More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2210 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2210  elongation factor Ts  100 
 
 		 271 aa  529  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126056  normal  0.227569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4132  elongation factor Ts  94.1 
 
 		 271 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.367953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2040  elongation factor Ts  90.51 
 
 		 274 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1975  elongation factor Ts  90.51 
 
 		 274 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1994  elongation factor Ts  90.51 
 
 		 274 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2105  translation elongation factor Ts  76.64 
 
 		 274 aa  403  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12903  elongation factor Ts  83.03 
 
 		 271 aa  396  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.172192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  73.9 
 
 		 272 aa  392  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5910  translation elongation factor Ts  68.27 
 
 		 271 aa  363  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0273949  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1669  translation elongation factor Ts  68.13 
 
 		 274 aa  342  4e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  60.52 
 
 		 271 aa  337  9e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1231  elongation factor Ts  61.09 
 
 		 275 aa  323  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442239  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3112  translation elongation factor Ts  64.94 
 
 		 274 aa  323  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000959082  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1323  elongation factor Ts  61.59 
 
 		 275 aa  320  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3242  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  64.44 
 
 		 270 aa  318  6e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.388242  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  61.15 
 
 		 278 aa  315  4e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  59.71 
 
 		 278 aa  310  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  57.91 
 
 		 278 aa  303  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2199  translation elongation factor Ts  57.78 
 
 		 270 aa  297  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  57.45 
 
 		 276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  55.27 
 
 		 276 aa  278  8e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23600  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  54.48 
 
 		 279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.13025 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  51.62 
 
 		 277 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1485  translation elongation factor Ts  56.07 
 
 		 281 aa  267  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.485707  normal  0.476754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1368  elongation factor Ts  55.04 
 
 		 278 aa  267  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0623033  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1385  elongation factor Ts  55.04 
 
 		 278 aa  265  4e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000279942 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  52.92 
 
 		 275 aa  263  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1005  translation elongation factor Ts  54.32 
 
 		 279 aa  262  3e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  51.99 
 
 		 277 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06750  elongation factor Ts  53.6 
 
 		 278 aa  259  4e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00748724  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2506  elongation factor Ts  53.93 
 
 		 281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.346339 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10130  elongation factor Ts  51.61 
 
 		 274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11200  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  52.71 
 
 		 282 aa  253  2.0000000000000002e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0404  elongation factor Ts  45.88 
 
 		 283 aa  218  6e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000167696  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1181  translation elongation factor Ts  50.54 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.875084  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  44.8 
 
 		 276 aa  209  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  41.45 
 
 		 273 aa  205  8e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  42.39 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  43.12 
 
 		 293 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0808  translation elongation factor Ts  41.22 
 
 		 283 aa  202  5e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  43.12 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  43.12 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  43.12 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  43.12 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  43.12 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  43.12 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  43.12 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  42.75 
 
 		 293 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  44.85 
 
 		 291 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  43.64 
 
 		 292 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  41.67 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  42.39 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 291 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  42.75 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  42.03 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  42.75 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  42.39 
 
 		 293 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  42.39 
 
 		 293 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  42.39 
 
 		 293 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  43.75 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  41.67 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  42.75 
 
 		 292 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  42.96 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  40.37 
 
 		 291 aa  188  9e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  42.24 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  42.24 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  42.6 
 
 		 292 aa  187  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  42.24 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1279  elongation factor Ts  42.18 
 
 		 292 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.174908 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3036  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  42.55 
 
 		 278 aa  186  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00138132  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  43.17 
 
 		 282 aa  185  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  41.52 
 
 		 285 aa  185  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  42.03 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0508  elongation factor Ts  42.39 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0459419  normal  0.717587 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  42.18 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  42.18 
 
 		 283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0627  translation elongation factor Ts  43.64 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.897775  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  42.09 
 
 		 290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  40.36 
 
 		 283 aa  181  9.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  39.71 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1048  elongation factor Ts  44.81 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0760308  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3359  elongation factor Ts  41.45 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461306  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  43.12 
 
 		 294 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  41.45 
 
 		 283 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  40.43 
 
 		 285 aa  179  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  41.45 
 
 		 283 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  39.07 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  41.45 
 
 		 283 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  41.45 
 
 		 283 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  42.07 
 
 		 292 aa  179  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  37.5 
 
 		 288 aa  178  7e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  41.32 
 
 		 307 aa  178  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  40.73 
 
 		 283 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  40.36 
 
 		 283 aa  178  9e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  40.36 
 
 		 283 aa  178  9e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  40.36 
 
 		 283 aa  178  9e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  40.36 
 
 		 283 aa  178  9e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  40.36 
 
 		 283 aa  178  9e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  40.36 
 
 		 283 aa  178  9e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  40.36 
 
 		 283 aa  178  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>