More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2437 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  100 
 
 		 308 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  88.96 
 
 		 308 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  87.34 
 
 		 308 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  87.99 
 
 		 308 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  82.08 
 
 		 307 aa  499  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  81.73 
 
 		 300 aa  488  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  80.13 
 
 		 307 aa  487  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  63 
 
 		 310 aa  363  1e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  56.9 
 
 		 307 aa  345  7e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  57.05 
 
 		 308 aa  340  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  55.22 
 
 		 307 aa  326  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  56.54 
 
 		 308 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  56.54 
 
 		 308 aa  322  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  53.9 
 
 		 310 aa  322  6e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  53.9 
 
 		 305 aa  322  7e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  53.9 
 
 		 305 aa  322  7e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  54.81 
 
 		 312 aa  321  8e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  54.43 
 
 		 307 aa  317  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4828  elongation factor Ts  58.63 
 
 		 307 aa  316  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0383674  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2224  elongation factor Ts  57.14 
 
 		 310 aa  316  4e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  52.19 
 
 		 307 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1697  elongation factor Ts  57.47 
 
 		 307 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  52.12 
 
 		 301 aa  306  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2034  elongation factor Ts  56.17 
 
 		 306 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0653103 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3195  translation elongation factor Ts  56.52 
 
 		 308 aa  305  7e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  55.33 
 
 		 296 aa  305  8.000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4438  elongation factor Ts  57.61 
 
 		 307 aa  305  9.000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000816473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2348  elongation factor Ts  56.82 
 
 		 306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.474929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2074  elongation factor Ts  56.82 
 
 		 306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0812187  normal  0.288352 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3449  elongation factor Ts  55.48 
 
 		 308 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190771  normal  0.488523 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  57.28 
 
 		 291 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  55 
 
 		 301 aa  300  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  54.58 
 
 		 309 aa  297  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1959  elongation factor Ts  56.86 
 
 		 308 aa  290  2e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  50.33 
 
 		 303 aa  290  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  50 
 
 		 312 aa  285  8e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  54.18 
 
 		 291 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  51.33 
 
 		 291 aa  279  5e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  48.69 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2861  elongation factor Ts  51.31 
 
 		 298 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1432  elongation factor Ts  51.31 
 
 		 298 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  hitchhiker  0.00915816 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1370  elongation factor Ts  50.81 
 
 		 308 aa  245  8e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1511  elongation factor Ts  50.33 
 
 		 298 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501204  normal  0.0222785 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  44.44 
 
 		 311 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  42.11 
 
 		 294 aa  231  8.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  42.67 
 
 		 292 aa  230  3e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  44.48 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  43.04 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  44.16 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  42.5 
 
 		 313 aa  219  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  43.88 
 
 		 287 aa  218  7e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  44.33 
 
 		 290 aa  218  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0516  elongation factor Ts  37.98 
 
 		 288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.203151  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0351  elongation factor Ts  43.38 
 
 		 294 aa  215  9e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.556574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  42.37 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  40.89 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  43.23 
 
 		 292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  43.23 
 
 		 292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  41.58 
 
 		 292 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  44.34 
 
 		 283 aa  212  7.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  42.18 
 
 		 288 aa  211  9e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  41.91 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0390  elongation factor Ts  43.38 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.432291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  43.65 
 
 		 283 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  43.65 
 
 		 283 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  43.65 
 
 		 283 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  43.65 
 
 		 283 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  42.67 
 
 		 283 aa  209  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  42.67 
 
 		 283 aa  209  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  42.67 
 
 		 283 aa  209  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  42.67 
 
 		 283 aa  209  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  42.67 
 
 		 283 aa  209  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  42.67 
 
 		 283 aa  209  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  42.67 
 
 		 283 aa  209  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  42.67 
 
 		 283 aa  209  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  42.67 
 
 		 283 aa  209  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  43.27 
 
 		 283 aa  209  5e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  41.2 
 
 		 289 aa  209  7e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  43.32 
 
 		 283 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  43.39 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  41.45 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  42.86 
 
 		 290 aa  205  9e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0515  elongation factor Ts  36.17 
 
 		 288 aa  205  9e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  42.12 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  44.19 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  42.33 
 
 		 286 aa  204  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  42.86 
 
 		 288 aa  203  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  41.78 
 
 		 291 aa  204  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  41.31 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  44.52 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  44.52 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  41.69 
 
 		 283 aa  202  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  43.83 
 
 		 294 aa  202  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  42.44 
 
 		 285 aa  201  9e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  43.85 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  41 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  41.1 
 
 		 285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  41.67 
 
 		 267 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1093  elongation factor Ts  36.81 
 
 		 358 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.569286  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  44.88 
 
 		 294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>