More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2199 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2199  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 270 aa  536  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1323  elongation factor Ts  65.82 
 
 		 275 aa  363  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1231  elongation factor Ts  64.73 
 
 		 275 aa  358  4e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442239  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  58.89 
 
 		 271 aa  325  6e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5910  translation elongation factor Ts  61.48 
 
 		 271 aa  318  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0273949  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1669  translation elongation factor Ts  59.49 
 
 		 274 aa  308  8e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  58.67 
 
 		 272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  58.84 
 
 		 278 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2105  translation elongation factor Ts  56.41 
 
 		 274 aa  288  6e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  55.23 
 
 		 278 aa  288  7e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2210  elongation factor Ts  57.78 
 
 		 271 aa  285  4e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126056  normal  0.227569 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  52.9 
 
 		 277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4132  elongation factor Ts  57.78 
 
 		 271 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.367953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1975  elongation factor Ts  56.41 
 
 		 274 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2040  elongation factor Ts  56.41 
 
 		 274 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1994  elongation factor Ts  56.41 
 
 		 274 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  55.07 
 
 		 277 aa  281  7.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3112  translation elongation factor Ts  55.56 
 
 		 274 aa  280  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000959082  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  52.71 
 
 		 278 aa  278  9e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3242  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  56.13 
 
 		 270 aa  276  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.388242  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12903  elongation factor Ts  56 
 
 		 271 aa  276  3e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.172192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11200  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  54.12 
 
 		 282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  52 
 
 		 276 aa  268  5.9999999999999995e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  50.18 
 
 		 276 aa  266  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  50.36 
 
 		 275 aa  262  4e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1385  elongation factor Ts  49.82 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000279942 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06750  elongation factor Ts  49.46 
 
 		 278 aa  253  3e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00748724  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1368  elongation factor Ts  49.82 
 
 		 278 aa  251  6e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0623033  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23600  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  49.64 
 
 		 279 aa  249  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.13025 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10130  elongation factor Ts  50.18 
 
 		 274 aa  246  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1485  translation elongation factor Ts  50.18 
 
 		 281 aa  243  3e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.485707  normal  0.476754 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2506  elongation factor Ts  48.75 
 
 		 281 aa  235  6e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.346339 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1005  translation elongation factor Ts  46.95 
 
 		 279 aa  232  6e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0808  translation elongation factor Ts  44.29 
 
 		 283 aa  214  9.999999999999999e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1181  translation elongation factor Ts  46.76 
 
 		 279 aa  211  7.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.875084  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  45.32 
 
 		 279 aa  209  5e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  44.73 
 
 		 293 aa  198  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  44.73 
 
 		 293 aa  198  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  44.28 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  44.36 
 
 		 293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  44.36 
 
 		 293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  44.36 
 
 		 293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  39.27 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0404  elongation factor Ts  42.5 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000167696  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  44 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  42.91 
 
 		 293 aa  193  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0508  elongation factor Ts  43.43 
 
 		 294 aa  192  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0459419  normal  0.717587 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  43.27 
 
 		 293 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  43.27 
 
 		 293 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  43.27 
 
 		 293 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  43.27 
 
 		 293 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  43.27 
 
 		 293 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  43.27 
 
 		 294 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  43.27 
 
 		 293 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  43.84 
 
 		 294 aa  191  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  44.69 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  42.7 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  43.64 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  42.55 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  40.65 
 
 		 276 aa  189  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  41.45 
 
 		 293 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  44.2 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  41.82 
 
 		 293 aa  185  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  40.88 
 
 		 292 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  40.94 
 
 		 290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  41.39 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  41.24 
 
 		 292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  44.33 
 
 		 301 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  41.67 
 
 		 296 aa  181  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  41.16 
 
 		 291 aa  180  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3036  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  40.78 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00138132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  41.09 
 
 		 292 aa  180  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  39.11 
 
 		 290 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 283 aa  178  9e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  39.27 
 
 		 292 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  40.07 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  41.43 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  41.09 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0883  translation elongation factor Ts  40.65 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3494  translation elongation factor Ts  41.43 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000803049  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  38.01 
 
 		 288 aa  175  7e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  38.49 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0049  translation elongation factor Ts  39.07 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  40.15 
 
 		 283 aa  172  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  41.79 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  39.85 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  41.3 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  41.3 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  41.3 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  41.3 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  41.3 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  41.3 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  41.3 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  41.3 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  41.3 
 
 		 295 aa  169  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  39.42 
 
 		 283 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  38.41 
 
 		 285 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  38.41 
 
 		 285 aa  169  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  40.07 
 
 		 301 aa  169  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  38.41 
 
 		 285 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>