 295 aa  235  7e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  47.4 
 
 		 295 aa  235  7e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  47.4 
 
 		 295 aa  235  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  47.4 
 
 		 295 aa  235  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  45.54 
 
 		 292 aa  235  9e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  45.28 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  47.4 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  43.23 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  47.08 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  47.56 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  43.91 
 
 		 292 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  43.91 
 
 		 292 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  47.02 
 
 		 294 aa  232  5e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  44.37 
 
 		 293 aa  231  8.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  48.67 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  45.6 
 
 		 302 aa  231  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 292 aa  228  7e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0531  elongation factor Ts  41.52 
 
 		 286 aa  226  3e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 292 aa  226  3e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  42.26 
 
 		 310 aa  225  6e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  42.44 
 
 		 314 aa  224  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  44.52 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0516  elongation factor Ts  40.34 
 
 		 288 aa  224  2e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.203151  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  44.52 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  43.33 
 
 		 292 aa  222  4.9999999999999996e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  42.91 
 
 		 292 aa  222  6e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  40.72 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  42.37 
 
 		 287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0515  elongation factor Ts  40.99 
 
 		 288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  44.59 
 
 		 299 aa  219  6e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  40.2 
 
 		 286 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  43.37 
 
 		 291 aa  218  8.999999999999998e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  43.97 
 
 		 285 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  42.38 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  42.38 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  43.23 
 
 		 292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  43.79 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  43.79 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  43.79 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  44.01 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  43.42 
 
 		 283 aa  215  7e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  43.42 
 
 		 283 aa  215  7e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>