More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0372 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0372  elongation factor Ts  100 
 
 
295 aa  589  1e-167  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl560  elongation factor Ts  74.58 
 
 
297 aa  454  1e-127  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  45.61 
 
 
292 aa  230  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  45.27 
 
 
294 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  45.24 
 
 
293 aa  227  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  45.24 
 
 
293 aa  227  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0976  elongation factor Ts  44.37 
 
 
292 aa  226  5.0000000000000005e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120791  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  42.76 
 
 
291 aa  224  9e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  44.93 
 
 
294 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  44.59 
 
 
295 aa  221  9e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  44.59 
 
 
295 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  44.26 
 
 
295 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  44.26 
 
 
295 aa  219  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  44.26 
 
 
295 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  44.26 
 
 
295 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  44.26 
 
 
295 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  44.26 
 
 
295 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  44.26 
 
 
295 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  44.26 
 
 
295 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  44.59 
 
 
295 aa  216  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf063  elongation factor Ts  43.1 
 
 
292 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  41.64 
 
 
291 aa  212  7e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  43.48 
 
 
294 aa  211  9e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  41.02 
 
 
292 aa  209  5e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  41.22 
 
 
294 aa  208  7e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  44.22 
 
 
292 aa  208  7e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  41.02 
 
 
292 aa  207  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  39.29 
 
 
310 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  40.95 
 
 
314 aa  203  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  42.03 
 
 
292 aa  203  3e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0597  elongation factor Ts  41.3 
 
 
291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  39.87 
 
 
292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  40.07 
 
 
293 aa  198  9e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  37.25 
 
 
293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  38.31 
 
 
289 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  41.72 
 
 
292 aa  195  7e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  38.1 
 
 
313 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  40.89 
 
 
290 aa  192  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  35.94 
 
 
276 aa  191  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2454  elongation factor Ts  39.94 
 
 
342 aa  189  4e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000114512  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  41.3 
 
 
291 aa  189  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  38.13 
 
 
291 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  39.93 
 
 
292 aa  188  1e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  38.67 
 
 
292 aa  188  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  38.67 
 
 
292 aa  188  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  43.15 
 
 
294 aa  186  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  37.71 
 
 
291 aa  186  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0390  elongation factor Ts  38.97 
 
 
294 aa  185  9e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.432291  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  38.98 
 
 
290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  39.59 
 
 
292 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  38.78 
 
 
282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  42.19 
 
 
299 aa  182  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  37.5 
 
 
303 aa  182  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  40 
 
 
296 aa  181  9.000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  40 
 
 
296 aa  181  9.000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0351  elongation factor Ts  38.62 
 
 
294 aa  181  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.556574  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  40.74 
 
 
285 aa  180  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  40.68 
 
 
285 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  40.74 
 
 
285 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  40.74 
 
 
285 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0802  elongation factor Ts  37.17 
 
 
341 aa  180  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000434061  hitchhiker  0.00000000000000232724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  37.58 
 
 
308 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1441  elongation factor Ts  35.65 
 
 
354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  40 
 
 
285 aa  178  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  35.92 
 
 
292 aa  177  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  38.26 
 
 
312 aa  178  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  37.21 
 
 
310 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  37.25 
 
 
308 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  37.25 
 
 
301 aa  176  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  40.27 
 
 
291 aa  176  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  39.36 
 
 
273 aa  175  7e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1315  elongation factor Ts  34.92 
 
 
357 aa  175  7e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0839  elongation factor Ts  34.66 
 
 
352 aa  175  8e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0656173  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1196  elongation factor Ts  34.92 
 
 
357 aa  175  9e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1265  elongation factor Ts  41.08 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  39.73 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3052  elongation factor Ts  37.5 
 
 
287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.204992  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  37.21 
 
 
305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1831  elongation factor Ts  37.88 
 
 
346 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0135802  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  37.21 
 
 
305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1102  elongation factor Ts  39.2 
 
 
287 aa  172  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.433956  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1261  elongation factor Ts  33.33 
 
 
354 aa  172  5e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00427037  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  38.33 
 
 
289 aa  172  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  38.46 
 
 
292 aa  172  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  35.95 
 
 
308 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  36.57 
 
 
308 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  36.89 
 
 
308 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  36.36 
 
 
303 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0548  elongation factor Ts  34.36 
 
 
357 aa  171  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1273  elongation factor Ts  36.82 
 
 
286 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00309579  normal  0.676189 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0106  elongation factor Ts  36.69 
 
 
346 aa  171  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1093  elongation factor Ts  33.33 
 
 
358 aa  170  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.569286  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0407  translation elongation factor Ts  33.62 
 
 
355 aa  171  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  38.87 
 
 
300 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  34.75 
 
 
311 aa  170  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  38.18 
 
 
296 aa  169  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  39.66 
 
 
283 aa  168  8e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  39.66 
 
 
283 aa  168  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  39.66 
 
 
283 aa  168  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  39.66 
 
 
283 aa  168  8e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>