More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1439 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1439  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 308 aa  609  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1824  elongation factor Ts  77.21 
 
 		 298 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.31491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1990  elongation factor Ts  78.08 
 
 		 307 aa  434  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404756  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1224  elongation factor Ts  75.85 
 
 		 298 aa  431  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0842617  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2584  elongation factor Ts  75.85 
 
 		 298 aa  431  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.958437  normal  0.0691199 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2600  elongation factor Ts  75.34 
 
 		 307 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4947  elongation factor Ts  74.15 
 
 		 298 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725699 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2694  elongation factor Ts  73.79 
 
 		 304 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129335  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1759  elongation factor Ts  72.41 
 
 		 306 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2849  elongation factor Ts  70.89 
 
 		 306 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638263 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  68.49 
 
 		 292 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  68.49 
 
 		 292 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1343  elongation factor Ts  69.52 
 
 		 296 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.284901 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  69.18 
 
 		 292 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0508  elongation factor Ts  66.44 
 
 		 294 aa  381  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0459419  normal  0.717587 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  66.78 
 
 		 294 aa  383  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1978  elongation factor Ts  68.49 
 
 		 302 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0299771 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  65.19 
 
 		 293 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  64.85 
 
 		 293 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  64.85 
 
 		 293 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  65.19 
 
 		 293 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  64.85 
 
 		 293 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  63.48 
 
 		 293 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  64.85 
 
 		 293 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  64.85 
 
 		 293 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  63.82 
 
 		 293 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  62.46 
 
 		 293 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  62.46 
 
 		 293 aa  353  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  62.12 
 
 		 293 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  62.12 
 
 		 293 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  62.12 
 
 		 293 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  62.12 
 
 		 293 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  62.12 
 
 		 293 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  62.12 
 
 		 293 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1279  elongation factor Ts  65.75 
 
 		 292 aa  351  7e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.174908 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  62.12 
 
 		 294 aa  352  7e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  55.44 
 
 		 290 aa  311  1e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1743  elongation factor Ts  60.07 
 
 		 299 aa  308  6.999999999999999e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  55.59 
 
 		 291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  52.26 
 
 		 302 aa  280  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2177  elongation factor Ts  56.38 
 
 		 298 aa  275  6e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00688857  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  48.2 
 
 		 293 aa  245  6e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  46.51 
 
 		 289 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  45.18 
 
 		 292 aa  232  5e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  44.77 
 
 		 292 aa  228  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  45.57 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  44.37 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  44.19 
 
 		 291 aa  223  4e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  44.3 
 
 		 292 aa  218  8.999999999999998e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  42.72 
 
 		 294 aa  215  8e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  47.19 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  47.52 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0390  elongation factor Ts  43.71 
 
 		 294 aa  209  7e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.432291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  42.95 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0351  elongation factor Ts  43.19 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.556574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  42.95 
 
 		 292 aa  205  6e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  43.57 
 
 		 307 aa  203  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  44.98 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  40.59 
 
 		 292 aa  202  6e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  44.66 
 
 		 295 aa  202  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  40.59 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  44.73 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  43.77 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  43.77 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  43.77 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  43.77 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  44.73 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  43.77 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  43.89 
 
 		 282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1535  translation elongation factor Ts  42.95 
 
 		 287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  43.45 
 
 		 295 aa  199  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  42.72 
 
 		 291 aa  198  7.999999999999999e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  43.77 
 
 		 295 aa  198  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  44.34 
 
 		 303 aa  198  9e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  43.83 
 
 		 290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  42.77 
 
 		 296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1265  elongation factor Ts  42.76 
 
 		 291 aa  197  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1344  elongation factor Ts  42.3 
 
 		 287 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  40.26 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  43.09 
 
 		 289 aa  195  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  42.42 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  40.92 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  40.92 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  40.07 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  42.68 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  41.29 
 
 		 311 aa  190  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0976  elongation factor Ts  39.8 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120791  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  41.03 
 
 		 292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  43.37 
 
 		 292 aa  189  4e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  40.85 
 
 		 292 aa  187  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  42.61 
 
 		 278 aa  188  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1102  elongation factor Ts  40.98 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.433956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  40.85 
 
 		 292 aa  187  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1370  elongation factor Ts  41.1 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  41.08 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  41.29 
 
 		 303 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  40.85 
 
 		 292 aa  186  4e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  42.48 
 
 		 291 aa  186  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  42.9 
 
 		 303 aa  186  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  42.9 
 
 		 303 aa  185  8e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>