More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1142 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  100 
 
 		 294 aa  599  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  88.44 
 
 		 294 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  77.74 
 
 		 295 aa  441  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  77.4 
 
 		 295 aa  437  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  77.74 
 
 		 295 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  77.4 
 
 		 295 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  77.4 
 
 		 295 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  77.4 
 
 		 295 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  77.4 
 
 		 295 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  77.4 
 
 		 295 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  77.74 
 
 		 295 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  77.05 
 
 		 295 aa  437  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  76.37 
 
 		 295 aa  434  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  66.1 
 
 		 292 aa  369  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  66.32 
 
 		 293 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  66.32 
 
 		 293 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  56.4 
 
 		 291 aa  338  5.9999999999999996e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0976  elongation factor Ts  56.21 
 
 		 292 aa  311  9e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120791  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  53.42 
 
 		 291 aa  307  1.0000000000000001e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  52.72 
 
 		 293 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  52.22 
 
 		 294 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  50.34 
 
 		 292 aa  282  4.0000000000000003e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  50 
 
 		 292 aa  281  7.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  50.5 
 
 		 299 aa  280  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  50.49 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  50 
 
 		 289 aa  278  6e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  46.51 
 
 		 311 aa  277  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  51.7 
 
 		 296 aa  273  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  52.04 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  50.34 
 
 		 292 aa  269  4e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  49.83 
 
 		 290 aa  269  5e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  49.66 
 
 		 294 aa  268  7e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  48 
 
 		 303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  49.49 
 
 		 292 aa  266  4e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl560  elongation factor Ts  46.44 
 
 		 297 aa  260  2e-68  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  50.17 
 
 		 292 aa  259  4e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  50.17 
 
 		 292 aa  259  4e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  47.96 
 
 		 291 aa  257  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0372  elongation factor Ts  45.27 
 
 		 295 aa  258  1e-67  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  51.37 
 
 		 291 aa  258  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  51.84 
 
 		 303 aa  256  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  51.84 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  48.36 
 
 		 312 aa  256  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  48.63 
 
 		 291 aa  253  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  47.99 
 
 		 289 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  46.92 
 
 		 292 aa  253  3e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  47.7 
 
 		 290 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  46.64 
 
 		 310 aa  251  7e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  46.64 
 
 		 292 aa  251  7e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  49.66 
 
 		 285 aa  251  9.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  46.98 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1048  elongation factor Ts  51.69 
 
 		 269 aa  251  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0760308  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  50 
 
 		 283 aa  249  3e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  45.18 
 
 		 312 aa  249  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  46.67 
 
 		 308 aa  248  9e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  48.44 
 
 		 294 aa  246  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  46.67 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  49.66 
 
 		 291 aa  246  3e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  48.64 
 
 		 285 aa  246  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1102  elongation factor Ts  47.32 
 
 		 287 aa  246  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.433956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  46.56 
 
 		 303 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  46.84 
 
 		 308 aa  245  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  47 
 
 		 308 aa  245  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  47.37 
 
 		 290 aa  244  9e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  45.97 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1535  translation elongation factor Ts  47.14 
 
 		 287 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  45.63 
 
 		 313 aa  244  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  45.58 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  45.67 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  45.97 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  44.77 
 
 		 276 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  48.65 
 
 		 285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  48.65 
 
 		 285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  48.65 
 
 		 285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1344  elongation factor Ts  47.14 
 
 		 287 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  45.13 
 
 		 312 aa  242  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  48.12 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  45.75 
 
 		 307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3052  elongation factor Ts  48.1 
 
 		 287 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.204992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38980  elongation factor Ts  47.77 
 
 		 289 aa  238  8e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  45.55 
 
 		 292 aa  237  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  45.63 
 
 		 309 aa  236  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1273  elongation factor Ts  45.39 
 
 		 286 aa  236  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00309579  normal  0.676189 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  45.82 
 
 		 267 aa  236  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4185  elongation factor Ts  46.53 
 
 		 287 aa  235  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  47.42 
 
 		 301 aa  235  7e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1592  elongation factor Ts  46.18 
 
 		 287 aa  235  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1147  elongation factor Ts  46.53 
 
 		 287 aa  234  9e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  46.92 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  46.92 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  46.92 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  46.92 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  44.84 
 
 		 292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  46.23 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  46.23 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  46.23 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  46.23 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  46.23 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  46.23 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  46.23 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>