More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10130 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_10130  elongation factor Ts  100 
 
 		 274 aa  543  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23600  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  61.65 
 
 		 279 aa  347  9e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.13025 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1485  translation elongation factor Ts  65.6 
 
 		 281 aa  340  1e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.485707  normal  0.476754 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2506  elongation factor Ts  64.77 
 
 		 281 aa  337  1.9999999999999998e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.346339 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06750  elongation factor Ts  59.93 
 
 		 278 aa  328  8e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00748724  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1368  elongation factor Ts  59.93 
 
 		 278 aa  318  6e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0623033  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1385  elongation factor Ts  59.57 
 
 		 278 aa  318  7.999999999999999e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000279942 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1005  translation elongation factor Ts  57.35 
 
 		 279 aa  313  9.999999999999999e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11200  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  56.89 
 
 		 282 aa  300  2e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1181  translation elongation factor Ts  55.28 
 
 		 279 aa  297  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.875084  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  55.2 
 
 		 275 aa  295  5e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  52.86 
 
 		 276 aa  288  6e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  51.43 
 
 		 278 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  51.61 
 
 		 276 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  51.59 
 
 		 278 aa  268  5e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0808  translation elongation factor Ts  50 
 
 		 283 aa  263  3e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1231  elongation factor Ts  51.24 
 
 		 275 aa  258  8e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442239  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1323  elongation factor Ts  51.24 
 
 		 275 aa  255  5e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  49.46 
 
 		 277 aa  255  7e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2105  translation elongation factor Ts  50 
 
 		 274 aa  249  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0404  elongation factor Ts  50.36 
 
 		 283 aa  249  3e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000167696  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  46.79 
 
 		 278 aa  248  9e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2199  translation elongation factor Ts  50.18 
 
 		 270 aa  246  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2210  elongation factor Ts  51.61 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126056  normal  0.227569 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  47.14 
 
 		 272 aa  242  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1975  elongation factor Ts  51.06 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2040  elongation factor Ts  51.06 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1994  elongation factor Ts  51.06 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  45.88 
 
 		 277 aa  238  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1669  translation elongation factor Ts  48.4 
 
 		 274 aa  236  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4132  elongation factor Ts  50.54 
 
 		 271 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.367953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5910  translation elongation factor Ts  48.39 
 
 		 271 aa  231  7.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0273949  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12903  elongation factor Ts  50.9 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.172192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3242  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  51.43 
 
 		 270 aa  226  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.388242  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  45.04 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3112  translation elongation factor Ts  48.75 
 
 		 274 aa  217  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000959082  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  43.27 
 
 		 291 aa  202  7e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  41.67 
 
 		 291 aa  199  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  42.65 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  42.76 
 
 		 294 aa  195  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  41.78 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  41.39 
 
 		 285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  41.3 
 
 		 296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  41.76 
 
 		 285 aa  188  7e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0627  translation elongation factor Ts  42.49 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.897775  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  41.5 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  43.01 
 
 		 294 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  38.64 
 
 		 288 aa  185  6e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  43.62 
 
 		 295 aa  185  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  40.93 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  43.26 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  43.26 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  43.26 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  43.26 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  43.26 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  42.91 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  43.26 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  38.78 
 
 		 311 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  41.82 
 
 		 291 aa  182  7e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  42.91 
 
 		 295 aa  182  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  42.91 
 
 		 295 aa  182  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  42.91 
 
 		 295 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  40.86 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  39.56 
 
 		 285 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  39.86 
 
 		 308 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  39.56 
 
 		 285 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  40.43 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  40.07 
 
 		 308 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  41.3 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  39.56 
 
 		 285 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  41.39 
 
 		 283 aa  179  4e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  40.29 
 
 		 290 aa  178  7e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  38.43 
 
 		 291 aa  177  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  38.62 
 
 		 307 aa  177  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  37.37 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  40.07 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  38.62 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  39.73 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  37.8 
 
 		 288 aa  176  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  39.19 
 
 		 283 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  39.19 
 
 		 283 aa  176  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  39.19 
 
 		 283 aa  176  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  39.19 
 
 		 283 aa  176  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  39.19 
 
 		 283 aa  176  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  37.93 
 
 		 312 aa  176  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  39.19 
 
 		 283 aa  176  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  39.19 
 
 		 283 aa  176  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  39.19 
 
 		 283 aa  176  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  39.19 
 
 		 283 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  36.63 
 
 		 294 aa  175  8e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  40.79 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  39.19 
 
 		 283 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  38.71 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  39.93 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  38.49 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1370  elongation factor Ts  42.21 
 
 		 308 aa  173  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1824  elongation factor Ts  40.07 
 
 		 298 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.31491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  40 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  38.83 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0976  elongation factor Ts  36.62 
 
 		 292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>