More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1368 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1368  elongation factor Ts  100 
 
 		 278 aa  540  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0623033  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1385  elongation factor Ts  95.68 
 
 		 278 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000279942 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06750  elongation factor Ts  74.1 
 
 		 278 aa  405  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00748724  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23600  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  61.7 
 
 		 279 aa  336  1.9999999999999998e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.13025 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11200  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  61.92 
 
 		 282 aa  333  2e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130552  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1485  translation elongation factor Ts  65.14 
 
 		 281 aa  330  1e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.485707  normal  0.476754 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1005  translation elongation factor Ts  61.7 
 
 		 279 aa  328  6e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10130  elongation factor Ts  59.93 
 
 		 274 aa  322  3e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  57.71 
 
 		 276 aa  319  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  57.19 
 
 		 275 aa  317  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2506  elongation factor Ts  63.03 
 
 		 281 aa  311  9e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.346339 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  55.76 
 
 		 276 aa  296  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  52.86 
 
 		 278 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1231  elongation factor Ts  54.84 
 
 		 275 aa  281  8.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442239  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1323  elongation factor Ts  53.41 
 
 		 275 aa  278  9e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  51.43 
 
 		 278 aa  277  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1669  translation elongation factor Ts  55.04 
 
 		 274 aa  275  6e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  53.76 
 
 		 272 aa  272  5.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1181  translation elongation factor Ts  54.96 
 
 		 279 aa  269  4e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.875084  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5910  translation elongation factor Ts  56.47 
 
 		 271 aa  268  5.9999999999999995e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0273949  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  49.1 
 
 		 277 aa  268  7e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  50.18 
 
 		 277 aa  267  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  50 
 
 		 271 aa  260  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  48.93 
 
 		 278 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2210  elongation factor Ts  55.04 
 
 		 271 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126056  normal  0.227569 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1975  elongation factor Ts  55.4 
 
 		 274 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2040  elongation factor Ts  55.4 
 
 		 274 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1994  elongation factor Ts  55.4 
 
 		 274 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4132  elongation factor Ts  55.04 
 
 		 271 aa  255  5e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.367953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2199  translation elongation factor Ts  50.18 
 
 		 270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0808  translation elongation factor Ts  49.11 
 
 		 283 aa  246  4e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2105  translation elongation factor Ts  52.16 
 
 		 274 aa  242  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12903  elongation factor Ts  53.24 
 
 		 271 aa  235  7e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.172192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3112  translation elongation factor Ts  50.18 
 
 		 274 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000959082  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3242  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  50.18 
 
 		 270 aa  226  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.388242  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0404  elongation factor Ts  47.69 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000167696  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  44.32 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  42.81 
 
 		 279 aa  209  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  42.6 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  40.5 
 
 		 273 aa  202  5e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  44.73 
 
 		 292 aa  202  5e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  41.73 
 
 		 276 aa  199  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  42.7 
 
 		 289 aa  192  5e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  41.76 
 
 		 291 aa  191  8e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  41.03 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  40.07 
 
 		 311 aa  188  8e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  41.01 
 
 		 293 aa  188  9e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  40.43 
 
 		 294 aa  187  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  43.07 
 
 		 290 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  41.01 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  40.65 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1224  elongation factor Ts  44.17 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0842617  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  41.39 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2584  elongation factor Ts  44.17 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.958437  normal  0.0691199 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  40.65 
 
 		 293 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0976  elongation factor Ts  39.64 
 
 		 292 aa  186  5e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120791  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  43.53 
 
 		 283 aa  185  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  43.53 
 
 		 283 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  43.53 
 
 		 283 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  43.53 
 
 		 283 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  43.53 
 
 		 283 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  39.37 
 
 		 303 aa  185  8e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  40.65 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  40.65 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  39.35 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  40.65 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  40.65 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  40.65 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  40.65 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0049  translation elongation factor Ts  41.94 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  40.65 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  40.29 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  42.81 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  40.78 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  41.97 
 
 		 292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  42.81 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  42.49 
 
 		 290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  43.53 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4947  elongation factor Ts  42.76 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725699 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  38.98 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  42.65 
 
 		 291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  39.57 
 
 		 293 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 293 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  39.57 
 
 		 294 aa  181  9.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 293 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  36.52 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  41.16 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  41.43 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>