More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0238 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 278 aa  554  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  74.46 
 
 		 278 aa  427  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  69.42 
 
 		 278 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  58.27 
 
 		 277 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  58.48 
 
 		 276 aa  331  9e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  60.43 
 
 		 272 aa  323  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  58.48 
 
 		 276 aa  322  6e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  58.99 
 
 		 271 aa  320  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  55.76 
 
 		 277 aa  318  7.999999999999999e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1323  elongation factor Ts  61.35 
 
 		 275 aa  315  6e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1231  elongation factor Ts  60.28 
 
 		 275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442239  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5910  translation elongation factor Ts  58.63 
 
 		 271 aa  304  9.000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0273949  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12903  elongation factor Ts  61.15 
 
 		 271 aa  300  2e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.172192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2105  translation elongation factor Ts  57.3 
 
 		 274 aa  298  5e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2210  elongation factor Ts  57.91 
 
 		 271 aa  297  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126056  normal  0.227569 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11200  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  54.12 
 
 		 282 aa  294  9e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2040  elongation factor Ts  59.79 
 
 		 274 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1994  elongation factor Ts  59.79 
 
 		 274 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1975  elongation factor Ts  59.79 
 
 		 274 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  52.17 
 
 		 275 aa  291  9e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23600  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  52.5 
 
 		 279 aa  289  4e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.13025 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06750  elongation factor Ts  53.57 
 
 		 278 aa  285  4e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00748724  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4132  elongation factor Ts  57.55 
 
 		 271 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.367953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1005  translation elongation factor Ts  54.12 
 
 		 279 aa  281  7.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1669  translation elongation factor Ts  55.71 
 
 		 274 aa  280  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2199  translation elongation factor Ts  52.71 
 
 		 270 aa  278  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1485  translation elongation factor Ts  54.45 
 
 		 281 aa  275  5e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.485707  normal  0.476754 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10130  elongation factor Ts  51.59 
 
 		 274 aa  268  5e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3112  translation elongation factor Ts  53.41 
 
 		 274 aa  263  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000959082  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3242  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  56.32 
 
 		 270 aa  263  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.388242  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1385  elongation factor Ts  49.29 
 
 		 278 aa  261  6.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000279942 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1368  elongation factor Ts  48.93 
 
 		 278 aa  259  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0623033  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2506  elongation factor Ts  49.82 
 
 		 281 aa  253  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.346339 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1181  translation elongation factor Ts  50.36 
 
 		 279 aa  245  6e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.875084  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  46.76 
 
 		 293 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  44.24 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  46.76 
 
 		 293 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  46.76 
 
 		 293 aa  225  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  45.32 
 
 		 293 aa  225  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  46.4 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  46.4 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  46.4 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  46.04 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  46.04 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  46.04 
 
 		 294 aa  221  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  45.68 
 
 		 293 aa  221  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  46.04 
 
 		 293 aa  221  9e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  46.04 
 
 		 293 aa  221  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  46.04 
 
 		 293 aa  221  9e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  46.04 
 
 		 293 aa  221  9e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  46.04 
 
 		 293 aa  221  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  46.04 
 
 		 293 aa  221  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  45.32 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  42.86 
 
 		 276 aa  216  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  42.45 
 
 		 291 aa  215  5e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  44.6 
 
 		 292 aa  214  9e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  44.96 
 
 		 292 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  44.09 
 
 		 279 aa  211  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  43.88 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0808  translation elongation factor Ts  41.79 
 
 		 283 aa  210  3e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  44.96 
 
 		 294 aa  205  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  43.8 
 
 		 291 aa  205  6e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0404  elongation factor Ts  42.05 
 
 		 283 aa  205  8e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000167696  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1743  elongation factor Ts  44.84 
 
 		 299 aa  205  9e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  42.7 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  41.84 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  45.45 
 
 		 291 aa  202  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  40.43 
 
 		 302 aa  202  6e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1343  elongation factor Ts  44.64 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.284901 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  42.65 
 
 		 293 aa  199  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  42.29 
 
 		 290 aa  199  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  40.86 
 
 		 293 aa  198  7e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  39.04 
 
 		 288 aa  198  7.999999999999999e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4947  elongation factor Ts  42.91 
 
 		 298 aa  198  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725699 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1279  elongation factor Ts  44.04 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.174908 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1824  elongation factor Ts  44.33 
 
 		 298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.31491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  39.86 
 
 		 273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0508  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 294 aa  196  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0459419  normal  0.717587 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  39.86 
 
 		 291 aa  196  3e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  42.45 
 
 		 294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  43.01 
 
 		 294 aa  195  6e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  40.86 
 
 		 291 aa  195  7e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  42.45 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  40.93 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  37.28 
 
 		 292 aa  192  5e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  41.61 
 
 		 291 aa  192  6e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  40.22 
 
 		 289 aa  192  7e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  42.18 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  44.64 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  44.29 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  36.92 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  40.43 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  38.01 
 
 		 288 aa  190  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 283 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4744  translation elongation factor Ts  41.79 
 
 		 277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1224  elongation factor Ts  42.55 
 
 		 298 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0842617  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3036  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  39.72 
 
 		 278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00138132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2584  elongation factor Ts  42.55 
 
 		 298 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.958437  normal  0.0691199 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  40.65 
 
 		 285 aa  189  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>