More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3195 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3195  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 308 aa  616  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  65.58 
 
 		 308 aa  415  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  66.23 
 
 		 308 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  66.56 
 
 		 308 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  62.71 
 
 		 307 aa  394  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  63.28 
 
 		 307 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  62.3 
 
 		 307 aa  386  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  61.31 
 
 		 310 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  58.06 
 
 		 312 aa  360  2e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  60.98 
 
 		 305 aa  359  4e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  60.98 
 
 		 305 aa  359  4e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  58.31 
 
 		 308 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  61.64 
 
 		 309 aa  353  1e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  58.03 
 
 		 308 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  57.98 
 
 		 308 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  57.28 
 
 		 312 aa  348  8e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  57.19 
 
 		 300 aa  343  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  59.8 
 
 		 301 aa  340  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  56.38 
 
 		 307 aa  340  2e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  57.33 
 
 		 308 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  55.37 
 
 		 307 aa  331  7.000000000000001e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  55.84 
 
 		 307 aa  330  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  57.67 
 
 		 296 aa  330  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1697  elongation factor Ts  59.22 
 
 		 307 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  58.05 
 
 		 301 aa  323  3e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4828  elongation factor Ts  58.25 
 
 		 307 aa  322  6e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0383674  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  52.12 
 
 		 303 aa  318  7.999999999999999e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2034  elongation factor Ts  57.47 
 
 		 306 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0653103 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  57.05 
 
 		 291 aa  316  4e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  54.3 
 
 		 310 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2074  elongation factor Ts  56.82 
 
 		 306 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0812187  normal  0.288352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2348  elongation factor Ts  56.82 
 
 		 306 aa  311  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.474929 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3449  elongation factor Ts  55.7 
 
 		 308 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190771  normal  0.488523 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1959  elongation factor Ts  58 
 
 		 308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4438  elongation factor Ts  56.71 
 
 		 307 aa  301  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000816473 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  53.44 
 
 		 291 aa  300  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  55.74 
 
 		 291 aa  295  6e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2224  elongation factor Ts  54.97 
 
 		 310 aa  292  6e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  49.19 
 
 		 303 aa  278  7e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2861  elongation factor Ts  54.72 
 
 		 298 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1432  elongation factor Ts  54.72 
 
 		 298 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  hitchhiker  0.00915816 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1511  elongation factor Ts  55.37 
 
 		 298 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501204  normal  0.0222785 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1370  elongation factor Ts  52.2 
 
 		 308 aa  267  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  45.25 
 
 		 311 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  49.84 
 
 		 292 aa  256  3e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  47.4 
 
 		 294 aa  255  8e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  45.93 
 
 		 289 aa  251  8.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0515  elongation factor Ts  43.82 
 
 		 288 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  45.34 
 
 		 292 aa  242  7e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  48.23 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0516  elongation factor Ts  41.87 
 
 		 288 aa  240  2e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.203151  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  46.45 
 
 		 302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  44.01 
 
 		 294 aa  239  5e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  45.13 
 
 		 310 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  47.06 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  47.88 
 
 		 295 aa  236  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  47.88 
 
 		 295 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  44.84 
 
 		 292 aa  235  6e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  44.84 
 
 		 292 aa  235  6e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  45.4 
 
 		 296 aa  235  7e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  47.56 
 
 		 295 aa  235  7e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  45.4 
 
 		 296 aa  235  7e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  47.56 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  47.56 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  47.56 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  47.56 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  47.56 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  48.36 
 
 		 293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  48.36 
 
 		 293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  46.69 
 
 		 294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  43.42 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  47.23 
 
 		 295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  47.23 
 
 		 295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  45.31 
 
 		 293 aa  232  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  45.78 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  46.03 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  47.85 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  47.85 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  45.98 
 
 		 285 aa  229  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  46.58 
 
 		 295 aa  228  9e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  41.08 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  45.7 
 
 		 292 aa  228  1e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  43 
 
 		 287 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  47 
 
 		 292 aa  226  3e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  44.81 
 
 		 283 aa  225  8e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  45.13 
 
 		 292 aa  225  8e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  45.42 
 
 		 294 aa  225  9e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  45.67 
 
 		 290 aa  223  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  46.33 
 
 		 291 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  43.65 
 
 		 292 aa  223  3e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  42.62 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  45.02 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  44.16 
 
 		 283 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  44.55 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  43.83 
 
 		 283 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  43.83 
 
 		 283 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  43.83 
 
 		 283 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  43.83 
 
 		 283 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  44.16 
 
 		 283 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  44.16 
 
 		 283 aa  218  7.999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>