More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1959 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1959  elongation factor Ts  100 
 
 		 308 aa  604  9.999999999999999e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  71.48 
 
 		 307 aa  425  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1370  elongation factor Ts  70.07 
 
 		 308 aa  384  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  62.42 
 
 		 309 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  57 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  58.12 
 
 		 308 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  58.77 
 
 		 301 aa  330  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  57.14 
 
 		 308 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  56.49 
 
 		 308 aa  328  9e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  55.88 
 
 		 308 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  55.33 
 
 		 310 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  57.79 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  56.23 
 
 		 312 aa  319  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  55.31 
 
 		 312 aa  318  9e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  55.23 
 
 		 308 aa  315  8e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  55.7 
 
 		 307 aa  314  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  54.7 
 
 		 307 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  55.03 
 
 		 307 aa  312  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  53.16 
 
 		 303 aa  310  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  53.69 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3195  translation elongation factor Ts  58 
 
 		 308 aa  306  4.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  54.33 
 
 		 300 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  53.54 
 
 		 307 aa  302  5.000000000000001e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  55.41 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  54.67 
 
 		 296 aa  293  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  54.85 
 
 		 301 aa  292  4e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  55.45 
 
 		 291 aa  292  6e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4438  elongation factor Ts  58.19 
 
 		 307 aa  291  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000816473 
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  53.72 
 
 		 305 aa  290  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  53.72 
 
 		 305 aa  290  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2224  elongation factor Ts  52.16 
 
 		 310 aa  289  4e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3449  elongation factor Ts  55.99 
 
 		 308 aa  288  7e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190771  normal  0.488523 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  53.95 
 
 		 303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2034  elongation factor Ts  55.56 
 
 		 306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0653103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2074  elongation factor Ts  55.88 
 
 		 306 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0812187  normal  0.288352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1697  elongation factor Ts  56.63 
 
 		 307 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2348  elongation factor Ts  55.88 
 
 		 306 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.474929 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4828  elongation factor Ts  56.17 
 
 		 307 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0383674  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  56 
 
 		 291 aa  275  9e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  52.48 
 
 		 291 aa  272  7e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  51.63 
 
 		 285 aa  255  6e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  51.14 
 
 		 285 aa  255  8e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  45.69 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0516  elongation factor Ts  42.76 
 
 		 288 aa  250  2e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.203151  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  47.95 
 
 		 311 aa  249  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  46.31 
 
 		 292 aa  248  8e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1511  elongation factor Ts  54.72 
 
 		 298 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501204  normal  0.0222785 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  44.55 
 
 		 294 aa  248  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2861  elongation factor Ts  54.72 
 
 		 298 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1432  elongation factor Ts  54.72 
 
 		 298 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  hitchhiker  0.00915816 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0515  elongation factor Ts  42.6 
 
 		 288 aa  247  2e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  49.34 
 
 		 283 aa  247  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  49.35 
 
 		 292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  46.73 
 
 		 294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  49.51 
 
 		 285 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  49.51 
 
 		 285 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  49.51 
 
 		 285 aa  243  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0351  elongation factor Ts  47.19 
 
 		 294 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.556574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0390  elongation factor Ts  47.02 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.432291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  49.51 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  49.51 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  49.51 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  49.51 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  49.18 
 
 		 283 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  49.18 
 
 		 283 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  49.18 
 
 		 283 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  49.18 
 
 		 283 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  49.18 
 
 		 283 aa  238  6.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  49.18 
 
 		 283 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  49.18 
 
 		 283 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  49.18 
 
 		 283 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  49.18 
 
 		 283 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  48.37 
 
 		 303 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  49.18 
 
 		 283 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  48.04 
 
 		 303 aa  236  3e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  46 
 
 		 292 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  44.59 
 
 		 292 aa  234  9e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  48.5 
 
 		 290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  48.52 
 
 		 283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  47.87 
 
 		 283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3359  elongation factor Ts  47.87 
 
 		 283 aa  231  9e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461306  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  44.74 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  45.25 
 
 		 293 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  46.79 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  46.51 
 
 		 294 aa  228  8e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  46.1 
 
 		 292 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  46.94 
 
 		 288 aa  227  1e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  47.23 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  46.43 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0531  elongation factor Ts  41.99 
 
 		 286 aa  226  5.0000000000000005e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  45.51 
 
 		 292 aa  225  9e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  44.97 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  46.49 
 
 		 293 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  46.5 
 
 		 312 aa  223  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  44.97 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  44.34 
 
 		 296 aa  223  4e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  44.34 
 
 		 296 aa  223  4e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  46.67 
 
 		 295 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  44.74 
 
 		 292 aa  221  9e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  44.74 
 
 		 292 aa  221  9e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>