More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1104 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1104  translation elongation factor Ts  100 
 
 
286 aa  570  1.0000000000000001e-162  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  73.08 
 
 
288 aa  397  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0706  translation elongation factor Ts  57.44 
 
 
290 aa  300  2e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000134038  unclonable  0.0000000259641 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12260  translation elongation factor Ts  57.93 
 
 
288 aa  294  1e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000728312  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  47.59 
 
 
311 aa  256  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  47.2 
 
 
292 aa  244  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  46.74 
 
 
312 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  47.02 
 
 
291 aa  238  9e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  48.8 
 
 
310 aa  237  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  47.44 
 
 
307 aa  235  7e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  48.08 
 
 
303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  44.71 
 
 
307 aa  232  5e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  46.74 
 
 
302 aa  231  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  48.75 
 
 
291 aa  229  5e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0049  translation elongation factor Ts  43.66 
 
 
277 aa  227  2e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0883  translation elongation factor Ts  43.66 
 
 
275 aa  227  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  44.1 
 
 
287 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  46.49 
 
 
312 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  45.36 
 
 
286 aa  226  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  43.69 
 
 
307 aa  226  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  45.24 
 
 
308 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  44.1 
 
 
303 aa  226  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  44.14 
 
 
286 aa  226  4e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  46.39 
 
 
305 aa  225  6e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  46.39 
 
 
305 aa  225  6e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  46.85 
 
 
303 aa  225  7e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  44.06 
 
 
293 aa  225  8e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  47.4 
 
 
291 aa  224  9e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  46.5 
 
 
303 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  44.98 
 
 
296 aa  223  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  45.73 
 
 
307 aa  223  3e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  45.05 
 
 
310 aa  223  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  45.02 
 
 
307 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  47.46 
 
 
301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  41.92 
 
 
288 aa  219  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  48.99 
 
 
309 aa  220  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  44.29 
 
 
273 aa  219  3e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  44.75 
 
 
308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  45.67 
 
 
289 aa  219  5e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  48.09 
 
 
294 aa  218  7e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  44.95 
 
 
292 aa  218  7e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  43.05 
 
 
308 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  44.44 
 
 
312 aa  218  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  44.98 
 
 
291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  46.6 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  42.2 
 
 
279 aa  216  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  44.18 
 
 
294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  44.41 
 
 
308 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  42.52 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  41.84 
 
 
314 aa  214  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  45.23 
 
 
292 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  42.51 
 
 
276 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3195  translation elongation factor Ts  45.12 
 
 
308 aa  212  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  42.27 
 
 
288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  44.41 
 
 
292 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  45.8 
 
 
292 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  45.8 
 
 
292 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  42.31 
 
 
267 aa  210  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  43.82 
 
 
289 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  44.06 
 
 
300 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  41.84 
 
 
308 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  43.55 
 
 
292 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  43.01 
 
 
285 aa  208  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  43.01 
 
 
285 aa  208  7e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  43.01 
 
 
285 aa  208  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  43.9 
 
 
290 aa  207  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  39.59 
 
 
313 aa  208  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  43.9 
 
 
291 aa  208  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  43.9 
 
 
293 aa  206  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1273  elongation factor Ts  42.66 
 
 
286 aa  205  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00309579  normal  0.676189 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3494  translation elongation factor Ts  42.61 
 
 
278 aa  205  9e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000803049  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  42.86 
 
 
292 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  39.65 
 
 
294 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  43.21 
 
 
293 aa  203  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  41.96 
 
 
285 aa  203  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  42.91 
 
 
293 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  42.91 
 
 
293 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  42.91 
 
 
293 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  42.91 
 
 
293 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  42.91 
 
 
293 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  42.91 
 
 
293 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  42.91 
 
 
294 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  43.31 
 
 
290 aa  202  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  40.07 
 
 
288 aa  202  6e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  41.46 
 
 
293 aa  202  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  42.4 
 
 
292 aa  202  7e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  43.25 
 
 
293 aa  201  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0673  translation elongation factor Ts  41.78 
 
 
292 aa  201  9e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  41.24 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  41.96 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1959  elongation factor Ts  46.26 
 
 
308 aa  199  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  41.81 
 
 
293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4744  translation elongation factor Ts  42.11 
 
 
277 aa  199  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848801  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  42.18 
 
 
308 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  41.61 
 
 
285 aa  198  7e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  41.1 
 
 
278 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  41.46 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1647  elongation factor Ts  39.04 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3036  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  43.51 
 
 
278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00138132  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  41.28 
 
 
310 aa  196  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>