More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1953 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  100 
 
 		 303 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  99.67 
 
 		 303 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  55.37 
 
 		 310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  51.34 
 
 		 311 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  54.39 
 
 		 293 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  50.33 
 
 		 303 aa  293  3e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  53.67 
 
 		 299 aa  286  4e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  55.07 
 
 		 293 aa  285  5e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  52.03 
 
 		 289 aa  275  8e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  50.51 
 
 		 294 aa  271  9e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  44.21 
 
 		 288 aa  269  2.9999999999999997e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  51.85 
 
 		 294 aa  266  4e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  50 
 
 		 292 aa  262  4e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  45.45 
 
 		 288 aa  261  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  46.49 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  50.17 
 
 		 303 aa  259  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  48.25 
 
 		 288 aa  259  5.0000000000000005e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  48.65 
 
 		 291 aa  258  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  46.45 
 
 		 312 aa  258  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  51.84 
 
 		 294 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  47.97 
 
 		 292 aa  255  5e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  47.99 
 
 		 302 aa  255  5e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  47.59 
 
 		 312 aa  255  6e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  51.18 
 
 		 292 aa  255  8e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  45.7 
 
 		 300 aa  254  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  47.3 
 
 		 286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  48.04 
 
 		 301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  50.17 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  47.64 
 
 		 292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  50.84 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  50.17 
 
 		 290 aa  253  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  49.83 
 
 		 292 aa  253  3e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  48.31 
 
 		 292 aa  252  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  53.02 
 
 		 295 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  44.23 
 
 		 313 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  46.18 
 
 		 287 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  44.73 
 
 		 314 aa  250  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  52.68 
 
 		 295 aa  250  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  46.29 
 
 		 276 aa  249  3e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  46.98 
 
 		 307 aa  249  5e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  52.68 
 
 		 295 aa  248  7e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  52.68 
 
 		 295 aa  248  7e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  52.68 
 
 		 295 aa  248  7e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  52.68 
 
 		 295 aa  248  7e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  45.3 
 
 		 307 aa  248  7e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  52.68 
 
 		 295 aa  248  7e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  46.85 
 
 		 286 aa  248  7e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  45.45 
 
 		 292 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  45.45 
 
 		 292 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  43.83 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  52 
 
 		 295 aa  246  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  52 
 
 		 295 aa  246  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  43.83 
 
 		 308 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  52 
 
 		 295 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  48.36 
 
 		 307 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  52 
 
 		 295 aa  245  6e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  48.29 
 
 		 290 aa  245  8e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  48.68 
 
 		 309 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0404  elongation factor Ts  44.76 
 
 		 288 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  43.83 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  48.84 
 
 		 291 aa  243  3e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  48.18 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  44.25 
 
 		 288 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0407  translation elongation factor Ts  40.97 
 
 		 355 aa  242  5e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  45.12 
 
 		 310 aa  242  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  49.83 
 
 		 293 aa  242  6e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  44.44 
 
 		 307 aa  242  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  49.83 
 
 		 293 aa  242  6e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0550  elongation factor Ts  43.1 
 
 		 348 aa  241  7.999999999999999e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00242368  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  43.81 
 
 		 310 aa  241  9e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0839  elongation factor Ts  40.17 
 
 		 352 aa  241  1e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0656173  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  44.78 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  50.17 
 
 		 291 aa  240  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  44.48 
 
 		 308 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  50 
 
 		 267 aa  238  9e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  46.82 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  46.82 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1261  elongation factor Ts  41.93 
 
 		 354 aa  237  2e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00427037  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  49.17 
 
 		 291 aa  237  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0706  translation elongation factor Ts  48.44 
 
 		 290 aa  236  4e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000134038  unclonable  0.0000000259641 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  43.23 
 
 		 308 aa  236  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  47.95 
 
 		 293 aa  235  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  44.78 
 
 		 305 aa  235  8e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  44.78 
 
 		 305 aa  235  8e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4438  elongation factor Ts  48.66 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000816473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2074  elongation factor Ts  48.69 
 
 		 306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0812187  normal  0.288352 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3449  elongation factor Ts  47.25 
 
 		 308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190771  normal  0.488523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2348  elongation factor Ts  48.69 
 
 		 306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.474929 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  41.75 
 
 		 307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  44.22 
 
 		 308 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1441  elongation factor Ts  40.69 
 
 		 354 aa  233  3e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2034  elongation factor Ts  49.02 
 
 		 306 aa  232  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0653103 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  46.33 
 
 		 285 aa  232  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  46.92 
 
 		 292 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2009  elongation factor Ts  42.66 
 
 		 288 aa  232  6e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  46.58 
 
 		 293 aa  231  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  44.22 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0548  elongation factor Ts  40.34 
 
 		 357 aa  230  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  44.52 
 
 		 290 aa  230  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  47.65 
 
 		 301 aa  230  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>