More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1279 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1279  elongation factor Ts  100 
 
 		 292 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.174908 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  89.53 
 
 		 292 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1343  elongation factor Ts  91.1 
 
 		 296 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.284901 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  82.73 
 
 		 292 aa  467  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  81.65 
 
 		 292 aa  463  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  77.34 
 
 		 294 aa  440  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  75.27 
 
 		 293 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  75.99 
 
 		 293 aa  435  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  75.99 
 
 		 293 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0508  elongation factor Ts  76.26 
 
 		 294 aa  432  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0459419  normal  0.717587 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  75.99 
 
 		 293 aa  427  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  76.34 
 
 		 293 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  76.34 
 
 		 293 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  76.34 
 
 		 293 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  75.27 
 
 		 293 aa  423  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  76.34 
 
 		 293 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  76.34 
 
 		 293 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  74.91 
 
 		 293 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  74.91 
 
 		 293 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  74.91 
 
 		 293 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  74.91 
 
 		 293 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  75.27 
 
 		 293 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  74.91 
 
 		 294 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4947  elongation factor Ts  74.91 
 
 		 298 aa  418  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725699 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  74.91 
 
 		 293 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  74.91 
 
 		 293 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1824  elongation factor Ts  74.2 
 
 		 298 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.31491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2584  elongation factor Ts  72.44 
 
 		 298 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.958437  normal  0.0691199 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1224  elongation factor Ts  72.44 
 
 		 298 aa  409  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0842617  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2694  elongation factor Ts  72.32 
 
 		 304 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129335  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1978  elongation factor Ts  72.85 
 
 		 302 aa  401  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0299771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2600  elongation factor Ts  69.86 
 
 		 307 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2849  elongation factor Ts  69.93 
 
 		 306 aa  388  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638263 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1759  elongation factor Ts  70.24 
 
 		 306 aa  383  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1990  elongation factor Ts  70.21 
 
 		 307 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404756  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1439  translation elongation factor Ts  65.75 
 
 		 308 aa  362  5.0000000000000005e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  60.71 
 
 		 290 aa  342  5e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  60.85 
 
 		 291 aa  332  4e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1743  elongation factor Ts  61.27 
 
 		 299 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  54.52 
 
 		 302 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2177  elongation factor Ts  58.8 
 
 		 298 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00688857  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  49.13 
 
 		 292 aa  270  1e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  50.52 
 
 		 293 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  49.48 
 
 		 289 aa  265  5.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  49.66 
 
 		 292 aa  262  4e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  48.03 
 
 		 292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  49.13 
 
 		 291 aa  252  4.0000000000000004e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  48.1 
 
 		 294 aa  249  6e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  48.29 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  46.71 
 
 		 290 aa  244  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0390  elongation factor Ts  47.06 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.432291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0351  elongation factor Ts  46.71 
 
 		 294 aa  239  5.999999999999999e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.556574  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  48.8 
 
 		 282 aa  236  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  46.74 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  46.39 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  49.3 
 
 		 285 aa  236  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  47.64 
 
 		 292 aa  235  6e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  47.9 
 
 		 285 aa  235  7e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  48.95 
 
 		 285 aa  233  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  48.95 
 
 		 285 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  48.95 
 
 		 285 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  48.59 
 
 		 283 aa  232  6e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  48.77 
 
 		 294 aa  232  7.000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  48.59 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  48.59 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  48.59 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  48.59 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  48.59 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  48.59 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  48.59 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  48.59 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  48.59 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  48.28 
 
 		 294 aa  229  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  46.5 
 
 		 292 aa  228  7e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  46.81 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  47.54 
 
 		 283 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  47.54 
 
 		 283 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  47.54 
 
 		 283 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  47.54 
 
 		 283 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  47.54 
 
 		 283 aa  225  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  47.54 
 
 		 283 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3359  elongation factor Ts  47.54 
 
 		 283 aa  225  8e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461306  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  46.98 
 
 		 303 aa  224  9e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  47.54 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1344  elongation factor Ts  46.94 
 
 		 287 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  47.93 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1535  translation elongation factor Ts  47.28 
 
 		 287 aa  222  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  45.27 
 
 		 296 aa  222  7e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  45.52 
 
 		 289 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1140  elongation factor Ts  45.52 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000133846  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  46.42 
 
 		 295 aa  219  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  46.13 
 
 		 303 aa  219  6e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  46.13 
 
 		 303 aa  218  7.999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  46.08 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  47.59 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  46.08 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  46.34 
 
 		 291 aa  217  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  45.73 
 
 		 291 aa  217  2e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  47.39 
 
 		 307 aa  216  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  45.73 
 
 		 295 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>