More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5910 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5910  translation elongation factor Ts  100 
 
 
271 aa  536  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0273949  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  73.9 
 
 
272 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  64.21 
 
 
271 aa  362  4e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12903  elongation factor Ts  71.59 
 
 
271 aa  360  1e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.172192  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1975  elongation factor Ts  68.98 
 
 
274 aa  360  1e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217525  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1994  elongation factor Ts  68.98 
 
 
274 aa  360  1e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2040  elongation factor Ts  68.98 
 
 
274 aa  360  1e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4132  elongation factor Ts  69 
 
 
271 aa  359  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.367953  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2210  elongation factor Ts  68.27 
 
 
271 aa  357  9e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126056  normal  0.227569 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1323  elongation factor Ts  65.82 
 
 
275 aa  354  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1231  elongation factor Ts  65.45 
 
 
275 aa  352  5e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442239  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2105  translation elongation factor Ts  66.79 
 
 
274 aa  347  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  62.95 
 
 
278 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1669  translation elongation factor Ts  63 
 
 
274 aa  335  2.9999999999999997e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3112  translation elongation factor Ts  65.81 
 
 
274 aa  335  5.999999999999999e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000959082  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3242  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  66.67 
 
 
270 aa  334  7.999999999999999e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.388242  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  62.91 
 
 
276 aa  333  2e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  61.15 
 
 
278 aa  332  4e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2199  translation elongation factor Ts  61.48 
 
 
270 aa  324  9e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  60.73 
 
 
276 aa  323  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  58.63 
 
 
278 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  54.87 
 
 
277 aa  308  5e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  53.07 
 
 
277 aa  289  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1368  elongation factor Ts  56.47 
 
 
278 aa  275  5e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0623033  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1385  elongation factor Ts  56.12 
 
 
278 aa  274  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000279942 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  54.38 
 
 
275 aa  274  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1485  translation elongation factor Ts  55.71 
 
 
281 aa  272  5.000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.485707  normal  0.476754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23600  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  53.76 
 
 
279 aa  270  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.13025 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1005  translation elongation factor Ts  52.88 
 
 
279 aa  270  2.9999999999999997e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11200  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  52.71 
 
 
282 aa  268  5e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130552  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06750  elongation factor Ts  53.24 
 
 
278 aa  259  4e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00748724  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2506  elongation factor Ts  53.93 
 
 
281 aa  256  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.346339 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10130  elongation factor Ts  48.39 
 
 
274 aa  236  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1181  translation elongation factor Ts  48.39 
 
 
279 aa  226  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.875084  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  43.88 
 
 
276 aa  217  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  45.65 
 
 
294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  45.65 
 
 
293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  45.65 
 
 
293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  45.65 
 
 
293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  45.65 
 
 
293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  45.65 
 
 
293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  45.65 
 
 
293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  45.65 
 
 
293 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  45.29 
 
 
293 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  44.93 
 
 
293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  41.45 
 
 
273 aa  212  4.9999999999999996e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  44.57 
 
 
293 aa  212  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  44.57 
 
 
293 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  44.4 
 
 
292 aa  208  8e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  44.77 
 
 
292 aa  208  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  44.2 
 
 
293 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  44.2 
 
 
293 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  44.2 
 
 
293 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  44.2 
 
 
293 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  44.2 
 
 
293 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  44.93 
 
 
292 aa  204  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  43.84 
 
 
293 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  43.64 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3036  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  42.86 
 
 
278 aa  196  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00138132  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  44 
 
 
279 aa  194  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  43.43 
 
 
296 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0808  translation elongation factor Ts  42.29 
 
 
283 aa  193  2e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  43.27 
 
 
292 aa  192  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  44.4 
 
 
294 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  39.12 
 
 
311 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0404  elongation factor Ts  43.42 
 
 
283 aa  191  1e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000167696  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  39.49 
 
 
292 aa  191  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  43.4 
 
 
303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  38.71 
 
 
294 aa  188  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0508  elongation factor Ts  42.75 
 
 
294 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0459419  normal  0.717587 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0049  translation elongation factor Ts  42.09 
 
 
277 aa  187  1e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  42.24 
 
 
285 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  40.22 
 
 
291 aa  187  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  38.01 
 
 
288 aa  186  5e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  43.75 
 
 
291 aa  185  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  42.24 
 
 
285 aa  185  7e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1647  elongation factor Ts  39.12 
 
 
288 aa  185  8e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4744  translation elongation factor Ts  42.18 
 
 
277 aa  184  9e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848801  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  41.67 
 
 
294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  42.96 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  42.96 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  39.78 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  42.96 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  39.57 
 
 
291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3494  translation elongation factor Ts  41.22 
 
 
278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000803049  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  41.58 
 
 
290 aa  182  6e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0627  translation elongation factor Ts  42.18 
 
 
263 aa  181  2e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.897775  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  41.43 
 
 
267 aa  179  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  43.06 
 
 
307 aa  179  4e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  40.14 
 
 
288 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  36.95 
 
 
312 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0883  translation elongation factor Ts  42.09 
 
 
275 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  41.18 
 
 
291 aa  176  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1279  elongation factor Ts  43.64 
 
 
292 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.174908 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  41.3 
 
 
283 aa  175  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0404  elongation factor Ts  37.41 
 
 
288 aa  175  7e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  39.48 
 
 
291 aa  175  9e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  39.48 
 
 
292 aa  175  9e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  41.52 
 
 
294 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  38.41 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>