More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1323 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1323  elongation factor Ts  100 
 
 
275 aa  550  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1231  elongation factor Ts  97.09 
 
 
275 aa  542  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442239  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2199  translation elongation factor Ts  65.82 
 
 
270 aa  363  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5910  translation elongation factor Ts  65.82 
 
 
271 aa  348  4e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0273949  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  63.27 
 
 
271 aa  347  1e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  64.86 
 
 
272 aa  343  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1669  translation elongation factor Ts  62.41 
 
 
274 aa  332  5e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  62.41 
 
 
278 aa  323  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2210  elongation factor Ts  61.59 
 
 
271 aa  318  9e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126056  normal  0.227569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  61.35 
 
 
278 aa  315  6e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  60.28 
 
 
278 aa  314  8e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1975  elongation factor Ts  61.82 
 
 
274 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217525  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2040  elongation factor Ts  61.82 
 
 
274 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1994  elongation factor Ts  61.82 
 
 
274 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12903  elongation factor Ts  64 
 
 
271 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.172192  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2105  translation elongation factor Ts  62.18 
 
 
274 aa  308  5e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4132  elongation factor Ts  61.09 
 
 
271 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.367953  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  57.3 
 
 
277 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  56.47 
 
 
275 aa  299  4e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3112  translation elongation factor Ts  59.34 
 
 
274 aa  295  5e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000959082  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  55.91 
 
 
276 aa  289  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  55.2 
 
 
276 aa  285  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  55.87 
 
 
277 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11200  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  54.09 
 
 
282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130552  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3242  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  59.12 
 
 
270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.388242  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23600  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  51.59 
 
 
279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.13025 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1368  elongation factor Ts  53.41 
 
 
278 aa  273  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0623033  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1385  elongation factor Ts  52.33 
 
 
278 aa  272  5.000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000279942 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1485  translation elongation factor Ts  54.93 
 
 
281 aa  270  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.485707  normal  0.476754 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1005  translation elongation factor Ts  52.48 
 
 
279 aa  266  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06750  elongation factor Ts  49.46 
 
 
278 aa  261  1e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00748724  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10130  elongation factor Ts  51.24 
 
 
274 aa  255  5e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2506  elongation factor Ts  51.41 
 
 
281 aa  249  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.346339 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1181  translation elongation factor Ts  49.82 
 
 
279 aa  233  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.875084  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0808  translation elongation factor Ts  46.13 
 
 
283 aa  229  4e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0404  elongation factor Ts  45.07 
 
 
283 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000167696  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  43.42 
 
 
276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  39.57 
 
 
273 aa  196  5.000000000000001e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  41.28 
 
 
292 aa  192  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  43.97 
 
 
279 aa  192  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  42.86 
 
 
293 aa  192  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  42.5 
 
 
294 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  42.5 
 
 
293 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  42.5 
 
 
293 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  39.8 
 
 
288 aa  190  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  42.14 
 
 
293 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  42.5 
 
 
293 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  42.5 
 
 
293 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  42.5 
 
 
293 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  42.5 
 
 
293 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  43.12 
 
 
291 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  42.24 
 
 
291 aa  189  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1048  elongation factor Ts  44.53 
 
 
269 aa  188  8e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0760308  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  41.67 
 
 
292 aa  187  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  45 
 
 
294 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  42.75 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  39.59 
 
 
288 aa  183  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  39.43 
 
 
294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0049  translation elongation factor Ts  43.57 
 
 
277 aa  182  6e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2009  elongation factor Ts  39.93 
 
 
288 aa  182  7e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  40.36 
 
 
293 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  40 
 
 
293 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  40.36 
 
 
293 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  40.36 
 
 
293 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  41.22 
 
 
296 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  41.5 
 
 
288 aa  180  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  45.71 
 
 
295 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  40.36 
 
 
293 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  45.55 
 
 
295 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  41.26 
 
 
301 aa  180  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  40.36 
 
 
293 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  40.36 
 
 
293 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  40 
 
 
293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0883  translation elongation factor Ts  41.28 
 
 
275 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  41.7 
 
 
293 aa  179  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  45.36 
 
 
295 aa  179  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  40.71 
 
 
291 aa  179  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  45.36 
 
 
295 aa  179  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  45.36 
 
 
295 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  45.36 
 
 
295 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  45.36 
 
 
295 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  45.36 
 
 
295 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  40 
 
 
293 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  45.36 
 
 
295 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  45.36 
 
 
295 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  45.36 
 
 
295 aa  178  8e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3494  translation elongation factor Ts  39.86 
 
 
278 aa  177  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000803049  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  40.75 
 
 
288 aa  177  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3036  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  41.61 
 
 
278 aa  177  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00138132  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  42.86 
 
 
294 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  42.55 
 
 
290 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0548  elongation factor Ts  35.65 
 
 
357 aa  177  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  38.78 
 
 
311 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  39.72 
 
 
291 aa  176  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1196  elongation factor Ts  35.36 
 
 
357 aa  176  4e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0627  translation elongation factor Ts  44.37 
 
 
263 aa  176  5e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.897775  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  41.22 
 
 
292 aa  175  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1315  elongation factor Ts  35.36 
 
 
357 aa  175  8e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  40.36 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  40 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>