More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0802 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0802  elongation factor Ts  100 
 
 		 341 aa  687    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000434061  hitchhiker  0.00000000000000232724 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1831  elongation factor Ts  69.88 
 
 		 346 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0135802  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0106  elongation factor Ts  67.65 
 
 		 346 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2454  elongation factor Ts  65.77 
 
 		 342 aa  418  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000114512  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0407  translation elongation factor Ts  47.35 
 
 		 355 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1093  elongation factor Ts  46.65 
 
 		 358 aa  295  9e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.569286  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1441  elongation factor Ts  45.92 
 
 		 354 aa  286  2e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  46.18 
 
 		 291 aa  281  2e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0839  elongation factor Ts  46.74 
 
 		 352 aa  279  6e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0656173  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0976  elongation factor Ts  44.41 
 
 		 292 aa  275  9e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120791  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0548  elongation factor Ts  46.11 
 
 		 357 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1315  elongation factor Ts  45.28 
 
 		 357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1196  elongation factor Ts  45.28 
 
 		 357 aa  269  4e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1261  elongation factor Ts  44.41 
 
 		 354 aa  265  8.999999999999999e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00427037  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0550  elongation factor Ts  44.73 
 
 		 348 aa  262  4.999999999999999e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00242368  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1801  elongation factor Ts  44.51 
 
 		 350 aa  262  4.999999999999999e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.450992  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  40.95 
 
 		 291 aa  247  2e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  45.43 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  44.15 
 
 		 293 aa  240  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  44.15 
 
 		 293 aa  240  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  43.07 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  42.48 
 
 		 294 aa  225  9e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  43.36 
 
 		 295 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  43.36 
 
 		 295 aa  222  8e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  43.36 
 
 		 295 aa  222  8e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  43.07 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  43.07 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  43.07 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  43.07 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  43.07 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  43.36 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04070  elongation factor Ts  41.82 
 
 		 321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  43.07 
 
 		 295 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  41.76 
 
 		 291 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1609  translation elongation factor Ts  41.34 
 
 		 320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00132099  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl560  elongation factor Ts  39.94 
 
 		 297 aa  219  7e-56  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  38.78 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0724  translation elongation factor Ts  44.17 
 
 		 320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  42.48 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  37.9 
 
 		 292 aa  210  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0372  elongation factor Ts  37.17 
 
 		 295 aa  209  7e-53  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  37.61 
 
 		 292 aa  208  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  37.35 
 
 		 292 aa  208  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  37.94 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  39.18 
 
 		 291 aa  202  7e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1432  elongation factor Ts  41.86 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  hitchhiker  0.00915816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2861  elongation factor Ts  41.86 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  40.94 
 
 		 291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1511  elongation factor Ts  41.57 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501204  normal  0.0222785 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  37.57 
 
 		 290 aa  200  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  39.23 
 
 		 294 aa  199  5e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  37.76 
 
 		 289 aa  199  5e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  38.6 
 
 		 292 aa  199  5e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  38.84 
 
 		 291 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1265  elongation factor Ts  38.64 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  37.5 
 
 		 292 aa  195  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf063  elongation factor Ts  36.64 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  37.68 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  38.42 
 
 		 310 aa  194  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  38.1 
 
 		 283 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  38.1 
 
 		 283 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  38.1 
 
 		 283 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  38.1 
 
 		 283 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  38.1 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  38.1 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  38.1 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  38.1 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  38.1 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  38.1 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  38.1 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  38.1 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  38.1 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  39.36 
 
 		 296 aa  192  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  36.14 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  38.14 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  36.92 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  37.8 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  39.77 
 
 		 285 aa  192  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  39.02 
 
 		 285 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  39.02 
 
 		 285 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  39.02 
 
 		 285 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  37.35 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  38.42 
 
 		 283 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3359  elongation factor Ts  37.54 
 
 		 283 aa  190  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461306  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  38.89 
 
 		 285 aa  189  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0390  elongation factor Ts  36.83 
 
 		 294 aa  189  7e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.432291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  38.17 
 
 		 292 aa  188  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  36.49 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  37.82 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  37.35 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  37.09 
 
 		 282 aa  187  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0351  elongation factor Ts  36.83 
 
 		 294 aa  187  3e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.556574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  38.03 
 
 		 308 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3052  elongation factor Ts  38.21 
 
 		 287 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.204992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  37.8 
 
 		 290 aa  186  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  35.8 
 
 		 292 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  36.17 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  37.1 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  36.8 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  35.8 
 
 		 292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>