More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1549 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  100 
 
 		 291 aa  568  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  79.73 
 
 		 291 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  76.98 
 
 		 291 aa  441  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  72.88 
 
 		 296 aa  413  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1432  elongation factor Ts  73.83 
 
 		 298 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  hitchhiker  0.00915816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2861  elongation factor Ts  73.83 
 
 		 298 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1511  elongation factor Ts  73.83 
 
 		 298 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501204  normal  0.0222785 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  59.02 
 
 		 308 aa  324  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  58.64 
 
 		 310 aa  318  7.999999999999999e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  57.91 
 
 		 307 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  58.36 
 
 		 308 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  58.03 
 
 		 308 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  56.61 
 
 		 305 aa  309  4e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  56.61 
 
 		 305 aa  309  4e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  55.22 
 
 		 307 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  59.21 
 
 		 307 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  53.58 
 
 		 307 aa  295  5e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  54.27 
 
 		 307 aa  293  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  54.21 
 
 		 307 aa  293  3e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  54.33 
 
 		 308 aa  292  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  57.43 
 
 		 312 aa  291  7e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  54.79 
 
 		 312 aa  288  6e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  55.78 
 
 		 301 aa  286  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  53.67 
 
 		 308 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  54.67 
 
 		 308 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  53.4 
 
 		 300 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  52.94 
 
 		 283 aa  280  3e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  54.18 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  50.51 
 
 		 292 aa  277  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  52.56 
 
 		 303 aa  277  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  51.03 
 
 		 291 aa  271  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  52.35 
 
 		 310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3195  translation elongation factor Ts  56.76 
 
 		 308 aa  268  5.9999999999999995e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  49.48 
 
 		 290 aa  267  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  51.76 
 
 		 283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  51.76 
 
 		 283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  51.76 
 
 		 283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  51.76 
 
 		 283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  51.76 
 
 		 283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  51.76 
 
 		 283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  51.76 
 
 		 283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  49.32 
 
 		 292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  51.76 
 
 		 283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  51.76 
 
 		 283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  51.06 
 
 		 283 aa  266  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  51.41 
 
 		 283 aa  265  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  51.41 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  51.41 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  51.41 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  51.41 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  51.72 
 
 		 285 aa  263  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  49.13 
 
 		 289 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  51.72 
 
 		 285 aa  263  3e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  51.72 
 
 		 285 aa  263  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  52.79 
 
 		 309 aa  262  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  54.86 
 
 		 301 aa  259  4e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  50.69 
 
 		 285 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  49.65 
 
 		 283 aa  258  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  48.51 
 
 		 294 aa  256  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  50.35 
 
 		 285 aa  256  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  49.66 
 
 		 293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  51.2 
 
 		 294 aa  253  3e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3359  elongation factor Ts  48.94 
 
 		 283 aa  251  7e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  48.6 
 
 		 283 aa  251  8.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  47.7 
 
 		 290 aa  250  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  49.83 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  50.34 
 
 		 293 aa  249  3e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1959  elongation factor Ts  55.25 
 
 		 308 aa  248  8e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  48.81 
 
 		 292 aa  246  4e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  46.64 
 
 		 292 aa  243  3e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  48.77 
 
 		 282 aa  243  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  47.96 
 
 		 292 aa  242  5e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  51.37 
 
 		 294 aa  242  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1370  elongation factor Ts  55.56 
 
 		 308 aa  242  6e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  49.66 
 
 		 290 aa  240  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  50.82 
 
 		 303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  46.33 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  47.6 
 
 		 302 aa  236  3e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2034  elongation factor Ts  53.49 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0653103 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4828  elongation factor Ts  51.96 
 
 		 307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0383674  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  50 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1697  elongation factor Ts  51.96 
 
 		 307 aa  232  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2074  elongation factor Ts  53.82 
 
 		 306 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0812187  normal  0.288352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2348  elongation factor Ts  53.82 
 
 		 306 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.474929 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3449  elongation factor Ts  53.95 
 
 		 308 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190771  normal  0.488523 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0390  elongation factor Ts  46.71 
 
 		 294 aa  231  8.000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.432291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  49.66 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  48.68 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  48.99 
 
 		 292 aa  231  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  43.75 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  49.33 
 
 		 295 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  50 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1535  translation elongation factor Ts  45.33 
 
 		 287 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  43.75 
 
 		 292 aa  229  3e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1265  elongation factor Ts  47.46 
 
 		 291 aa  229  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3052  elongation factor Ts  44.76 
 
 		 287 aa  229  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.204992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  46.96 
 
 		 310 aa  229  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1140  elongation factor Ts  48.81 
 
 		 283 aa  229  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000133846  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  45.74 
 
 		 292 aa  229  4e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  48.99 
 
 		 295 aa  228  6e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>