More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2045 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  100 
 
 
312 aa  636    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  67.95 
 
 
311 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  48.57 
 
 
310 aa  296  4e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  49.84 
 
 
303 aa  288  6e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  48.04 
 
 
303 aa  279  5e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  44.09 
 
 
313 aa  273  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  46.75 
 
 
303 aa  261  8.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  48.53 
 
 
294 aa  261  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  46.75 
 
 
303 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  44.59 
 
 
299 aa  256  4e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  48.62 
 
 
288 aa  256  4e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  41.08 
 
 
314 aa  256  5e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  44.23 
 
 
308 aa  255  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  45.31 
 
 
292 aa  251  8.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  45.57 
 
 
294 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  44.59 
 
 
294 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  43.35 
 
 
308 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  48.36 
 
 
292 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  42.72 
 
 
308 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  42.58 
 
 
300 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  42.07 
 
 
293 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  42.72 
 
 
308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  43.14 
 
 
307 aa  241  9e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  47.59 
 
 
307 aa  241  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  43.32 
 
 
291 aa  241  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  40.78 
 
 
294 aa  239  4e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  43.04 
 
 
308 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  43.87 
 
 
309 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  43.91 
 
 
308 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  41.44 
 
 
287 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1104  translation elongation factor Ts  46.74 
 
 
286 aa  238  9e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  43.63 
 
 
301 aa  237  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  43.27 
 
 
308 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  42.72 
 
 
307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  42.62 
 
 
295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  40.72 
 
 
307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  43.04 
 
 
289 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  43.46 
 
 
310 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12260  translation elongation factor Ts  46.21 
 
 
288 aa  230  2e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000728312  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  40.66 
 
 
292 aa  231  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  41.97 
 
 
295 aa  229  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  43.32 
 
 
293 aa  228  8e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  42.62 
 
 
295 aa  228  9e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  41.64 
 
 
295 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  41.64 
 
 
295 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  41.64 
 
 
295 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  41.64 
 
 
295 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  41.64 
 
 
295 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  43.93 
 
 
292 aa  227  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  42.48 
 
 
305 aa  227  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  41.97 
 
 
292 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  42.48 
 
 
305 aa  227  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  41.31 
 
 
295 aa  226  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  41.31 
 
 
295 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3195  translation elongation factor Ts  43.09 
 
 
308 aa  226  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  41.31 
 
 
295 aa  225  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  42.21 
 
 
292 aa  225  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  42.21 
 
 
292 aa  225  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  42.59 
 
 
312 aa  225  6e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  41.64 
 
 
292 aa  225  7e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  42.44 
 
 
302 aa  225  8e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  43.61 
 
 
285 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  42.17 
 
 
307 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  40.27 
 
 
276 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  40.98 
 
 
296 aa  221  8e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  40.98 
 
 
296 aa  221  8e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1093  elongation factor Ts  36.94 
 
 
358 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.569286  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  42.17 
 
 
307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  43.28 
 
 
285 aa  219  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  40.67 
 
 
286 aa  219  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  42.95 
 
 
294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  43.95 
 
 
291 aa  218  7e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  44.95 
 
 
285 aa  218  7.999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  44.95 
 
 
285 aa  218  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  44.95 
 
 
285 aa  218  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1647  elongation factor Ts  40.14 
 
 
288 aa  218  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  42.14 
 
 
290 aa  217  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1261  elongation factor Ts  36.36 
 
 
354 aa  217  2e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00427037  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  41.84 
 
 
267 aa  217  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  40 
 
 
291 aa  217  2e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  43.32 
 
 
290 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  42 
 
 
293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  40.07 
 
 
310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  42.36 
 
 
291 aa  216  4e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  38.99 
 
 
312 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  42 
 
 
293 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  42 
 
 
293 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  42 
 
 
293 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  42 
 
 
293 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  42 
 
 
293 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  42 
 
 
294 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  42 
 
 
293 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0407  translation elongation factor Ts  36.16 
 
 
355 aa  216  5e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  42.44 
 
 
296 aa  216  5e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  40.27 
 
 
277 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1196  elongation factor Ts  37.57 
 
 
357 aa  215  9e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2074  elongation factor Ts  44.37 
 
 
306 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0812187  normal  0.288352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2348  elongation factor Ts  44.37 
 
 
306 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.474929 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  40.69 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2034  elongation factor Ts  44.69 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0653103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>