More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1261 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1261  elongation factor Ts  100 
 
 		 354 aa  718    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00427037  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0550  elongation factor Ts  89.94 
 
 		 348 aa  616  1e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00242368  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1441  elongation factor Ts  73.45 
 
 		 354 aa  541  1e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0407  translation elongation factor Ts  69.6 
 
 		 355 aa  505  9.999999999999999e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1093  elongation factor Ts  69.66 
 
 		 358 aa  502  1e-141  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.569286  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1315  elongation factor Ts  69.58 
 
 		 357 aa  488  1e-137  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1196  elongation factor Ts  70.14 
 
 		 357 aa  490  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0548  elongation factor Ts  69.3 
 
 		 357 aa  487  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0839  elongation factor Ts  70.06 
 
 		 352 aa  475  1e-133  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0656173  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1801  elongation factor Ts  50.42 
 
 		 350 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.450992  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0106  elongation factor Ts  45.63 
 
 		 346 aa  272  6e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1831  elongation factor Ts  45.95 
 
 		 346 aa  265  1e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0135802  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04070  elongation factor Ts  44.61 
 
 		 321 aa  261  2e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2454  elongation factor Ts  45.2 
 
 		 342 aa  256  4e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000114512  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0724  translation elongation factor Ts  44.03 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0802  elongation factor Ts  44.41 
 
 		 341 aa  246  4e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000434061  hitchhiker  0.00000000000000232724 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1609  translation elongation factor Ts  43.71 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00132099  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  37.71 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  41.78 
 
 		 312 aa  219  5e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  38.66 
 
 		 310 aa  219  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  41.93 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  41.93 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  37.75 
 
 		 296 aa  209  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  36.83 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  36.87 
 
 		 308 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  38.38 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  36.31 
 
 		 308 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  35.51 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  37.78 
 
 		 313 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  36.26 
 
 		 294 aa  199  9e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  39.94 
 
 		 303 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  35.06 
 
 		 307 aa  196  6e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  35.98 
 
 		 307 aa  196  8.000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  37.57 
 
 		 286 aa  195  9e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  35.75 
 
 		 308 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  35.06 
 
 		 307 aa  195  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  34.38 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  40.4 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  37.18 
 
 		 291 aa  194  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  35.23 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  40.4 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  35.82 
 
 		 310 aa  193  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  36.99 
 
 		 312 aa  192  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  38.87 
 
 		 294 aa  192  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  35.31 
 
 		 312 aa  192  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  39.44 
 
 		 294 aa  192  9e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  40.11 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  40.11 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  40.11 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  40.11 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  35.29 
 
 		 308 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  40.4 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  40.11 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  40.11 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  40.11 
 
 		 295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  35.93 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  34.94 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  40.11 
 
 		 295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  35.03 
 
 		 310 aa  189  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  38.42 
 
 		 292 aa  188  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl560  elongation factor Ts  35.57 
 
 		 297 aa  188  1e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  35.91 
 
 		 314 aa  188  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  37.78 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  35.93 
 
 		 308 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  34.64 
 
 		 308 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  34.75 
 
 		 290 aa  186  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  36.06 
 
 		 291 aa  186  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  34.75 
 
 		 292 aa  186  5e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1959  elongation factor Ts  37.89 
 
 		 308 aa  186  7e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  34.75 
 
 		 294 aa  185  8e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  35.14 
 
 		 285 aa  185  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  34.46 
 
 		 292 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  34.46 
 
 		 292 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  35.43 
 
 		 285 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  34.09 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1265  elongation factor Ts  36.75 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  36.8 
 
 		 291 aa  183  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  36.16 
 
 		 293 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  33.9 
 
 		 305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  33.9 
 
 		 305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1511  elongation factor Ts  40.06 
 
 		 298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501204  normal  0.0222785 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  35.8 
 
 		 287 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  36.67 
 
 		 301 aa  182  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2861  elongation factor Ts  39.89 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  35.03 
 
 		 294 aa  182  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  37.32 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1432  elongation factor Ts  39.89 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  hitchhiker  0.00915816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  35.14 
 
 		 283 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  38.07 
 
 		 293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  38.07 
 
 		 293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  35.14 
 
 		 283 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  35.14 
 
 		 283 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  34.54 
 
 		 296 aa  180  4e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  35.14 
 
 		 283 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  34.54 
 
 		 296 aa  180  4e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  35.14 
 
 		 283 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  37.18 
 
 		 292 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0673  translation elongation factor Ts  35.99 
 
 		 292 aa  179  5.999999999999999e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  35.14 
 
 		 283 aa  179  7e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  35.14 
 
 		 283 aa  179  7e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>