More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1343 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1343  elongation factor Ts  100 
 
 		 296 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.284901 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  84.34 
 
 		 292 aa  480  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1279  elongation factor Ts  91.1 
 
 		 292 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.174908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  80.5 
 
 		 292 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  79.79 
 
 		 292 aa  448  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1824  elongation factor Ts  77.39 
 
 		 298 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.31491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4947  elongation factor Ts  76.68 
 
 		 298 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725699 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2694  elongation factor Ts  76.82 
 
 		 304 aa  435  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129335  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2584  elongation factor Ts  74.91 
 
 		 298 aa  432  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.958437  normal  0.0691199 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1224  elongation factor Ts  74.91 
 
 		 298 aa  432  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0842617  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  75.53 
 
 		 294 aa  429  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  74.56 
 
 		 293 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  74.2 
 
 		 293 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2600  elongation factor Ts  73.63 
 
 		 307 aa  421  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0508  elongation factor Ts  74.47 
 
 		 294 aa  422  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0459419  normal  0.717587 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  73.5 
 
 		 293 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1759  elongation factor Ts  74.74 
 
 		 306 aa  420  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  74.2 
 
 		 293 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  74.56 
 
 		 293 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  74.56 
 
 		 293 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  74.56 
 
 		 293 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  73.85 
 
 		 293 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  73.85 
 
 		 293 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  73.85 
 
 		 293 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  73.85 
 
 		 293 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  73.85 
 
 		 294 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  73.85 
 
 		 293 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  74.56 
 
 		 293 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2849  elongation factor Ts  71.57 
 
 		 306 aa  414  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638263 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  74.56 
 
 		 293 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  73.85 
 
 		 293 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  74.56 
 
 		 293 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  73.5 
 
 		 293 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1990  elongation factor Ts  73.63 
 
 		 307 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404756  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1439  translation elongation factor Ts  69.52 
 
 		 308 aa  393  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1978  elongation factor Ts  68.84 
 
 		 302 aa  388  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0299771 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  58.8 
 
 		 290 aa  332  4e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  59.65 
 
 		 291 aa  326  3e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1743  elongation factor Ts  60.76 
 
 		 299 aa  320  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  54.64 
 
 		 302 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2177  elongation factor Ts  57.29 
 
 		 298 aa  291  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00688857  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  50.51 
 
 		 293 aa  269  5e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  50 
 
 		 292 aa  265  8e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  49.29 
 
 		 292 aa  262  6e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  48.99 
 
 		 292 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  49.14 
 
 		 289 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0390  elongation factor Ts  48.97 
 
 		 294 aa  251  8.000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.432291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  48.45 
 
 		 291 aa  251  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  47.44 
 
 		 290 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  47.08 
 
 		 294 aa  246  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0351  elongation factor Ts  47.95 
 
 		 294 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.556574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  47.8 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  46.42 
 
 		 292 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  45.73 
 
 		 292 aa  238  6.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  49.83 
 
 		 294 aa  237  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  48.08 
 
 		 294 aa  235  6e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  47.55 
 
 		 283 aa  235  6e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  48.28 
 
 		 283 aa  235  7e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  48.12 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  48.39 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  48.28 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  47.92 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  47.92 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  47.92 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  47.92 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  47.92 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  47.92 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  47.92 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  47.92 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  47.92 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  46.9 
 
 		 285 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  48.28 
 
 		 285 aa  231  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  48.28 
 
 		 285 aa  231  9e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  48.28 
 
 		 285 aa  231  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  47.24 
 
 		 283 aa  228  8e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3359  elongation factor Ts  47.22 
 
 		 283 aa  228  9e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461306  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  45.67 
 
 		 292 aa  228  9e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  46.88 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  46.88 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  46.88 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  46.88 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  46.88 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  46.88 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  46.26 
 
 		 291 aa  225  6e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1140  elongation factor Ts  46.23 
 
 		 283 aa  224  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000133846  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  46.76 
 
 		 294 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  48.12 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  45.58 
 
 		 289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1535  translation elongation factor Ts  45.79 
 
 		 287 aa  218  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  47.3 
 
 		 295 aa  218  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  43.93 
 
 		 290 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  46.62 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  46.62 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  46.62 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  46.62 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  46.62 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  48.46 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  45 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  46.28 
 
 		 295 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  46.28 
 
 		 295 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>