More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1211 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  100 
 
 		 291 aa  567  1e-161  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  79.73 
 
 		 291 aa  436  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  76.29 
 
 		 291 aa  437  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  70.51 
 
 		 296 aa  393  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2861  elongation factor Ts  71.81 
 
 		 298 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1432  elongation factor Ts  71.81 
 
 		 298 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  hitchhiker  0.00915816 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1511  elongation factor Ts  71.14 
 
 		 298 aa  374  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501204  normal  0.0222785 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  59.34 
 
 		 308 aa  329  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  59.48 
 
 		 310 aa  324  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  59.93 
 
 		 307 aa  321  7e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  56.95 
 
 		 305 aa  318  6e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  56.95 
 
 		 305 aa  318  6e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  59.67 
 
 		 308 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  59.67 
 
 		 308 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  57.24 
 
 		 307 aa  316  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  59.21 
 
 		 307 aa  306  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  55.37 
 
 		 307 aa  300  2e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  54.97 
 
 		 308 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  57.34 
 
 		 307 aa  296  3e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  56.31 
 
 		 307 aa  296  3e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  56.52 
 
 		 308 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  53.31 
 
 		 308 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  56.86 
 
 		 312 aa  293  2e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  54.46 
 
 		 312 aa  287  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  57.28 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  54.73 
 
 		 301 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  55.22 
 
 		 300 aa  280  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  50.51 
 
 		 292 aa  280  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3195  translation elongation factor Ts  57.05 
 
 		 308 aa  275  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  51.84 
 
 		 294 aa  275  5e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  57.64 
 
 		 301 aa  275  8e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  51.62 
 
 		 303 aa  270  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  51.89 
 
 		 283 aa  264  2e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  49.83 
 
 		 289 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  48.61 
 
 		 290 aa  261  8.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  50.53 
 
 		 283 aa  259  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  52.68 
 
 		 310 aa  257  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  49.82 
 
 		 283 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  50.18 
 
 		 283 aa  256  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  50.18 
 
 		 283 aa  256  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  50.18 
 
 		 283 aa  256  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  50.18 
 
 		 283 aa  256  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  50.18 
 
 		 283 aa  256  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  50.18 
 
 		 283 aa  256  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  50.18 
 
 		 283 aa  256  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  50.18 
 
 		 283 aa  256  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1959  elongation factor Ts  54.58 
 
 		 308 aa  256  3e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  50.18 
 
 		 283 aa  256  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  51.55 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  49.65 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  49.65 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  49.65 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  49.82 
 
 		 283 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  49.82 
 
 		 283 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  49.82 
 
 		 283 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  49.82 
 
 		 283 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  48.62 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  49.47 
 
 		 283 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  48.95 
 
 		 285 aa  249  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  47.9 
 
 		 285 aa  248  7e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  46.94 
 
 		 292 aa  247  1e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  51.83 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  48.81 
 
 		 294 aa  246  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  49.15 
 
 		 292 aa  245  6.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1370  elongation factor Ts  54.88 
 
 		 308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  51.37 
 
 		 294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  48.07 
 
 		 283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3359  elongation factor Ts  48.95 
 
 		 283 aa  243  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461306  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  47.8 
 
 		 292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3449  elongation factor Ts  55.23 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190771  normal  0.488523 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  46.64 
 
 		 292 aa  240  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  48.14 
 
 		 292 aa  240  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  49.67 
 
 		 303 aa  238  9e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  47.32 
 
 		 293 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  49.66 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  44.88 
 
 		 290 aa  237  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  48.63 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  49.66 
 
 		 295 aa  236  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  49.66 
 
 		 295 aa  236  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  47.95 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2034  elongation factor Ts  54.1 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0653103 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  49.33 
 
 		 295 aa  235  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  49.33 
 
 		 295 aa  235  7e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  49.33 
 
 		 295 aa  235  7e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  49.33 
 
 		 295 aa  235  7e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  49.33 
 
 		 295 aa  235  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  51.37 
 
 		 294 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2074  elongation factor Ts  54.07 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0812187  normal  0.288352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1697  elongation factor Ts  54.22 
 
 		 307 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  48.99 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  48.99 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2348  elongation factor Ts  54.07 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.474929 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  49.32 
 
 		 292 aa  232  6e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  45.82 
 
 		 291 aa  231  9e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  48.25 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4828  elongation factor Ts  52.77 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0383674  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  46.89 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  46.53 
 
 		 290 aa  229  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  47.28 
 
 		 292 aa  229  6e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4438  elongation factor Ts  52.36 
 
 		 307 aa  228  7e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000816473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>