More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0461 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  100 
 
 		 307 aa  606  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1370  elongation factor Ts  73.81 
 
 		 308 aa  397  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1959  elongation factor Ts  70.81 
 
 		 308 aa  392  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  59.74 
 
 		 309 aa  332  4e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  59.4 
 
 		 301 aa  322  5e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  56.82 
 
 		 308 aa  321  8e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  55.19 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  54.1 
 
 		 308 aa  318  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  53.77 
 
 		 308 aa  318  6e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  54.61 
 
 		 308 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  55.84 
 
 		 308 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  56.07 
 
 		 301 aa  317  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  59.2 
 
 		 296 aa  316  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  55.41 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  52.53 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  53.72 
 
 		 300 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  57.1 
 
 		 310 aa  309  4e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  53.2 
 
 		 307 aa  309  4e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  54.43 
 
 		 308 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  59.21 
 
 		 291 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  52.2 
 
 		 307 aa  305  9.000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  53.9 
 
 		 312 aa  304  1.0000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  53.25 
 
 		 312 aa  303  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  52.94 
 
 		 303 aa  298  9e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3195  translation elongation factor Ts  55.84 
 
 		 308 aa  296  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  55.23 
 
 		 310 aa  295  6e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2034  elongation factor Ts  57.7 
 
 		 306 aa  293  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0653103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2074  elongation factor Ts  57.05 
 
 		 306 aa  291  7e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0812187  normal  0.288352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2348  elongation factor Ts  57.05 
 
 		 306 aa  291  7e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.474929 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  59.21 
 
 		 291 aa  291  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4828  elongation factor Ts  56.31 
 
 		 307 aa  289  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0383674  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1697  elongation factor Ts  56.63 
 
 		 307 aa  287  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  52.77 
 
 		 307 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2224  elongation factor Ts  53.33 
 
 		 310 aa  285  5e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  53.44 
 
 		 291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  53.27 
 
 		 305 aa  282  6.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  53.27 
 
 		 305 aa  282  6.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4438  elongation factor Ts  55.37 
 
 		 307 aa  279  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000816473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3449  elongation factor Ts  54.93 
 
 		 308 aa  278  8e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190771  normal  0.488523 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1511  elongation factor Ts  57.37 
 
 		 298 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501204  normal  0.0222785 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2861  elongation factor Ts  56.73 
 
 		 298 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  51.61 
 
 		 303 aa  264  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1432  elongation factor Ts  56.73 
 
 		 298 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  hitchhiker  0.00915816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  47.85 
 
 		 311 aa  242  7e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  45.42 
 
 		 294 aa  239  5.999999999999999e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  45.16 
 
 		 294 aa  236  4e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  46.18 
 
 		 292 aa  229  3e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  44.97 
 
 		 292 aa  229  4e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0516  elongation factor Ts  40.99 
 
 		 288 aa  229  5e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.203151  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  44.66 
 
 		 292 aa  229  5e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  44.66 
 
 		 292 aa  229  5e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0515  elongation factor Ts  41.73 
 
 		 288 aa  227  2e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  45.28 
 
 		 292 aa  226  5.0000000000000005e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  44.81 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  48.36 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  50 
 
 		 291 aa  223  4e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  48.03 
 
 		 303 aa  222  6e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  45.31 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  45.16 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  46.86 
 
 		 294 aa  219  5e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  44.19 
 
 		 302 aa  219  5e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  45.75 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  46.08 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  43.46 
 
 		 289 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  44.52 
 
 		 290 aa  216  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  46.91 
 
 		 293 aa  215  8e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  46.08 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  46.31 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  46.38 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  46.96 
 
 		 286 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  41.9 
 
 		 313 aa  212  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  45.75 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  45.64 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  45.42 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  46.31 
 
 		 293 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  45.42 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  45.42 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  45.42 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  46.31 
 
 		 293 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  44.33 
 
 		 290 aa  211  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  46.31 
 
 		 293 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  45.42 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  46.31 
 
 		 294 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  46.31 
 
 		 293 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  46.31 
 
 		 293 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  46.31 
 
 		 293 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  45.75 
 
 		 289 aa  210  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  45.24 
 
 		 288 aa  209  4e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  45.42 
 
 		 295 aa  209  5e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0407  translation elongation factor Ts  41.44 
 
 		 355 aa  209  5e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  44.97 
 
 		 293 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  45.3 
 
 		 293 aa  209  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  45.97 
 
 		 293 aa  209  7e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  45.42 
 
 		 295 aa  208  9e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  45.42 
 
 		 295 aa  208  9e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  42.05 
 
 		 291 aa  207  1e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1196  elongation factor Ts  38.29 
 
 		 357 aa  208  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  46.98 
 
 		 293 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  46.98 
 
 		 293 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1441  elongation factor Ts  38.1 
 
 		 354 aa  207  1e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>