More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3036 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3036  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  100 
 
 		 278 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00138132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4744  translation elongation factor Ts  67.52 
 
 		 277 aa  374  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3494  translation elongation factor Ts  67.15 
 
 		 278 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000803049  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  59.86 
 
 		 279 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0049  translation elongation factor Ts  52.21 
 
 		 277 aa  289  3e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  46.38 
 
 		 276 aa  258  6e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0883  translation elongation factor Ts  49.28 
 
 		 275 aa  257  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0378  elongation factor Ts  46.93 
 
 		 274 aa  237  1e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2352  elongation factor Ts  41.96 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000872397  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1647  elongation factor Ts  41.32 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  43.51 
 
 		 288 aa  206  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  42.55 
 
 		 278 aa  206  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  38.46 
 
 		 288 aa  203  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0404  elongation factor Ts  39.86 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  38.11 
 
 		 288 aa  200  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  42.2 
 
 		 272 aa  199  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2009  elongation factor Ts  37.76 
 
 		 288 aa  198  7e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  39.37 
 
 		 288 aa  196  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  42.03 
 
 		 311 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12260  translation elongation factor Ts  41.87 
 
 		 288 aa  192  5e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000728312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  43.68 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  39.72 
 
 		 278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  42.14 
 
 		 275 aa  189  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5910  translation elongation factor Ts  42.86 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0273949  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  38.21 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  41.16 
 
 		 296 aa  186  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  38.3 
 
 		 278 aa  186  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  40.28 
 
 		 303 aa  185  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  40.5 
 
 		 303 aa  185  9e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  41.01 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  40.14 
 
 		 303 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  38.65 
 
 		 277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2177  elongation factor Ts  43.27 
 
 		 298 aa  183  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00688857  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  41.52 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  39.71 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  39.04 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  38.3 
 
 		 277 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  38.91 
 
 		 294 aa  182  6e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  42.37 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  41.52 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  40.07 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1231  elongation factor Ts  41.96 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442239  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2199  translation elongation factor Ts  40.78 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  43.13 
 
 		 291 aa  180  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  40.07 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  41.98 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  41.98 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  41.98 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  41.98 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  41.98 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  41.98 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  41.98 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  42.37 
 
 		 293 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  39.71 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  39.71 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  39.71 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  38.18 
 
 		 292 aa  177  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  39.71 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  39.71 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  40.14 
 
 		 291 aa  177  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1323  elongation factor Ts  41.61 
 
 		 275 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  39.79 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  38.6 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1104  translation elongation factor Ts  43.51 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  40.79 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  38.18 
 
 		 292 aa  176  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  40.31 
 
 		 292 aa  176  3e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  38.41 
 
 		 292 aa  176  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  38.95 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  39.51 
 
 		 287 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  37.91 
 
 		 294 aa  176  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1048  elongation factor Ts  38.6 
 
 		 269 aa  176  5e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0760308  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2210  elongation factor Ts  42.55 
 
 		 271 aa  175  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126056  normal  0.227569 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1669  translation elongation factor Ts  41.49 
 
 		 274 aa  175  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1743  elongation factor Ts  44.2 
 
 		 299 aa  175  7e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  42.8 
 
 		 308 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4132  elongation factor Ts  42.91 
 
 		 271 aa  175  9e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.367953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1609  translation elongation factor Ts  36.2 
 
 		 320 aa  175  9e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00132099  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  37.88 
 
 		 286 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  36.52 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  39.79 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  40.07 
 
 		 295 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0724  translation elongation factor Ts  36.2 
 
 		 320 aa  173  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  39.71 
 
 		 295 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  41.98 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  38.49 
 
 		 273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  41.6 
 
 		 293 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12903  elongation factor Ts  41.84 
 
 		 271 aa  172  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.172192  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  39.21 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  37.59 
 
 		 289 aa  172  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  42.41 
 
 		 308 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11200  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  39.65 
 
 		 282 aa  171  7.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1975  elongation factor Ts  41.34 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217525  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  40.88 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  41.6 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2040  elongation factor Ts  41.34 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  40.21 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1368  elongation factor Ts  39.01 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0623033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  41.6 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  41.6 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>