More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2600 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2600  elongation factor Ts  100 
 
 		 307 aa  616  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1824  elongation factor Ts  75.51 
 
 		 298 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.31491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1990  elongation factor Ts  77.4 
 
 		 307 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404756  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2584  elongation factor Ts  75.17 
 
 		 298 aa  441  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.958437  normal  0.0691199 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4947  elongation factor Ts  75.51 
 
 		 298 aa  442  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725699 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1224  elongation factor Ts  75.17 
 
 		 298 aa  441  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0842617  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1759  elongation factor Ts  75.86 
 
 		 306 aa  431  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1439  translation elongation factor Ts  75.34 
 
 		 308 aa  431  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2694  elongation factor Ts  75.17 
 
 		 304 aa  429  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129335  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2849  elongation factor Ts  75 
 
 		 306 aa  426  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638263 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1343  elongation factor Ts  73.63 
 
 		 296 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.284901 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  69.52 
 
 		 292 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  70.21 
 
 		 292 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  68.84 
 
 		 294 aa  404  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  67.81 
 
 		 292 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0508  elongation factor Ts  68.15 
 
 		 294 aa  398  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0459419  normal  0.717587 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1978  elongation factor Ts  70.55 
 
 		 302 aa  396  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0299771 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  65.19 
 
 		 293 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  66.55 
 
 		 293 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  66.55 
 
 		 293 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  66.89 
 
 		 293 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  66.21 
 
 		 293 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  66.55 
 
 		 293 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1279  elongation factor Ts  69.86 
 
 		 292 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.174908 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  65.87 
 
 		 293 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  65.87 
 
 		 293 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  65.87 
 
 		 293 aa  381  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  65.87 
 
 		 294 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  65.87 
 
 		 293 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  65.53 
 
 		 293 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  66.21 
 
 		 293 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  65.87 
 
 		 293 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  65.87 
 
 		 293 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  66.21 
 
 		 293 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  66.21 
 
 		 293 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  65.87 
 
 		 293 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  58.84 
 
 		 290 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  56.27 
 
 		 291 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1743  elongation factor Ts  57.72 
 
 		 299 aa  305  8.000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2177  elongation factor Ts  57.05 
 
 		 298 aa  289  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00688857  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  50 
 
 		 302 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  48.2 
 
 		 293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  47.18 
 
 		 292 aa  248  9e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  47.51 
 
 		 289 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  44.12 
 
 		 292 aa  235  6e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  45.9 
 
 		 293 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  44.37 
 
 		 294 aa  231  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  44.19 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  44.37 
 
 		 292 aa  229  4e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  43.1 
 
 		 292 aa  223  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  43.56 
 
 		 290 aa  223  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0390  elongation factor Ts  44.52 
 
 		 294 aa  222  6e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.432291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  46.13 
 
 		 294 aa  220  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  44.11 
 
 		 292 aa  219  3e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  44.11 
 
 		 292 aa  218  7e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0351  elongation factor Ts  43.85 
 
 		 294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.556574  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  41.58 
 
 		 292 aa  212  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  41.58 
 
 		 292 aa  212  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  41.25 
 
 		 296 aa  208  8e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  41.25 
 
 		 296 aa  208  8e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  42.41 
 
 		 292 aa  207  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  43.61 
 
 		 282 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  42.52 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  43.42 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  43.48 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  43.48 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  43.48 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  43.48 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  43.48 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  43.48 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  42.09 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  43.48 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  43.48 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  43.48 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  43.48 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 283 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 283 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 283 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 283 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  43.19 
 
 		 285 aa  205  9e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  45.45 
 
 		 290 aa  203  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  42.47 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  41.61 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  43.52 
 
 		 285 aa  200  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  43.52 
 
 		 285 aa  200  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  43.52 
 
 		 285 aa  200  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  40.2 
 
 		 292 aa  199  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  42.04 
 
 		 310 aa  199  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  40.2 
 
 		 292 aa  199  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1535  translation elongation factor Ts  43.28 
 
 		 287 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  41.37 
 
 		 294 aa  198  9e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1265  elongation factor Ts  40.54 
 
 		 291 aa  198  9e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1344  elongation factor Ts  42.62 
 
 		 287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  43.23 
 
 		 291 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3359  elongation factor Ts  42.14 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461306  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0976  elongation factor Ts  40.46 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120791  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  42.14 
 
 		 283 aa  196  6e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2426  elongation factor Ts  43.81 
 
 		 282 aa  195  6e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00181853  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  41.14 
 
 		 283 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1140  elongation factor Ts  42.16 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000133846  normal  0.110772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>