More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0724 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0724  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 320 aa  644    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1609  translation elongation factor Ts  69.69 
 
 		 320 aa  462  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00132099  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04070  elongation factor Ts  67.6 
 
 		 321 aa  453  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0407  translation elongation factor Ts  43.58 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1441  elongation factor Ts  42.47 
 
 		 354 aa  249  4e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1261  elongation factor Ts  43.07 
 
 		 354 aa  240  2e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00427037  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0883  translation elongation factor Ts  42.72 
 
 		 275 aa  236  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1801  elongation factor Ts  45.87 
 
 		 350 aa  235  6e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.450992  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  44.55 
 
 		 279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0550  elongation factor Ts  43.77 
 
 		 348 aa  229  5e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00242368  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1315  elongation factor Ts  42.2 
 
 		 357 aa  224  1e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1196  elongation factor Ts  41.9 
 
 		 357 aa  223  4.9999999999999996e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2454  elongation factor Ts  45.79 
 
 		 342 aa  222  8e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000114512  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1831  elongation factor Ts  45.2 
 
 		 346 aa  221  9e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0135802  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0548  elongation factor Ts  41.59 
 
 		 357 aa  221  9e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0106  elongation factor Ts  44.92 
 
 		 346 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1093  elongation factor Ts  40 
 
 		 358 aa  218  7.999999999999999e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.569286  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0839  elongation factor Ts  40.81 
 
 		 352 aa  216  4e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0656173  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0802  elongation factor Ts  44.79 
 
 		 341 aa  211  1e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000434061  hitchhiker  0.00000000000000232724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4744  translation elongation factor Ts  39.94 
 
 		 277 aa  196  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0049  translation elongation factor Ts  40.31 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  37.54 
 
 		 276 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3494  translation elongation factor Ts  36.84 
 
 		 278 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000803049  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_002950  PG0378  elongation factor Ts  35.4 
 
 		 274 aa  179  4e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  36.42 
 
 		 288 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3036  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  35.28 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00138132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  37.89 
 
 		 278 aa  168  9e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  36.02 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2352  elongation factor Ts  36.61 
 
 		 288 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000872397  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  36.11 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  34.59 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  35.4 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  34.93 
 
 		 288 aa  160  4e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  36.22 
 
 		 278 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1231  elongation factor Ts  38.77 
 
 		 275 aa  159  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442239  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  35.93 
 
 		 286 aa  159  7e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1647  elongation factor Ts  35.82 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1323  elongation factor Ts  38.15 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2009  elongation factor Ts  34.63 
 
 		 288 aa  155  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  34.26 
 
 		 277 aa  152  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  34.03 
 
 		 288 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06750  elongation factor Ts  34.57 
 
 		 278 aa  152  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00748724  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  37.7 
 
 		 310 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  33.44 
 
 		 291 aa  150  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  34.92 
 
 		 311 aa  149  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2547  elongation factor Ts  33.02 
 
 		 306 aa  148  9e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  33.33 
 
 		 276 aa  149  9e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  37.69 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  34.57 
 
 		 271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  33.63 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0404  elongation factor Ts  36.86 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  34.02 
 
 		 314 aa  146  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  36.71 
 
 		 303 aa  146  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  33.03 
 
 		 288 aa  145  6e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2199  translation elongation factor Ts  34.91 
 
 		 270 aa  146  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  33.75 
 
 		 291 aa  145  8.000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0808  translation elongation factor Ts  35.19 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  32.71 
 
 		 277 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1385  elongation factor Ts  34.57 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000279942 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  33.12 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  36.39 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  32.82 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  34.98 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  32.92 
 
 		 294 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  31.55 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  31.55 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  33.65 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  35.33 
 
 		 293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1104  translation elongation factor Ts  33.63 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  36.02 
 
 		 272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  35.16 
 
 		 292 aa  139  7e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1368  elongation factor Ts  34.26 
 
 		 278 aa  139  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0623033  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  32.08 
 
 		 285 aa  139  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  34.91 
 
 		 293 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  34.91 
 
 		 293 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  34.91 
 
 		 293 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  35.49 
 
 		 276 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  31.56 
 
 		 292 aa  139  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  33.95 
 
 		 299 aa  139  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  34.59 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  36.53 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  34.91 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  34.91 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl560  elongation factor Ts  33.86 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  32.92 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  32.92 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  34.59 
 
 		 293 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  35.91 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  35.22 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  31.97 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  32.92 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  31.55 
 
 		 286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  31.25 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0372  elongation factor Ts  32.91 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0531  elongation factor Ts  33.12 
 
 		 286 aa  136  5e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0528  translation elongation factor Ts  29.78 
 
 		 280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.101205  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  34.7 
 
 		 294 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  34.7 
 
 		 293 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  34.7 
 
 		 293 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  34.7 
 
 		 293 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>