More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2034 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  100 
 
 		 294 aa  600  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  88.44 
 
 		 294 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  76.03 
 
 		 295 aa  437  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  75.68 
 
 		 295 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  75.68 
 
 		 295 aa  435  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  75.68 
 
 		 295 aa  435  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  75.68 
 
 		 295 aa  435  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  75.68 
 
 		 295 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  76.03 
 
 		 295 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  76.03 
 
 		 295 aa  436  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  75.34 
 
 		 295 aa  432  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  75.68 
 
 		 295 aa  433  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  74.66 
 
 		 295 aa  429  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  64.04 
 
 		 292 aa  367  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  63.23 
 
 		 293 aa  362  4e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  63.23 
 
 		 293 aa  362  4e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  58.48 
 
 		 291 aa  346  2e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0976  elongation factor Ts  56.55 
 
 		 292 aa  315  7e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120791  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  54.11 
 
 		 291 aa  308  9e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  48.17 
 
 		 311 aa  288  6e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  51.37 
 
 		 292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  51.37 
 
 		 292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  51.36 
 
 		 293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  51.7 
 
 		 296 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  51.32 
 
 		 299 aa  280  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  51.36 
 
 		 292 aa  278  8e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  50 
 
 		 289 aa  277  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  48.87 
 
 		 310 aa  277  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  52.04 
 
 		 293 aa  276  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  50.17 
 
 		 294 aa  275  6e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  50.17 
 
 		 290 aa  270  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  48.98 
 
 		 291 aa  269  5e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  48.66 
 
 		 294 aa  267  1e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  49.83 
 
 		 292 aa  267  1e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  51.37 
 
 		 291 aa  268  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  49.67 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  47.95 
 
 		 292 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  48.52 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  46.89 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1048  elongation factor Ts  51.13 
 
 		 269 aa  256  3e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0760308  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  51.37 
 
 		 291 aa  256  4e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  47.32 
 
 		 310 aa  256  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  48.06 
 
 		 290 aa  255  5e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  48.63 
 
 		 291 aa  255  7e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  49.16 
 
 		 292 aa  254  8e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  49.16 
 
 		 292 aa  254  8e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  47.39 
 
 		 308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  50.17 
 
 		 303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  50.17 
 
 		 303 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  47.16 
 
 		 289 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  47 
 
 		 292 aa  251  7e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  47.33 
 
 		 307 aa  251  8.000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl560  elongation factor Ts  45.08 
 
 		 297 aa  251  9.000000000000001e-66  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  46.64 
 
 		 305 aa  251  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  46.64 
 
 		 305 aa  251  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  47.99 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  45.97 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  47.87 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0372  elongation factor Ts  44.93 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  49.3 
 
 		 283 aa  249  3e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  48.17 
 
 		 308 aa  249  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  44.19 
 
 		 312 aa  248  8e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  45.49 
 
 		 276 aa  247  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  47.39 
 
 		 308 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  47.97 
 
 		 285 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  49.13 
 
 		 294 aa  247  1e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  47.97 
 
 		 285 aa  248  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  47.97 
 
 		 285 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  47.62 
 
 		 285 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  47.62 
 
 		 285 aa  246  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  46.6 
 
 		 301 aa  246  4e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  48.58 
 
 		 293 aa  242  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  49.14 
 
 		 301 aa  241  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  48.74 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  46.23 
 
 		 292 aa  240  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  47.78 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3052  elongation factor Ts  48.79 
 
 		 287 aa  240  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.204992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  46.75 
 
 		 307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  48.58 
 
 		 294 aa  238  8e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  46.15 
 
 		 290 aa  237  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0106  elongation factor Ts  46.11 
 
 		 346 aa  237  2e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  46.18 
 
 		 267 aa  236  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  45.45 
 
 		 276 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1102  elongation factor Ts  45.97 
 
 		 287 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.433956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  47.52 
 
 		 293 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  48.58 
 
 		 292 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  48.24 
 
 		 290 aa  235  7e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  45.2 
 
 		 292 aa  235  8e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1511  elongation factor Ts  50.83 
 
 		 298 aa  235  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501204  normal  0.0222785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  44.9 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  47.52 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  47.87 
 
 		 293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  45.27 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  45.15 
 
 		 310 aa  233  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2454  elongation factor Ts  46.13 
 
 		 342 aa  233  3e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000114512  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  45.13 
 
 		 273 aa  233  4.0000000000000004e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  48.58 
 
 		 293 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  48.58 
 
 		 293 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  48.58 
 
 		 293 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  45.51 
 
 		 308 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>