More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0548 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1315  elongation factor Ts  98.6 
 
 
357 aa  722    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0548  elongation factor Ts  100 
 
 
357 aa  731    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1196  elongation factor Ts  98.6 
 
 
357 aa  721    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1093  elongation factor Ts  84.31 
 
 
358 aa  620  1e-177  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.569286  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1441  elongation factor Ts  68.17 
 
 
354 aa  503  1e-141  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1261  elongation factor Ts  69.3 
 
 
354 aa  484  1e-136  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00427037  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0407  translation elongation factor Ts  65.55 
 
 
355 aa  486  1e-136  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0550  elongation factor Ts  68.86 
 
 
348 aa  478  1e-134  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00242368  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0839  elongation factor Ts  62.82 
 
 
352 aa  431  1e-120  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0656173  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1801  elongation factor Ts  50.56 
 
 
350 aa  348  7e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.450992  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0106  elongation factor Ts  46.8 
 
 
346 aa  275  7e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1831  elongation factor Ts  47.01 
 
 
346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0135802  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2454  elongation factor Ts  45.04 
 
 
342 aa  263  3e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000114512  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0802  elongation factor Ts  46.11 
 
 
341 aa  263  4.999999999999999e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000434061  hitchhiker  0.00000000000000232724 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04070  elongation factor Ts  42.72 
 
 
321 aa  242  6e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1609  translation elongation factor Ts  42.81 
 
 
320 aa  237  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00132099  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0724  translation elongation factor Ts  41.59 
 
 
320 aa  227  3e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  38.1 
 
 
310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  37.95 
 
 
308 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  36.47 
 
 
311 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  38.53 
 
 
293 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  38.29 
 
 
307 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  38.76 
 
 
296 aa  206  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  37.95 
 
 
312 aa  206  6e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  37.36 
 
 
312 aa  205  8e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  40.62 
 
 
303 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  40.62 
 
 
303 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  37.57 
 
 
294 aa  203  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  36.84 
 
 
308 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  37.4 
 
 
308 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  35.98 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  35.59 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  35.41 
 
 
300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  34.27 
 
 
303 aa  194  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  36.34 
 
 
310 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  34.75 
 
 
307 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  35.89 
 
 
308 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  37.18 
 
 
285 aa  192  6e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  38.83 
 
 
291 aa  192  9e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  34.84 
 
 
307 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  37.46 
 
 
294 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  36.62 
 
 
285 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  37.68 
 
 
292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  37.18 
 
 
294 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  37.01 
 
 
310 aa  189  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  37.75 
 
 
292 aa  189  5.999999999999999e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  37.26 
 
 
309 aa  189  7e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl560  elongation factor Ts  35.29 
 
 
297 aa  189  8e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  37.46 
 
 
307 aa  188  1e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  35.41 
 
 
312 aa  188  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  35.73 
 
 
308 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  36.02 
 
 
286 aa  187  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  37.71 
 
 
293 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  35.07 
 
 
314 aa  186  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  37.71 
 
 
293 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  36.31 
 
 
291 aa  186  8e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  36.9 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  35.29 
 
 
292 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1265  elongation factor Ts  35.69 
 
 
291 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  34.65 
 
 
294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  36.11 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  35.38 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  35.38 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  34.84 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  36.9 
 
 
285 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  35.77 
 
 
283 aa  183  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  36.9 
 
 
285 aa  184  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  36.9 
 
 
285 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  35.77 
 
 
283 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  35.77 
 
 
283 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  35.77 
 
 
283 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  35.77 
 
 
283 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  35.77 
 
 
283 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  35.77 
 
 
283 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  35.77 
 
 
283 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  35.77 
 
 
283 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  35.77 
 
 
283 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  37.75 
 
 
292 aa  182  6e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  35.6 
 
 
308 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  34.93 
 
 
293 aa  181  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  32.96 
 
 
292 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  35.77 
 
 
283 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  35.77 
 
 
283 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  35.77 
 
 
283 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  34.52 
 
 
313 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4828  elongation factor Ts  39.73 
 
 
307 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0383674  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  35.77 
 
 
283 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  35.77 
 
 
283 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  38.03 
 
 
292 aa  182  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  37.99 
 
 
291 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  35.99 
 
 
308 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  33.98 
 
 
292 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  35.49 
 
 
283 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1231  elongation factor Ts  36.52 
 
 
275 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442239  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  33.8 
 
 
290 aa  180  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  35.59 
 
 
282 aa  180  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0673  translation elongation factor Ts  34.99 
 
 
292 aa  180  4e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  33.82 
 
 
290 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  34.25 
 
 
302 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  32.77 
 
 
291 aa  178  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>