More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0839 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0839  elongation factor Ts  100 
 
 		 352 aa  715    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0656173  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1441  elongation factor Ts  67.23 
 
 		 354 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1261  elongation factor Ts  70.06 
 
 		 354 aa  482  1e-135  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00427037  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0550  elongation factor Ts  71.55 
 
 		 348 aa  479  1e-134  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00242368  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1093  elongation factor Ts  63.48 
 
 		 358 aa  453  1.0000000000000001e-126  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.569286  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0407  translation elongation factor Ts  59.94 
 
 		 355 aa  450  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1196  elongation factor Ts  63.1 
 
 		 357 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1315  elongation factor Ts  62.82 
 
 		 357 aa  444  1e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0548  elongation factor Ts  62.82 
 
 		 357 aa  444  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1801  elongation factor Ts  49.16 
 
 		 350 aa  344  1e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.450992  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0106  elongation factor Ts  45.76 
 
 		 346 aa  276  5e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0802  elongation factor Ts  46.74 
 
 		 341 aa  271  1e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000434061  hitchhiker  0.00000000000000232724 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1831  elongation factor Ts  45.64 
 
 		 346 aa  268  1e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0135802  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2454  elongation factor Ts  43.75 
 
 		 342 aa  246  4e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000114512  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04070  elongation factor Ts  43.23 
 
 		 321 aa  245  6.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1609  translation elongation factor Ts  41.57 
 
 		 320 aa  245  9e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00132099  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0724  translation elongation factor Ts  40.81 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  36.39 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  41.88 
 
 		 303 aa  228  9e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  41.88 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  38.03 
 
 		 310 aa  222  6e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  35.59 
 
 		 303 aa  219  7e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  36.75 
 
 		 293 aa  212  7.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  38.46 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  37.68 
 
 		 296 aa  209  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  36.03 
 
 		 312 aa  208  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  35.43 
 
 		 292 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  36.9 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  37.85 
 
 		 291 aa  203  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  35.54 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  35.28 
 
 		 312 aa  202  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  37.22 
 
 		 290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl560  elongation factor Ts  37.15 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  35.71 
 
 		 289 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  35.57 
 
 		 290 aa  197  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  33.72 
 
 		 307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  38.18 
 
 		 292 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  36.57 
 
 		 292 aa  196  6e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  37.5 
 
 		 294 aa  196  6e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  34.47 
 
 		 300 aa  196  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  34 
 
 		 312 aa  195  9e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  36.29 
 
 		 292 aa  195  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  35.04 
 
 		 291 aa  195  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  34 
 
 		 307 aa  195  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  35.31 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  33.05 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  33.71 
 
 		 308 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  38.53 
 
 		 294 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  34.83 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  35.31 
 
 		 291 aa  191  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  32.85 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  33.05 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  34.67 
 
 		 292 aa  188  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  39.38 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  35.63 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  34.83 
 
 		 308 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  35.92 
 
 		 285 aa  186  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  36.65 
 
 		 291 aa  186  5e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  32.74 
 
 		 288 aa  186  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  37.64 
 
 		 299 aa  185  8e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  36.57 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1370  elongation factor Ts  36.86 
 
 		 308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  33.52 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  33.71 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  32.86 
 
 		 307 aa  183  3e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  34.76 
 
 		 282 aa  183  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  35.76 
 
 		 290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  35.59 
 
 		 291 aa  182  7e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  32.18 
 
 		 310 aa  182  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  33.43 
 
 		 310 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  34.96 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  34.96 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  34.96 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  37.68 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1104  translation elongation factor Ts  32.23 
 
 		 286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  34.68 
 
 		 286 aa  180  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  32.34 
 
 		 313 aa  180  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1265  elongation factor Ts  35.51 
 
 		 291 aa  180  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  35.16 
 
 		 283 aa  179  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  35.2 
 
 		 308 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  35.43 
 
 		 283 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0372  elongation factor Ts  35.23 
 
 		 295 aa  179  7e-44  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  35.14 
 
 		 283 aa  179  8e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  35.14 
 
 		 283 aa  179  8e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  35.14 
 
 		 283 aa  179  8e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  35.14 
 
 		 283 aa  179  8e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  35.14 
 
 		 283 aa  179  8e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  35.14 
 
 		 283 aa  179  8e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  35.14 
 
 		 283 aa  179  8e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  35.14 
 
 		 283 aa  179  8e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  35.14 
 
 		 283 aa  179  8e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  34.92 
 
 		 308 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  31.61 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3359  elongation factor Ts  35.33 
 
 		 283 aa  178  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  35.04 
 
 		 283 aa  178  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  32.67 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  31.61 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  32.67 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  33.88 
 
 		 314 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  37.68 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>