More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2861 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1432  elongation factor Ts  100 
 
 
298 aa  589  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  hitchhiker  0.00915816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2861  elongation factor Ts  100 
 
 
298 aa  589  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1511  elongation factor Ts  95.64 
 
 
298 aa  535  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501204  normal  0.0222785 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  71.81 
 
 
291 aa  412  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  73.83 
 
 
291 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  69.13 
 
 
291 aa  395  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  67.55 
 
 
296 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  54.49 
 
 
308 aa  305  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  54.61 
 
 
307 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  56.09 
 
 
308 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  55.3 
 
 
310 aa  300  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  55.77 
 
 
308 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  52.96 
 
 
307 aa  297  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  56.73 
 
 
307 aa  291  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  53.31 
 
 
305 aa  289  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  53.31 
 
 
305 aa  289  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  51.33 
 
 
307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  52.3 
 
 
307 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  52.67 
 
 
307 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  51.31 
 
 
308 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  50.97 
 
 
312 aa  273  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  51.83 
 
 
300 aa  270  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  50.65 
 
 
308 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  50.33 
 
 
308 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  51.31 
 
 
308 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3195  translation elongation factor Ts  53.97 
 
 
308 aa  264  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  47.65 
 
 
292 aa  262  6e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  50.5 
 
 
301 aa  261  8.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  54.92 
 
 
301 aa  257  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  51.28 
 
 
312 aa  255  6e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  49.66 
 
 
292 aa  254  9e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  49.33 
 
 
292 aa  250  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  48.32 
 
 
292 aa  250  2e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  50.33 
 
 
310 aa  249  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  51.44 
 
 
309 aa  248  6e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  46.44 
 
 
290 aa  243  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1959  elongation factor Ts  53.97 
 
 
308 aa  242  7e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  47.94 
 
 
303 aa  241  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.844303 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  47.1 
 
 
283 aa  239  5e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  47.1 
 
 
283 aa  239  5e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  47.1 
 
 
283 aa  239  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  47.1 
 
 
283 aa  239  5e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  47.1 
 
 
283 aa  239  5e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  47.1 
 
 
283 aa  239  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  47.1 
 
 
283 aa  239  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  47.1 
 
 
283 aa  239  5e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  47.1 
 
 
283 aa  239  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  44.95 
 
 
294 aa  238  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  45.79 
 
 
291 aa  238  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  45.85 
 
 
292 aa  236  3e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  46.76 
 
 
283 aa  235  6e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  47.56 
 
 
294 aa  235  6e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4828  elongation factor Ts  52.4 
 
 
307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0383674  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  45.08 
 
 
289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  46.42 
 
 
283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  46.42 
 
 
283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  46.42 
 
 
283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  46.42 
 
 
283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  47.49 
 
 
302 aa  232  5e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  46.08 
 
 
283 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  49.84 
 
 
295 aa  231  9e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  49.83 
 
 
294 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  45.39 
 
 
283 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1370  elongation factor Ts  52.63 
 
 
308 aa  231  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  46.1 
 
 
285 aa  231  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1697  elongation factor Ts  52.6 
 
 
307 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  46.46 
 
 
285 aa  230  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  46.46 
 
 
285 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  46.46 
 
 
285 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2034  elongation factor Ts  53.25 
 
 
306 aa  229  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0653103 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  49.51 
 
 
295 aa  229  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  49.51 
 
 
295 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  49.51 
 
 
295 aa  229  5e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  47.1 
 
 
290 aa  228  7e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  46.1 
 
 
285 aa  228  8e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1265  elongation factor Ts  46 
 
 
291 aa  228  9e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  49.51 
 
 
295 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  49.51 
 
 
295 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  49.51 
 
 
295 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  49.51 
 
 
295 aa  227  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  49.51 
 
 
295 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  49.51 
 
 
295 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  47.3 
 
 
283 aa  227  2e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3449  elongation factor Ts  52.43 
 
 
308 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190771  normal  0.488523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2074  elongation factor Ts  53.9 
 
 
306 aa  226  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0812187  normal  0.288352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2348  elongation factor Ts  53.9 
 
 
306 aa  226  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.474929 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  47.04 
 
 
292 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  48.23 
 
 
303 aa  225  8e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  47.83 
 
 
294 aa  224  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2224  elongation factor Ts  48.68 
 
 
310 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1102  elongation factor Ts  44.63 
 
 
287 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.433956  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  46.82 
 
 
293 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  48.86 
 
 
295 aa  222  6e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  44.82 
 
 
293 aa  222  6e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  48.85 
 
 
294 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1535  translation elongation factor Ts  44.44 
 
 
287 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  46.15 
 
 
311 aa  219  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  42.07 
 
 
292 aa  219  5e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3052  elongation factor Ts  43.71 
 
 
287 aa  219  6e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.204992  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1344  elongation factor Ts  44.11 
 
 
287 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.483596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>