More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_08140 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  100 
 
 		 288 aa  581  1.0000000000000001e-165  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1104  translation elongation factor Ts  73.08 
 
 		 286 aa  393  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12260  translation elongation factor Ts  59.11 
 
 		 288 aa  308  8e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000728312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0706  translation elongation factor Ts  54.98 
 
 		 290 aa  287  1e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000134038  unclonable  0.0000000259641 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  50.17 
 
 		 311 aa  273  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  48.97 
 
 		 310 aa  252  6e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  48.62 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  49.12 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  47.54 
 
 		 291 aa  241  7e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  45.45 
 
 		 276 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0049  translation elongation factor Ts  45.74 
 
 		 277 aa  239  2.9999999999999997e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  48.25 
 
 		 303 aa  238  6.999999999999999e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  48.25 
 
 		 303 aa  238  6.999999999999999e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  49.83 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  45.77 
 
 		 289 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  44.52 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  46.34 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  42.61 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  50.35 
 
 		 291 aa  229  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  41.2 
 
 		 294 aa  229  4e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  44.86 
 
 		 288 aa  229  5e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  46.58 
 
 		 310 aa  229  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  46.5 
 
 		 292 aa  227  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  47.12 
 
 		 307 aa  226  2e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  46.85 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  47.59 
 
 		 296 aa  225  6e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  44.6 
 
 		 293 aa  225  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  45.3 
 
 		 303 aa  225  7e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  45.92 
 
 		 307 aa  225  8e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  42.61 
 
 		 288 aa  224  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0883  translation elongation factor Ts  44.01 
 
 		 275 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  43.16 
 
 		 293 aa  223  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  47.9 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  47.9 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  47.9 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  44.37 
 
 		 307 aa  223  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  44.76 
 
 		 267 aa  222  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  43.73 
 
 		 308 aa  222  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  44.06 
 
 		 292 aa  222  4.9999999999999996e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  48.08 
 
 		 295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  43.45 
 
 		 286 aa  221  8e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  44.52 
 
 		 292 aa  221  8e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  43.21 
 
 		 293 aa  221  9e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  46.69 
 
 		 294 aa  221  9e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  43.4 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  44.25 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0976  elongation factor Ts  45.67 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120791  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  45.86 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  45.86 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  45.86 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  45.86 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  43.55 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  44.25 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  45.86 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  45.86 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  43.9 
 
 		 293 aa  219  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  43.9 
 
 		 293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  43 
 
 		 307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  44.52 
 
 		 305 aa  219  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  44.52 
 
 		 305 aa  219  5e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  46.15 
 
 		 285 aa  218  7.999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3036  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  43.51 
 
 		 278 aa  218  8.999999999999998e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00138132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  43.9 
 
 		 287 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  46.1 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  47.91 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  44.33 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  47.39 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  47.39 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  47.39 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  47.39 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  47.39 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  43.55 
 
 		 293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  45.3 
 
 		 294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  47.04 
 
 		 295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  43.55 
 
 		 293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3494  translation elongation factor Ts  44.72 
 
 		 278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000803049  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  43.55 
 
 		 293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0508  elongation factor Ts  45.99 
 
 		 294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0459419  normal  0.717587 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  45.02 
 
 		 307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  43.55 
 
 		 293 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  46.34 
 
 		 294 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  43.55 
 
 		 293 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  46.26 
 
 		 307 aa  216  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  47.04 
 
 		 295 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  45.42 
 
 		 308 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  47.04 
 
 		 295 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  46.28 
 
 		 309 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  47.39 
 
 		 295 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  43.21 
 
 		 293 aa  215  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  44.64 
 
 		 290 aa  215  8e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  47.57 
 
 		 291 aa  214  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  44.19 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  42.16 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0673  translation elongation factor Ts  44.37 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1647  elongation factor Ts  41.78 
 
 		 288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  43.54 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  41.18 
 
 		 291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  46.44 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  46.69 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>