More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1609 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1609  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 320 aa  642    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00132099  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04070  elongation factor Ts  71.03 
 
 		 321 aa  459  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0724  translation elongation factor Ts  69.69 
 
 		 320 aa  446  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0407  translation elongation factor Ts  42.26 
 
 		 355 aa  251  1e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1441  elongation factor Ts  44.64 
 
 		 354 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1261  elongation factor Ts  43.71 
 
 		 354 aa  229  3e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00427037  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1831  elongation factor Ts  45.9 
 
 		 346 aa  225  6e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0135802  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1801  elongation factor Ts  41.49 
 
 		 350 aa  224  1e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.450992  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1093  elongation factor Ts  40.88 
 
 		 358 aa  224  1e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.569286  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0839  elongation factor Ts  41.57 
 
 		 352 aa  222  8e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0656173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0883  translation elongation factor Ts  40.12 
 
 		 275 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0550  elongation factor Ts  42.38 
 
 		 348 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00242368  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0548  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 357 aa  218  7.999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1196  elongation factor Ts  42.17 
 
 		 357 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1315  elongation factor Ts  42.17 
 
 		 357 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  40.98 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0106  elongation factor Ts  43.77 
 
 		 346 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0802  elongation factor Ts  41.34 
 
 		 341 aa  205  8e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000434061  hitchhiker  0.00000000000000232724 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2454  elongation factor Ts  42.64 
 
 		 342 aa  203  3e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000114512  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3494  translation elongation factor Ts  38.89 
 
 		 278 aa  192  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000803049  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0049  translation elongation factor Ts  36.5 
 
 		 277 aa  182  7e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  36.73 
 
 		 276 aa  178  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0378  elongation factor Ts  35.29 
 
 		 274 aa  176  4e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3036  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  36.2 
 
 		 278 aa  175  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00138132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  35.98 
 
 		 275 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4744  translation elongation factor Ts  35.98 
 
 		 277 aa  170  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848801  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  34.15 
 
 		 277 aa  169  7e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  32.82 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06750  elongation factor Ts  34.35 
 
 		 278 aa  160  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00748724  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  35.15 
 
 		 278 aa  158  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  34.06 
 
 		 291 aa  156  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1323  elongation factor Ts  35.71 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2199  translation elongation factor Ts  34.74 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  32.74 
 
 		 288 aa  152  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  31.8 
 
 		 278 aa  152  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  35.47 
 
 		 267 aa  152  8e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1231  elongation factor Ts  36.25 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442239  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0808  translation elongation factor Ts  33.03 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  32.63 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1385  elongation factor Ts  34.15 
 
 		 278 aa  149  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000279942 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0528  translation elongation factor Ts  32.2 
 
 		 280 aa  149  8e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.101205  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  32.05 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  33.54 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  31.89 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  33.73 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  31.4 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  33.33 
 
 		 296 aa  146  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1104  translation elongation factor Ts  31.74 
 
 		 286 aa  145  7.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12260  translation elongation factor Ts  33.33 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000728312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  30.56 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  31.9 
 
 		 278 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  31.89 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  35.19 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  32.16 
 
 		 314 aa  142  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  32.51 
 
 		 276 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  32.06 
 
 		 313 aa  142  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  31.25 
 
 		 286 aa  142  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1368  elongation factor Ts  32.93 
 
 		 278 aa  142  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0623033  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  31.08 
 
 		 289 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1273  elongation factor Ts  30.03 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00309579  normal  0.676189 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  30.21 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  30.21 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  31.46 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  31.46 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  31.46 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  31.85 
 
 		 288 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2547  elongation factor Ts  32.82 
 
 		 306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  31.08 
 
 		 271 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  35.08 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  30.56 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  32.2 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  35.08 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  33.73 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  33.73 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  31.48 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2009  elongation factor Ts  30.06 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  32.34 
 
 		 310 aa  136  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  31.15 
 
 		 285 aa  136  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11200  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  32.01 
 
 		 282 aa  136  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  29.88 
 
 		 312 aa  137  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  28.79 
 
 		 293 aa  136  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  34.77 
 
 		 295 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  34.77 
 
 		 295 aa  136  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  34.77 
 
 		 295 aa  136  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  34.77 
 
 		 295 aa  136  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  34.77 
 
 		 295 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  32.44 
 
 		 287 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  28.97 
 
 		 291 aa  135  8e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2352  elongation factor Ts  33.04 
 
 		 288 aa  135  9e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000872397  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  29.19 
 
 		 292 aa  135  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  34.46 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  31.44 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  30.03 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  30.56 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  34.46 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  32.42 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  34.86 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0404  elongation factor Ts  32.11 
 
 		 283 aa  134  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000167696  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  33.13 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0404  elongation factor Ts  32.05 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>