More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01131 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  100 
 
 		 292 aa  574  1.0000000000000001e-163  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  81.51 
 
 		 292 aa  462  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  80.82 
 
 		 292 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1265  elongation factor Ts  73.96 
 
 		 291 aa  400  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  57.29 
 
 		 292 aa  311  5.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  56.31 
 
 		 294 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  56.75 
 
 		 289 aa  305  6e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  55.48 
 
 		 292 aa  299  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  56.31 
 
 		 293 aa  298  5e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  54.14 
 
 		 291 aa  298  8e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  53.61 
 
 		 293 aa  281  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  52.07 
 
 		 290 aa  272  4.0000000000000004e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  52.31 
 
 		 290 aa  270  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  53.68 
 
 		 290 aa  268  5.9999999999999995e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  50.69 
 
 		 292 aa  268  7e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  53.02 
 
 		 292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  50.35 
 
 		 292 aa  265  5e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0390  elongation factor Ts  51.37 
 
 		 294 aa  265  5e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.432291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  52.45 
 
 		 285 aa  265  7e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  52.1 
 
 		 285 aa  259  4e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0351  elongation factor Ts  50.34 
 
 		 294 aa  259  5.0000000000000005e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.556574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  50 
 
 		 292 aa  257  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  50.51 
 
 		 292 aa  255  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  49.1 
 
 		 293 aa  255  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  50.51 
 
 		 292 aa  255  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  47.64 
 
 		 302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  48.03 
 
 		 293 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  52.63 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  52.63 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  52.63 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  50.35 
 
 		 283 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  50.35 
 
 		 283 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  50.35 
 
 		 283 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  50.35 
 
 		 283 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  50.35 
 
 		 283 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  50.35 
 
 		 283 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  50.35 
 
 		 283 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  50.35 
 
 		 283 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  50.35 
 
 		 283 aa  252  5.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  48.28 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  49.13 
 
 		 294 aa  251  1e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  48.28 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  50.68 
 
 		 289 aa  251  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  50.35 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  48.94 
 
 		 283 aa  249  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  49.65 
 
 		 283 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  47.31 
 
 		 293 aa  248  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  46.95 
 
 		 293 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  49.65 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  49.65 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  49.65 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  50.35 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  49.65 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3359  elongation factor Ts  50.35 
 
 		 283 aa  247  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461306  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  46.95 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  46.95 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  49.65 
 
 		 291 aa  246  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  46.95 
 
 		 293 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  46.95 
 
 		 293 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  46.95 
 
 		 293 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  46.24 
 
 		 293 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  47.12 
 
 		 291 aa  244  9e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  46.24 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  46.24 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  46.59 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  46.24 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  46.24 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  46.24 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  46.24 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  46.24 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  48.14 
 
 		 291 aa  240  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  48.03 
 
 		 292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  49.31 
 
 		 283 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3052  elongation factor Ts  48.93 
 
 		 287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.204992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  46.98 
 
 		 296 aa  239  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  49.83 
 
 		 291 aa  238  8e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  46.77 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1344  elongation factor Ts  47.39 
 
 		 287 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  45.76 
 
 		 294 aa  236  4e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  48.26 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1535  translation elongation factor Ts  47.04 
 
 		 287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1102  elongation factor Ts  47.55 
 
 		 287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.433956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  46.59 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  46.81 
 
 		 290 aa  233  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4081  elongation factor Ts  47.31 
 
 		 287 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38980  elongation factor Ts  48.94 
 
 		 289 aa  232  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1592  elongation factor Ts  46.95 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4185  elongation factor Ts  46.95 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1140  elongation factor Ts  51.39 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000133846  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1147  elongation factor Ts  46.95 
 
 		 287 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1511  elongation factor Ts  49.66 
 
 		 298 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501204  normal  0.0222785 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  44.82 
 
 		 307 aa  229  6e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  50.67 
 
 		 303 aa  228  9e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2861  elongation factor Ts  49.33 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1432  elongation factor Ts  49.33 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  hitchhiker  0.00915816 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1273  elongation factor Ts  50 
 
 		 286 aa  226  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00309579  normal  0.676189 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  45.17 
 
 		 292 aa  227  2e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1484  elongation factor Ts  49.29 
 
 		 289 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113842  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  45.86 
 
 		 312 aa  226  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17070  elongation factor Ts  49.29 
 
 		 289 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>