More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1485 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1485  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 281 aa  551  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.485707  normal  0.476754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23600  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  67.62 
 
 		 279 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.13025 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1005  translation elongation factor Ts  67.97 
 
 		 279 aa  363  2e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10130  elongation factor Ts  66.31 
 
 		 274 aa  362  3e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2506  elongation factor Ts  72.24 
 
 		 281 aa  358  8e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.346339 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06750  elongation factor Ts  66.08 
 
 		 278 aa  354  1e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00748724  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1368  elongation factor Ts  65.14 
 
 		 278 aa  350  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0623033  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1385  elongation factor Ts  64.08 
 
 		 278 aa  348  8e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000279942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  61.35 
 
 		 276 aa  335  5.999999999999999e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11200  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  62.32 
 
 		 282 aa  332  3e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  57.3 
 
 		 275 aa  320  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  58.01 
 
 		 278 aa  311  1e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  58.57 
 
 		 276 aa  298  6e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  54.09 
 
 		 277 aa  296  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  53.74 
 
 		 278 aa  295  7e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1181  translation elongation factor Ts  59.64 
 
 		 279 aa  293  2e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.875084  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1231  elongation factor Ts  57.04 
 
 		 275 aa  291  6e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442239  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1323  elongation factor Ts  56.69 
 
 		 275 aa  291  7e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  54.8 
 
 		 278 aa  288  6e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  54.09 
 
 		 272 aa  279  4e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  53.21 
 
 		 277 aa  277  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0808  translation elongation factor Ts  51.79 
 
 		 283 aa  275  4e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5910  translation elongation factor Ts  55.71 
 
 		 271 aa  272  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0273949  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1669  translation elongation factor Ts  54.77 
 
 		 274 aa  267  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2210  elongation factor Ts  56.07 
 
 		 271 aa  265  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126056  normal  0.227569 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0404  elongation factor Ts  53.57 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000167696  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2040  elongation factor Ts  57.24 
 
 		 274 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1994  elongation factor Ts  57.24 
 
 		 274 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1975  elongation factor Ts  57.24 
 
 		 274 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  50 
 
 		 271 aa  261  8.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2105  translation elongation factor Ts  53.71 
 
 		 274 aa  260  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2199  translation elongation factor Ts  51.25 
 
 		 270 aa  258  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4132  elongation factor Ts  55 
 
 		 271 aa  255  7e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.367953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3112  translation elongation factor Ts  52.5 
 
 		 274 aa  247  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000959082  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12903  elongation factor Ts  55.71 
 
 		 271 aa  246  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.172192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3242  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  53.19 
 
 		 270 aa  228  9e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.388242  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  43.07 
 
 		 292 aa  212  4.9999999999999996e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  43.75 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  43.96 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  38.79 
 
 		 273 aa  198  9e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  42.7 
 
 		 291 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  41.84 
 
 		 288 aa  195  7e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  42.55 
 
 		 279 aa  195  9e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  43.37 
 
 		 294 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  43.01 
 
 		 276 aa  193  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  40.57 
 
 		 292 aa  192  5e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  42.28 
 
 		 291 aa  188  9e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  41.88 
 
 		 295 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  41.88 
 
 		 295 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  41.88 
 
 		 295 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  41.88 
 
 		 295 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  41.49 
 
 		 290 aa  187  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  41.88 
 
 		 295 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1048  elongation factor Ts  43.57 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0760308  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  39.65 
 
 		 299 aa  186  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  40.96 
 
 		 307 aa  186  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  37.55 
 
 		 294 aa  186  5e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0627  translation elongation factor Ts  43.01 
 
 		 263 aa  186  5e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.897775  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0049  translation elongation factor Ts  41.79 
 
 		 277 aa  185  6e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  40.48 
 
 		 308 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  41.52 
 
 		 295 aa  185  9e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  41.52 
 
 		 295 aa  185  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  41.52 
 
 		 295 aa  185  9e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  40.14 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  41.52 
 
 		 295 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  38.91 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  41.16 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  41.52 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  41.52 
 
 		 295 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  40.79 
 
 		 294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  41.1 
 
 		 310 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  38.31 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  39.39 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  40 
 
 		 283 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  38.38 
 
 		 291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  37.94 
 
 		 292 aa  178  7e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  178  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4744  translation elongation factor Ts  40.21 
 
 		 277 aa  178  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  39.5 
 
 		 293 aa  178  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  42.91 
 
 		 303 aa  178  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  38.49 
 
 		 291 aa  178  9e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  39.46 
 
 		 308 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  38.08 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  39.12 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  38.57 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  37.54 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>