More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1370 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1370  elongation factor Ts  100 
 
 
308 aa  603  1.0000000000000001e-171  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  74.42 
 
 
307 aa  429  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1959  elongation factor Ts  70.07 
 
 
308 aa  383  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  58.28 
 
 
309 aa  311  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  55.12 
 
 
303 aa  310  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  54.46 
 
 
308 aa  307  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  55.96 
 
 
308 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  55.96 
 
 
308 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  56.04 
 
 
310 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  53.25 
 
 
312 aa  300  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  53.62 
 
 
301 aa  299  4e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  52.77 
 
 
312 aa  298  8e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  52.35 
 
 
307 aa  295  7e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  51.68 
 
 
307 aa  294  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  52.82 
 
 
300 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  56.62 
 
 
296 aa  290  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  52.6 
 
 
308 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  52.92 
 
 
308 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  53.87 
 
 
310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  52.15 
 
 
307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  51.79 
 
 
308 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  51.82 
 
 
307 aa  280  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2034  elongation factor Ts  55.63 
 
 
306 aa  278  8e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0653103 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  49.33 
 
 
307 aa  275  7e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3449  elongation factor Ts  54.75 
 
 
308 aa  275  7e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190771  normal  0.488523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1697  elongation factor Ts  56.25 
 
 
307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  55.74 
 
 
291 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4828  elongation factor Ts  55.78 
 
 
307 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0383674  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2348  elongation factor Ts  54.64 
 
 
306 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.474929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2074  elongation factor Ts  54.64 
 
 
306 aa  273  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0812187  normal  0.288352 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  54.92 
 
 
301 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  51.52 
 
 
305 aa  271  9e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  51.52 
 
 
305 aa  271  9e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4438  elongation factor Ts  55.22 
 
 
307 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000816473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  50.81 
 
 
308 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3195  translation elongation factor Ts  52.2 
 
 
308 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  51.15 
 
 
303 aa  265  8.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2224  elongation factor Ts  52.03 
 
 
310 aa  260  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  52.13 
 
 
291 aa  258  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  56.29 
 
 
291 aa  256  4e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  47.5 
 
 
311 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0515  elongation factor Ts  45.49 
 
 
288 aa  246  4e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1511  elongation factor Ts  54.37 
 
 
298 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501204  normal  0.0222785 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  48.67 
 
 
292 aa  241  2e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2861  elongation factor Ts  53.4 
 
 
298 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1432  elongation factor Ts  53.4 
 
 
298 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  hitchhiker  0.00915816 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0516  elongation factor Ts  44.4 
 
 
288 aa  235  8e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.203151  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  44.59 
 
 
294 aa  235  9e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  43.81 
 
 
310 aa  228  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  47.02 
 
 
292 aa  228  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  43.28 
 
 
289 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  45.28 
 
 
292 aa  225  6e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  44.77 
 
 
292 aa  225  8e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  44.77 
 
 
292 aa  225  8e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  45.9 
 
 
303 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  45.9 
 
 
303 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  46.23 
 
 
293 aa  223  3e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  44.48 
 
 
294 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  45.45 
 
 
293 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  47.52 
 
 
285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  44.14 
 
 
292 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  44.95 
 
 
278 aa  220  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  48.04 
 
 
285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  48.04 
 
 
285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  48.04 
 
 
285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  45.95 
 
 
293 aa  219  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  46.2 
 
 
294 aa  218  7e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  46.69 
 
 
312 aa  218  7.999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  47.52 
 
 
285 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  43.91 
 
 
292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  44.48 
 
 
288 aa  216  4e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_002978  WD0531  elongation factor Ts  40.62 
 
 
286 aa  215  8e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  45.79 
 
 
293 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  45.57 
 
 
299 aa  212  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  45.45 
 
 
293 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  43.92 
 
 
293 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  41.72 
 
 
292 aa  212  7e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0839  elongation factor Ts  36.67 
 
 
352 aa  211  1e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0656173  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  43.92 
 
 
292 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0407  translation elongation factor Ts  41.53 
 
 
355 aa  211  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  43.92 
 
 
294 aa  210  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  45.45 
 
 
293 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  43.67 
 
 
283 aa  210  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  40.26 
 
 
313 aa  210  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  45.45 
 
 
293 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  42.81 
 
 
276 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  41.72 
 
 
292 aa  209  4e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  44.11 
 
 
292 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  45.1 
 
 
272 aa  209  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  43.92 
 
 
293 aa  209  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  43.67 
 
 
283 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  43.67 
 
 
283 aa  209  6e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  43.67 
 
 
283 aa  209  6e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  43.67 
 
 
283 aa  209  6e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  43.67 
 
 
283 aa  209  6e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  43.67 
 
 
283 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  43.67 
 
 
283 aa  209  6e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  43.67 
 
 
283 aa  209  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  43.67 
 
 
283 aa  209  6e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  45.45 
 
 
293 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>