More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1994 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_2040  elongation factor Ts  100 
 
 		 274 aa  536  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1975  elongation factor Ts  100 
 
 		 274 aa  536  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1994  elongation factor Ts  100 
 
 		 274 aa  536  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2210  elongation factor Ts  90.51 
 
 		 271 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126056  normal  0.227569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4132  elongation factor Ts  92.34 
 
 		 271 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.367953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2105  translation elongation factor Ts  78.83 
 
 		 274 aa  410  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12903  elongation factor Ts  83.58 
 
 		 271 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.172192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  74.55 
 
 		 272 aa  394  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5910  translation elongation factor Ts  68.98 
 
 		 271 aa  368  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0273949  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1669  translation elongation factor Ts  68.5 
 
 		 274 aa  353  1e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  60.58 
 
 		 271 aa  334  7e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3112  translation elongation factor Ts  67.16 
 
 		 274 aa  331  7.000000000000001e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000959082  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1231  elongation factor Ts  61.45 
 
 		 275 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442239  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  63.7 
 
 		 278 aa  325  5e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1323  elongation factor Ts  61.82 
 
 		 275 aa  323  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3242  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  63.74 
 
 		 270 aa  317  9e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.388242  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  60.5 
 
 		 278 aa  311  6.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  59.79 
 
 		 278 aa  310  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2199  translation elongation factor Ts  56.41 
 
 		 270 aa  297  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  60.07 
 
 		 276 aa  297  1e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  57.19 
 
 		 276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23600  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  54.96 
 
 		 279 aa  282  5.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.13025 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1368  elongation factor Ts  55.4 
 
 		 278 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0623033  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06750  elongation factor Ts  53.96 
 
 		 278 aa  272  4.0000000000000004e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00748724  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1385  elongation factor Ts  55.04 
 
 		 278 aa  271  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000279942 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1485  translation elongation factor Ts  57.24 
 
 		 281 aa  270  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.485707  normal  0.476754 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  51.07 
 
 		 277 aa  263  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1005  translation elongation factor Ts  54.45 
 
 		 279 aa  261  1e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  52.35 
 
 		 275 aa  258  6e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2506  elongation factor Ts  54.77 
 
 		 281 aa  258  6e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.346339 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10130  elongation factor Ts  51.06 
 
 		 274 aa  256  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  50.36 
 
 		 277 aa  249  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11200  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  51.07 
 
 		 282 aa  248  5e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0404  elongation factor Ts  46.1 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000167696  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1181  translation elongation factor Ts  51.96 
 
 		 279 aa  217  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.875084  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  45.71 
 
 		 276 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0808  translation elongation factor Ts  43.62 
 
 		 283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  40.65 
 
 		 273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  42.65 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  42.29 
 
 		 292 aa  193  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  42.29 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  42.65 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  42.65 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  42.65 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  42.65 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  42.65 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  42.65 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  42.65 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  42.45 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  43.64 
 
 		 288 aa  191  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  44.57 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  45.26 
 
 		 291 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  42.34 
 
 		 296 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  41.58 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  43.57 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  44.16 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  43.57 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  43.57 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  41.58 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  41.94 
 
 		 293 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  41.94 
 
 		 293 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  41.94 
 
 		 293 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  41.94 
 
 		 293 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  41.94 
 
 		 293 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  41.58 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  40.51 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  43.64 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3036  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  41.34 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00138132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  41.58 
 
 		 292 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  41.22 
 
 		 293 aa  182  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  41.43 
 
 		 285 aa  182  8.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  40.93 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  41.43 
 
 		 285 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  42.45 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0627  translation elongation factor Ts  43.97 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.897775  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  41.73 
 
 		 283 aa  179  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  40.28 
 
 		 307 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  41.73 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  41.73 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  41.73 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  41.73 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  41.37 
 
 		 292 aa  177  1e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  41.73 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  41.73 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  41.73 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  41.73 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  41.73 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  41.32 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  42.09 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  42.09 
 
 		 283 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  42.09 
 
 		 283 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  42.09 
 
 		 283 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  42.09 
 
 		 283 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  40.86 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0508  elongation factor Ts  41.22 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0459419  normal  0.717587 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  41.13 
 
 		 290 aa  176  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  42.09 
 
 		 283 aa  175  6e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  39.79 
 
 		 308 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  42.09 
 
 		 283 aa  175  6e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  38.57 
 
 		 294 aa  175  6e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>