More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1743 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1743  elongation factor Ts  100 
 
 		 299 aa  588  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2177  elongation factor Ts  80.63 
 
 		 298 aa  443  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00688857  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  72.54 
 
 		 291 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  70.42 
 
 		 290 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  65.85 
 
 		 293 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  65.14 
 
 		 293 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  65.14 
 
 		 293 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  65.14 
 
 		 293 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  65.14 
 
 		 293 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  65.14 
 
 		 293 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  65.85 
 
 		 293 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  65.14 
 
 		 293 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  65.14 
 
 		 293 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  64.44 
 
 		 293 aa  362  4e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  64.44 
 
 		 293 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  64.44 
 
 		 293 aa  362  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  64.44 
 
 		 293 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  64.44 
 
 		 293 aa  362  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  64.44 
 
 		 293 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  64.44 
 
 		 294 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  64.08 
 
 		 293 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  64.08 
 
 		 293 aa  359  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1824  elongation factor Ts  65.62 
 
 		 298 aa  355  3.9999999999999996e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.31491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  64.79 
 
 		 292 aa  355  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  64.08 
 
 		 292 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  62.32 
 
 		 294 aa  352  5e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4947  elongation factor Ts  63.89 
 
 		 298 aa  350  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725699 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0508  elongation factor Ts  61.62 
 
 		 294 aa  348  8e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0459419  normal  0.717587 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  63.38 
 
 		 292 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1224  elongation factor Ts  63.54 
 
 		 298 aa  341  9e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0842617  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2584  elongation factor Ts  63.54 
 
 		 298 aa  341  9e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.958437  normal  0.0691199 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1279  elongation factor Ts  61.97 
 
 		 292 aa  321  8e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.174908 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1343  elongation factor Ts  61.46 
 
 		 296 aa  318  6e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.284901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1439  translation elongation factor Ts  60.74 
 
 		 308 aa  315  4e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1978  elongation factor Ts  57.48 
 
 		 302 aa  315  5e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0299771 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  56.11 
 
 		 302 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1759  elongation factor Ts  58.45 
 
 		 306 aa  305  5.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2849  elongation factor Ts  56.71 
 
 		 306 aa  305  5.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638263 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2600  elongation factor Ts  57.72 
 
 		 307 aa  301  6.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1990  elongation factor Ts  58.72 
 
 		 307 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404756  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2694  elongation factor Ts  56.76 
 
 		 304 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129335  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  49.83 
 
 		 292 aa  276  4e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  49.49 
 
 		 294 aa  268  7e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  51.36 
 
 		 293 aa  268  8.999999999999999e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  51.37 
 
 		 289 aa  266  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  48.44 
 
 		 291 aa  262  6e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  48.81 
 
 		 293 aa  255  6e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  46.1 
 
 		 292 aa  249  6e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  48.78 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  44.18 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  43.84 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  47.93 
 
 		 285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  46.58 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1265  elongation factor Ts  47.4 
 
 		 291 aa  229  6e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  48.14 
 
 		 291 aa  228  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  44.71 
 
 		 290 aa  228  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  45.76 
 
 		 292 aa  226  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  48 
 
 		 303 aa  226  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  48.63 
 
 		 291 aa  226  4e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  46.67 
 
 		 292 aa  223  4e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  47.26 
 
 		 285 aa  222  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  47.26 
 
 		 285 aa  222  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  47.26 
 
 		 285 aa  222  4.9999999999999996e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  45.58 
 
 		 289 aa  221  8e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  45.13 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  45.91 
 
 		 278 aa  218  7.999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  44.82 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  46.49 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  46.49 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  43.54 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  43.54 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  46.08 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  44.77 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  45.73 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  43.46 
 
 		 290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  46.18 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  47.96 
 
 		 291 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  44.95 
 
 		 308 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  45.39 
 
 		 292 aa  212  5.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  44.48 
 
 		 303 aa  212  7.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  46.92 
 
 		 283 aa  211  7.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  46.23 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  46.23 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  46.23 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1344  elongation factor Ts  46.31 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  46.23 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  46.23 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  46.23 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  46.23 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  46.23 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  46.23 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  47.44 
 
 		 295 aa  209  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  46.46 
 
 		 282 aa  209  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  42.52 
 
 		 292 aa  209  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1535  translation elongation factor Ts  47.18 
 
 		 287 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  42.52 
 
 		 292 aa  209  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  46.6 
 
 		 294 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  47.44 
 
 		 295 aa  208  8e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  47.44 
 
 		 295 aa  208  8e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  42.55 
 
 		 290 aa  208  8e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>