More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0824 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  100 
 
 		 292 aa  585  1e-166  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  91.03 
 
 		 293 aa  505  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  91.03 
 
 		 293 aa  505  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  69.52 
 
 		 295 aa  388  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  69.86 
 
 		 295 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  69.52 
 
 		 295 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  69.86 
 
 		 295 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  69.18 
 
 		 295 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  69.18 
 
 		 295 aa  386  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  69.18 
 
 		 295 aa  386  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  69.18 
 
 		 295 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  69.18 
 
 		 295 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  68.84 
 
 		 295 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  68.84 
 
 		 295 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  66.1 
 
 		 294 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  64.04 
 
 		 294 aa  368  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  55.71 
 
 		 291 aa  333  3e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  52.74 
 
 		 291 aa  302  5.000000000000001e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  51.02 
 
 		 291 aa  279  5e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  50.34 
 
 		 292 aa  275  8e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0976  elongation factor Ts  50 
 
 		 292 aa  275  9e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120791  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  49.83 
 
 		 294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  50.68 
 
 		 289 aa  271  7e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  49.19 
 
 		 310 aa  271  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  51.19 
 
 		 299 aa  269  4e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  50.34 
 
 		 293 aa  269  5e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  50.52 
 
 		 294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  48.99 
 
 		 310 aa  265  7e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  48.99 
 
 		 305 aa  263  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  48.45 
 
 		 290 aa  264  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  48.99 
 
 		 305 aa  263  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  49 
 
 		 307 aa  263  3e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  48.33 
 
 		 307 aa  263  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  49.66 
 
 		 291 aa  261  8e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  47.28 
 
 		 296 aa  259  4e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  47.87 
 
 		 312 aa  258  7e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  48.97 
 
 		 292 aa  258  8e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  48.98 
 
 		 293 aa  258  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0372  elongation factor Ts  45.61 
 
 		 295 aa  258  1e-67  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  49.32 
 
 		 291 aa  256  4e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  47.44 
 
 		 289 aa  255  7e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  51.18 
 
 		 303 aa  254  8e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  51.18 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  48.29 
 
 		 292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  46.58 
 
 		 292 aa  253  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  46.58 
 
 		 292 aa  252  6e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  45.3 
 
 		 307 aa  251  7e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  48.77 
 
 		 290 aa  251  8.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  44.63 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  43.23 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  47.35 
 
 		 290 aa  249  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl560  elongation factor Ts  45.42 
 
 		 297 aa  249  5e-65  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  46.41 
 
 		 308 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  46.13 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  46.92 
 
 		 285 aa  246  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  47.02 
 
 		 283 aa  245  6e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  45.92 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  45.75 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  45.12 
 
 		 292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0802  elongation factor Ts  45.43 
 
 		 341 aa  243  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000434061  hitchhiker  0.00000000000000232724 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  45.12 
 
 		 292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  47.26 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  46.05 
 
 		 312 aa  243  3e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  45.89 
 
 		 285 aa  241  7e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  46.23 
 
 		 292 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  48.99 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  45.31 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  45.58 
 
 		 285 aa  236  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  45.58 
 
 		 285 aa  236  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  45.58 
 
 		 285 aa  236  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  40.27 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2454  elongation factor Ts  44.97 
 
 		 342 aa  231  2e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000114512  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  43.79 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  43.79 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  43.79 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  43.79 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  43.79 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  43.79 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  43.79 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  43.79 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  43.79 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  44.84 
 
 		 292 aa  229  4e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  44.17 
 
 		 292 aa  229  5e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  44.41 
 
 		 303 aa  229  6e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  44.48 
 
 		 309 aa  228  6e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  43.79 
 
 		 283 aa  228  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  43.79 
 
 		 283 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  43.79 
 
 		 283 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  43.2 
 
 		 296 aa  228  9e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  46.81 
 
 		 293 aa  228  9e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  43.79 
 
 		 283 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  43.79 
 
 		 283 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  43.2 
 
 		 296 aa  228  9e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  47.87 
 
 		 293 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  43.79 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3052  elongation factor Ts  47.2 
 
 		 287 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.204992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  47.87 
 
 		 293 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  43.52 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  47.7 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  46.45 
 
 		 293 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>