More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2038 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  100 
 
 
293 aa  583  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  100 
 
 
293 aa  583  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  100 
 
 
293 aa  583  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  99.32 
 
 
293 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  99.32 
 
 
293 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  98.98 
 
 
293 aa  579  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  91.4 
 
 
293 aa  525  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  91.76 
 
 
293 aa  522  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  91.04 
 
 
293 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  91.04 
 
 
294 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  91.04 
 
 
293 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  91.04 
 
 
293 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  91.04 
 
 
293 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  91.04 
 
 
293 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  89.61 
 
 
293 aa  517  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  91.04 
 
 
293 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  90.68 
 
 
293 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  87.1 
 
 
293 aa  498  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  79.21 
 
 
292 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  79.21 
 
 
292 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  77.42 
 
 
292 aa  434  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  75.63 
 
 
294 aa  430  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0508  elongation factor Ts  74.91 
 
 
294 aa  426  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0459419  normal  0.717587 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1279  elongation factor Ts  76.34 
 
 
292 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.174908 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1824  elongation factor Ts  72.98 
 
 
298 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.31491  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1978  elongation factor Ts  72.28 
 
 
302 aa  403  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0299771 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4947  elongation factor Ts  71.23 
 
 
298 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.725699 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1343  elongation factor Ts  74.56 
 
 
296 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.284901 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1224  elongation factor Ts  71.23 
 
 
298 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0842617  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2584  elongation factor Ts  71.23 
 
 
298 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.958437  normal  0.0691199 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2849  elongation factor Ts  68.73 
 
 
306 aa  381  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638263 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2694  elongation factor Ts  67.7 
 
 
304 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129335  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2600  elongation factor Ts  66.21 
 
 
307 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1759  elongation factor Ts  67.35 
 
 
306 aa  363  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  61.92 
 
 
290 aa  359  3e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1439  translation elongation factor Ts  64.85 
 
 
308 aa  357  9.999999999999999e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  62.28 
 
 
291 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1743  elongation factor Ts  65.14 
 
 
299 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1990  elongation factor Ts  65.19 
 
 
307 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404756  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  56.86 
 
 
302 aa  334  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2177  elongation factor Ts  62.68 
 
 
298 aa  333  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00688857  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  50.17 
 
 
292 aa  282  4.0000000000000003e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  50.52 
 
 
293 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  49.66 
 
 
292 aa  275  7e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  48.78 
 
 
291 aa  275  9e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  48.78 
 
 
289 aa  271  9e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  50.17 
 
 
294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  49.66 
 
 
293 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  48.28 
 
 
290 aa  260  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  47.5 
 
 
292 aa  254  8e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  47.55 
 
 
292 aa  253  3e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0390  elongation factor Ts  48.62 
 
 
294 aa  252  5.000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.432291  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0351  elongation factor Ts  47.93 
 
 
294 aa  249  3e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.556574  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  48.59 
 
 
294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  47.39 
 
 
285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  48.08 
 
 
285 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  44.83 
 
 
292 aa  240  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  44.48 
 
 
292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  48.43 
 
 
285 aa  237  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  48.43 
 
 
285 aa  237  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  48.43 
 
 
285 aa  237  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  47.72 
 
 
283 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  47.72 
 
 
283 aa  237  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  47.72 
 
 
283 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  47.72 
 
 
283 aa  237  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  47.72 
 
 
283 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  47.72 
 
 
283 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  47.72 
 
 
283 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  47.72 
 
 
283 aa  237  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  47.72 
 
 
283 aa  237  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  47.08 
 
 
283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  46.31 
 
 
303 aa  233  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  47.37 
 
 
283 aa  233  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  43.68 
 
 
290 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  46.67 
 
 
283 aa  232  7.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3359  elongation factor Ts  47.02 
 
 
283 aa  231  7.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461306  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  47.02 
 
 
283 aa  231  8.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  46.67 
 
 
283 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  46.67 
 
 
283 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  46.67 
 
 
283 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  46.67 
 
 
283 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  46.67 
 
 
283 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  47.24 
 
 
289 aa  230  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1344  elongation factor Ts  46.94 
 
 
287 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  46.15 
 
 
292 aa  228  7e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  48.97 
 
 
294 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  46.15 
 
 
292 aa  226  4e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  46.37 
 
 
282 aa  225  6e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  46.4 
 
 
278 aa  224  9e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1535  translation elongation factor Ts  46.26 
 
 
287 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  43.84 
 
 
296 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  43.84 
 
 
296 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  46.38 
 
 
271 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  43.81 
 
 
311 aa  223  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  46.8 
 
 
303 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  47.78 
 
 
290 aa  222  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  42.86 
 
 
294 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  46.8 
 
 
303 aa  222  6e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  47.59 
 
 
295 aa  222  6e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  45.29 
 
 
292 aa  221  9e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>