More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1801 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1801  elongation factor Ts  100 
 
 		 350 aa  709    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.450992  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1441  elongation factor Ts  54.08 
 
 		 354 aa  384  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0407  translation elongation factor Ts  53.26 
 
 		 355 aa  374  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0550  elongation factor Ts  52.15 
 
 		 348 aa  353  2e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00242368  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1261  elongation factor Ts  50.42 
 
 		 354 aa  347  2e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00427037  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1315  elongation factor Ts  51.69 
 
 		 357 aa  342  7e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1196  elongation factor Ts  51.4 
 
 		 357 aa  341  1e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1093  elongation factor Ts  49.58 
 
 		 358 aa  339  5e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.569286  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0548  elongation factor Ts  50.56 
 
 		 357 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0839  elongation factor Ts  49.16 
 
 		 352 aa  333  4e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0656173  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04070  elongation factor Ts  44.01 
 
 		 321 aa  247  3e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0802  elongation factor Ts  45.35 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000434061  hitchhiker  0.00000000000000232724 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0106  elongation factor Ts  43.1 
 
 		 346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1831  elongation factor Ts  44.22 
 
 		 346 aa  232  7.000000000000001e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0135802  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2454  elongation factor Ts  45.04 
 
 		 342 aa  227  2e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000114512  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1609  translation elongation factor Ts  41.79 
 
 		 320 aa  226  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00132099  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0724  translation elongation factor Ts  45.87 
 
 		 320 aa  225  8e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  36.87 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  37.43 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  34.19 
 
 		 311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  37.08 
 
 		 296 aa  195  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  37.25 
 
 		 307 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  37.57 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  37.85 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  35.67 
 
 		 308 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  35.53 
 
 		 307 aa  182  6e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  36.24 
 
 		 308 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl560  elongation factor Ts  36.52 
 
 		 297 aa  182  8.000000000000001e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  35.85 
 
 		 307 aa  182  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  36.23 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  35.14 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  35.39 
 
 		 308 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  35.33 
 
 		 300 aa  179  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  33.98 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  34.93 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  33.14 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  34.28 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  34.87 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  36.24 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  33.99 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0976  elongation factor Ts  35.77 
 
 		 292 aa  178  2e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120791  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  34.28 
 
 		 292 aa  177  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  36.34 
 
 		 303 aa  177  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  35.59 
 
 		 291 aa  177  4e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  36.08 
 
 		 292 aa  176  6e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  38.76 
 
 		 294 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  33.8 
 
 		 294 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  35.2 
 
 		 299 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  37.97 
 
 		 290 aa  172  5.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  35.77 
 
 		 292 aa  172  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  34.35 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  34.55 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  34.66 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  34.86 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1265  elongation factor Ts  36.52 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  34.86 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  34.55 
 
 		 308 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  36.94 
 
 		 291 aa  169  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  35.51 
 
 		 301 aa  169  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  33.99 
 
 		 307 aa  169  6e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  33.14 
 
 		 292 aa  169  7e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  37.75 
 
 		 292 aa  169  8e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  38.03 
 
 		 295 aa  169  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1273  elongation factor Ts  34.01 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00309579  normal  0.676189 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  33.83 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2861  elongation factor Ts  37.95 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1432  elongation factor Ts  37.95 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  hitchhiker  0.00915816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  33.05 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  34.56 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  35.84 
 
 		 285 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  38.03 
 
 		 295 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  37.46 
 
 		 294 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  37.75 
 
 		 295 aa  166  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  37.46 
 
 		 295 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  35.88 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  35.88 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  37.96 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  34.73 
 
 		 312 aa  166  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  37.96 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1511  elongation factor Ts  37.4 
 
 		 298 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501204  normal  0.0222785 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  37.18 
 
 		 295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  37.18 
 
 		 295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  37.18 
 
 		 295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  37.18 
 
 		 295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  37.18 
 
 		 295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1535  translation elongation factor Ts  35.23 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  33.71 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  36.62 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  36.62 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1370  elongation factor Ts  36.93 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  32.5 
 
 		 314 aa  162  6e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1959  elongation factor Ts  36.36 
 
 		 308 aa  162  7e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  33.33 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  36.23 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  35.55 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  33.8 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  35.17 
 
 		 294 aa  160  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1344  elongation factor Ts  34.67 
 
 		 287 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  34.78 
 
 		 285 aa  159  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  34.64 
 
 		 290 aa  159  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>