More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2109 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  100 
 
 		 287 aa  574  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  57.3 
 
 		 286 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  51.93 
 
 		 286 aa  295  4e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  51.96 
 
 		 267 aa  275  5e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  44.52 
 
 		 311 aa  251  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  46.43 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  44.26 
 
 		 307 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  43.3 
 
 		 314 aa  235  5.0000000000000005e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  45.36 
 
 		 307 aa  234  9e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  46.53 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  43.28 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  46.18 
 
 		 303 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  46.05 
 
 		 307 aa  231  9e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  41.44 
 
 		 312 aa  231  9e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  44.52 
 
 		 310 aa  228  8e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  44.48 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  45.45 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  43.14 
 
 		 310 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  41.67 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  40.4 
 
 		 313 aa  223  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  42.05 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  44.9 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  43.25 
 
 		 288 aa  221  7e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  40.34 
 
 		 288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  46.79 
 
 		 290 aa  219  5e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  43.1 
 
 		 310 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  40.59 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0673  translation elongation factor Ts  42.01 
 
 		 292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  42.32 
 
 		 312 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  43.85 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1104  translation elongation factor Ts  44.44 
 
 		 286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  43.85 
 
 		 308 aa  212  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  41.24 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  41 
 
 		 305 aa  210  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  41 
 
 		 305 aa  210  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  43.62 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  46.05 
 
 		 294 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  42.72 
 
 		 307 aa  209  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  41.36 
 
 		 312 aa  209  6e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  44.67 
 
 		 303 aa  208  8e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  41.72 
 
 		 292 aa  208  9e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  40.21 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  44.98 
 
 		 308 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3195  translation elongation factor Ts  42.67 
 
 		 308 aa  205  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0706  translation elongation factor Ts  42.71 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000134038  unclonable  0.0000000259641 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  41.18 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  39.66 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2923  translation elongation factor Ts  65.99 
 
 		 200 aa  199  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  44.48 
 
 		 294 aa  199  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12260  translation elongation factor Ts  43.21 
 
 		 288 aa  199  6e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000728312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2074  elongation factor Ts  42.57 
 
 		 306 aa  198  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0812187  normal  0.288352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2348  elongation factor Ts  42.57 
 
 		 306 aa  198  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.474929 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  44.07 
 
 		 291 aa  198  7e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  42.71 
 
 		 292 aa  198  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 291 aa  198  9e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  42.12 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  42.01 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  42.01 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1647  elongation factor Ts  39.52 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2224  elongation factor Ts  43.38 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  39.86 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  41.32 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  42.91 
 
 		 292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2034  elongation factor Ts  41.72 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0653103 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  44.98 
 
 		 296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0404  elongation factor Ts  39.52 
 
 		 288 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  42.52 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1697  elongation factor Ts  43.56 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4828  elongation factor Ts  42.62 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0383674  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  39.52 
 
 		 294 aa  193  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  41.47 
 
 		 285 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  41.47 
 
 		 285 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  41.32 
 
 		 294 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  38.78 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  41.47 
 
 		 285 aa  193  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  41.32 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  41.32 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  41.32 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  41.32 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  40.62 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  41.32 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2009  elongation factor Ts  38.83 
 
 		 288 aa  192  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  41.32 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  40.97 
 
 		 293 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  40.56 
 
 		 294 aa  192  5e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  38.26 
 
 		 299 aa  192  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  40.62 
 
 		 293 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0883  translation elongation factor Ts  40.56 
 
 		 275 aa  191  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  44.71 
 
 		 301 aa  191  9e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  37.63 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3449  elongation factor Ts  43.56 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190771  normal  0.488523 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  38.98 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  43.2 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  43.2 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3494  translation elongation factor Ts  41.89 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000803049  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  40.42 
 
 		 291 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1959  elongation factor Ts  42.33 
 
 		 308 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1441  elongation factor Ts  36.62 
 
 		 354 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  43.79 
 
 		 292 aa  189  4e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  37.89 
 
 		 290 aa  189  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>